Merge pull request #519 in SNORT/snort3 from nhttp46 to master

Squashed commit of the following:

commit b0b0ceffa796e2ee7e0538edcdeb994db8abdfe4
Author: Tom Peters <thopeter@cisco.com>
Date:   Thu Jun 16 11:42:29 2016 -0400

    code review fix

commit aa9e862c5c243d3cda48c6af893c55b074acb8f1
Author: Tom Peters <thopeter@cisco.com>
Date:   Mon Jun 13 12:12:37 2016 -0400

    NHI peg counts

Merge pull request #518 in SNORT/snort3 from appid_ws2_plugins to master

Squashed commit of the following:

commit ef92a3c83ddd737d29f044c2d8f70098a81f8574
Merge: f05eab5 a77a7f0
Author: davis mcpherson <davis.mcpherson@gmail.com>
Date:   Wed Jun 15 13:10:13 2016 -0400

    Merge branch 'appid_ws2_plugins' of ssh://bitbucket-eng-rtp1.cisco.com:7999/snort/snort3 into appid_ws2_plugins

commit f05eab50c2d9853be3e73d7cc39fa469e167d8b9
Author: davis mcpherson <davis.mcpherson@gmail.com>
Date:   Wed Jun 15 13:10:07 2016 -0400

    fix issues identified by static analysis, mostly vars unused after assignment

commit a77a7f045c86c280188f49abe65ac065887cd1e9
Author: Steve Chew <stechew@cisco.com>
Date:   Wed Jun 15 11:44:44 2016 -0400

    Added stats for ftp and telnet service plugins.

commit 2fa8f24420d27c3fecbc0b8c37109fbacbe2d8d1
Author: Steve Chew <stechew@cisco.com>
Date:   Wed Jun 15 10:48:41 2016 -0400

    Added counts for ftp and telnet.

fix cmake make check

Merge branch 'appid_cmake_ut_patch' of https://bitbucket-eng-rtp1.cisco.com/bitbucket/scm/snort/snort3 into appid

Merge pull request #520 in SNORT/snort3 from ~MIALTIZE/snort3:for-russ-trivial to master

Squashed commit of the following:

commit b39468d96c0a99284bf313ecef7d8208d5fc0d23
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Wed Jun 15 17:22:22 2016 -0400

    cmake: Fix reentrancy of FindDNET.cmake

appid unit test are not functional yet, #ifdef out unused code so build is clean

Merge pull request #515 in SNORT/snort3 from ~MIALTIZE/snort3:hardening to master

Squashed commit of the following:

commit 663bad556621beaea3b22d1880cb3fb7466455f0
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Tue Jun 14 16:20:03 2016 -0400

    autotools: Make sure to check headers when searching for OpenSSL crypto support

commit da44da7dcb6872062443484a4a65254a033901fb
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Tue Jun 14 14:37:17 2016 -0400

    cmake: Remove unused COMPILE_DEFINITIONS definition during generation.

commit a4da96fc1b6a9a0154bcd7490688f057f81cd158
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Mon Jun 13 19:16:42 2016 -0400

    build: Remove PCRE version check - 6.0 was released over 11 years ago

commit 650e05b79e31c66297742dddf3dbf53d4b35d5fa
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Mon Jun 13 19:08:37 2016 -0400

    build: Remove useless references to PF_RING libpcap

commit 015daa118d6017d6fef952d4604f50f3c049995a
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Mon Jun 13 15:22:39 2016 -0400

    cmake: Clean up OpenSSL libcrypto detection and usage

commit 4e5968d7de913d0dc83ad4cad80dd26d4c60d515
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Mon Jun 13 14:53:48 2016 -0400

    cmake: Clean up libpcre detection and fix hints

commit eb9acf119295d91d55b43976710ecf79d397d7a3
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Mon Jun 13 14:34:59 2016 -0400

    cmake: Clean up libdnet/libdumbnet detection and fix hints

commit 2e31690d17925123050f1fb05f4be1f12a197ab0
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Mon Jun 13 14:18:35 2016 -0400

    cmake: Clean up LuaJIT detection and let it use pkg-config

commit b2700b472758617d3444a4fa35b45d5e4eb85ce3
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Mon Jun 13 13:31:00 2016 -0400

    cmake: Add compile-time hardening support and clean up inconsistencies

commit 5192bea466e15ac7c0e127d1af9ff89a6047a775
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Mon Jun 13 13:30:41 2016 -0400

    autotools: Add compile-time hardening support

Merge pull request #514 in SNORT/snort3 from smb_nttransact to master

Squashed commit of the following:

commit 1a53bc5971689cac0a4f3fad2bd4a1afc11e0f7c
Author: mdagon <mdagon@cisco.com>
Date:   Mon Jun 13 12:27:39 2016 -0400

    Code review: remove empty line, spaces

commit 8849e7e0d7d7e8e93f3de197a7b5ebf4af16bcde
Author: mdagon <mdagon@cisco.com>
Date:   Fri Jun 10 16:21:18 2016 -0400

    Smb NTtransact processing port

Merge pull request #517 in SNORT/snort3 from appid_port_ws1_merge_this to master

Squashed commit of the following:

commit b53b7f1d5e5c5249515b25b7db35f65cdbeebe71
Author: davis mcpherson <davis.mcpherson@gmail.com>
Date:   Thu Jun 9 11:50:39 2016 -0400

    initial prep work to port appid to snort++
    initial work to get dns/smtp detectors working and cleanup of many issues left from initial prep of appid
    search tool unit tests
    Moved AM_CPPFLAGS change into appid specific Makefile.am files.
    fixed compiler warnings
    fixed formating issues, misc minor code review nits
    Fix cmake problems and warnings.
    use REMOVED_WHILE_NOT_IN_USE for all code #ifdef'ed out for porting issues
    change patterns defined by const char* to const char array
    init net_list_by_zone array to 0
    initialize all array member variables to nullptr
    initial net list by zone array to nullptr
    free memory allocated by snort_strdup for module config strings
    AppIdModuleConfig is now a class not a struct
    for now use snort_free instead of delete
    no defaults for appid detector dir and thirdparty dir
    init member variables for AppIdData
    free memory allocated for AppIdData member variables
    initialize ALL member variables of AppIdData class
    move functions called to free memory in AppIdData to the AppIdData class
    source formating issue, fix type mismatch on debug print specifier for IpProtocol

Merge pull request #513 in SNORT/snort3 from obfuscator_test_fix to master

Squashed commit of the following:

commit fe083f26df18ae94968dcca1e8f5017d4329922a
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Thu Jun 9 18:57:27 2016 -0400

    Fix Test_{1,2,3}_Block tests.
    Add Test_3_Block_with_Gaps

Merge pull request #511 in SNORT/snort3 from fix-bad-cpputest-include-order to master

Squashed commit of the following:

commit cfb46ee859ee2c18a747190f632cd61699c0382b
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Thu Jun 9 13:18:24 2016 -0400

    Fix unit-tests that do not compile on OSX

Merge pull request #512 in SNORT/snort3 from sanitizer_fixes to master

Squashed commit of the following:

commit 5dac9c793f7aa0c8c8cbd9b93186b6fd629466ea
Author: Bhagya Tholpady <bbantwal@cisco.com>
Date:   Thu Jun 9 15:11:33 2016 -0400

    moving memset to ratefilter begin per review comments

commit 050a5fd1aa3a0ed41b5597406c8a38f25f9aa5d6
Author: Bhagya Tholpady <bbantwal@cisco.com>
Date:   Thu Jun 9 14:11:27 2016 -0400

    fixes for sanitizer leaks

commit 0571da6f611cc5bfb20a4027eb489fe9841aa180
Merge: 16e99a6 6f62bd4
Author: Bhagya Tholpady <bbantwal@cisco.com>
Date:   Thu Jun 9 14:02:31 2016 -0400

    Merge branch 'master' of https://stash-eng-rtp1.cisco.com/stash/scm/snort/snort3

commit 16e99a65877eed3aa82597a07b9331f6e2b37564
Author: Bhagya Tholpady <bbantwal@cisco.com>
Date:   Wed Jun 8 12:21:06 2016 -0400

    Adding call to release scripts

fix build

Merge pull request #509 in SNORT/snort3 from util_1 to master

Squashed commit of the following:

commit b1220722795dcfaf6e1d3aef28741eed7279a88e
Author: allewi <allewi@cisco.com>
Date:   Wed Jun 8 18:33:11 2016 -0400

    changed format

commit d1bc4cbd6164adabfe40fae4fabf5a93f784a5dd
Author: allewi <allewi@cisco.com>
Date:   Wed Jun 8 18:28:33 2016 -0400

    changed format

commit 9adbffda384a177e36f9143b46ec2c56e7bdf666
Author: allewi <allewi@cisco.com>
Date:   Wed Jun 8 18:24:20 2016 -0400

    changed format

Merge pull request #507 in SNORT/snort3 from ~MIALTIZE/snort3:for-russ-trivial to master

Squashed commit of the following:

commit f17556d34c5ef087e95a99b30708d9ec8910166e
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Wed Jun 8 16:44:08 2016 -0400

    extra: Make autotools build quiet again and remove extraneous semicolon.

commit c6ee6b94802b40a31d915e8ce801694a0bd5c845
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Wed Jun 8 16:38:14 2016 -0400

    flow: Clarify key hashing function

commit f671d582019fa905ca8fc4419d9a787512259b2d
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Wed Jun 8 16:37:43 2016 -0400

    dce_rpc: Fix missing prototype compiler warnings

commit dd24d4b4ebbd12466557624164d24e6c7c3e2548
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Tue Jun 7 15:20:03 2016 -0400

    ftp_telnet: Clean up includes

commit fbfc06f05247d53d9aa6f15e3191e6eb3c4f3bdd
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Tue Jun 7 14:00:10 2016 -0400

    autotools: Remove GCC version check as C++11 macro is sufficient

Merge pull request #508 in SNORT/snort3 from fix-configure-header to master

Squashed commit of the following:

commit d5adc1842730130691cbef79844ea1aaef153f1c
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Wed Jun 8 17:33:58 2016 -0400

    Include correct stl container
    Update configure.ac dependencies note

Merge pull request #505 in SNORT/snort3 from lua_test_fix to master

Squashed commit of the following:

commit 16e99a65877eed3aa82597a07b9331f6e2b37564
Author: Bhagya Tholpady <bbantwal@cisco.com>
Date:   Wed Jun 8 12:21:06 2016 -0400

    Adding call to release scripts

Merge pull request #500 in SNORT/snort3 from smb_transaction2 to master

Squashed commit of the following:

commit 30a398705ca705292abe496cf092aa5aa0d3e359
Author: mdagon <mdagon@cisco.com>
Date:   Tue Jun 7 17:54:09 2016 -0400

    Split dce_smb.cc file into dce_smb_utils and dce_smb_commands

commit 1fb123c061f454dad830ff05653b01b4db15b6f6
Author: mdagon <mdagon@cisco.com>
Date:   Mon Jun 6 15:09:51 2016 -0400

    Remove unused inline functions

commit 73422170b8ca03790f442734a08c5b89f98f94ea
Author: mdagon <mdagon@cisco.com>
Date:   Fri Jun 3 09:51:34 2016 -0400

    Port dce smb transaction2 processing

Merge pull request #501 in SNORT/snort3 from ~MIALTIZE/snort3:for-russ-trivial to master

Squashed commit of the following:

commit 723a7c750b9842682a6f02ed9816b82afec1d138
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Tue Jun 7 13:52:45 2016 -0400

    autotools: Update with recommended best practices

Merge pull request #495 in SNORT/snort3 from ha-sc to master

Squashed commit of the following:

commit 430c1bd63459e8d2815c0d532af12278d865a07a
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Mon Jun 6 11:34:27 2016 -0400

    Added stub for snort_strdup()

commit b0d605d273a4444c22a681aa675a31ef39bc09c4
Merge: 43a60e0 6641e05
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Mon Jun 6 11:16:13 2016 -0400

    Merge branch 'ha-sc' of https://bitbucket-eng-rtp1.cisco.com/bitbucket/scm/snort/snort3 into ha-sc

commit 6641e058727b4dad60b7e7fb476868df3dfb4f3a
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 31 15:12:25 2016 -0400

    Fix problem with udp_ha.

commit d58771e037cc54905f5244534d3c0f0d1c3fddb9
Merge: 518749e dc34515
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Thu May 26 07:47:39 2016 -0400

    Merge branch 'ha-sc' of https://bitbucket-eng-rtp1.cisco.com/bitbucket/scm/snort/snort3 into ha-sc

commit 518749e07afe7a3532c223c70faa5001f024cc24
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 25 16:21:55 2016 -0400

    Additional HA UT's and additional stream HA capabiity.

commit dc3451510b5d261c1188a7d57f98b42c18ddd20b
Merge: 022b844 5e0a5bb
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 25 16:23:59 2016 -0400

    Merge branch 'ha-sc' of https://bitbucket-eng-rtp1.cisco.com/bitbucket/scm/snort/snort3 into ha-sc

    Conflicts:
     src/flow/ha.cc

commit 022b8440807ae03c857307e1ce252253a7e4d45b
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 25 16:21:55 2016 -0400

    Additional HA UT's and additional stream HA capabiity.

commit 5e0a5bb14097eb2a3d1ab4e53c7335585afb1699
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Thu May 19 10:36:05 2016 -0400

    Fix a memory leak in the Flow object regarding the ha_state.

commit 02bc6738393e253473f57c6b1367e0fd982ac033
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 18 09:15:29 2016 -0400

    Fix mem leak issue in UT.

commit d44d4c3631b90a7a136810ac137033d8fe72115e
Merge: 9a643a8 b2f8cf7
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 18 07:57:29 2016 -0400

    Merge branch 'ha-sc' of https://bitbucket-eng-rtp1.cisco.com/bitbucket/scm/snort/snort3

commit b2f8cf7996253e13761d0ec773400a41e14c4b47
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 17 15:02:59 2016 -0400

    A few small code review fixes.

commit b903d32fe80c4a4f19e80145a420696716cdd535
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Fri May 6 10:07:21 2016 -0400

    Fix a compile warning.

commit bfbd5abccc7a79b3283430a3307ae3402517953d
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Fri May 6 09:28:29 2016 -0400

    Forgot to add the file_connector_module_test to cmake

commit a99fb124eeae1e6d52f40a6217cbe61f4ada4a00
Merge: 08612c6 fe16e75
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Thu May 5 14:10:32 2016 -0400

    Merge branch 'ha-sc' of https://bitbucket-eng-rtp1.cisco.com/bitbucket/scm/snort/snort3 into ha-sc

commit 08612c66de9c1750015fcbd1033661931bcda05e
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Thu May 5 14:08:35 2016 -0400

    UT's for file_connector.

commit 2c5d4c13e44a644572e012e593e72ebe3d2b2b59
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 4 10:07:52 2016 -0400

    Fixed test stubs to eliminate memory leaks.

commit cc50492ed3d0f1ef5ded6ffcf3bedc238f7e9e4b
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 15:06:02 2016 -0400

    Makefile.am cosmetic changes.

commit 03ff7b57fde7dd0ac747ed2f04707aefed0e6da9
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 13:00:14 2016 -0400

    Remove extraneous stuff.

commit 6b73c2c7ec76339f974875a6aa0f41825f70ea5d
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 10:53:29 2016 -0400

    Additional UT's for side_channel.

commit fe16e7515225e59e75c6a975262d99260a1235b1
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 4 10:07:52 2016 -0400

    Fixed test stubs to eliminate memory leaks.

commit 67dec135d68701f4e12e4eeb94a6b8d86ac85afb
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 15:06:02 2016 -0400

    Makefile.am cosmetic changes.

commit b83d121adaed4f6118b14319f6ce2d0dfc46d4f6
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 13:00:14 2016 -0400

    Remove extraneous stuff.

commit 0f903af76892e136b3a86ff538f8bbd5858ba0a6
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 10:53:29 2016 -0400

    Additional UT's for side_channel.

fix static analysis issues

Merge pull request #499 in SNORT/snort3 from build_199 to master

Squashed commit of the following:

commit a68639da5f58501b492c5e6f3c0f74cd6298b85b
Author: snorty <snorty@localhost.localdomain>
Date:   Fri Jun 3 13:51:57 2016 -0400

    build 199, fix warnings

Merge pull request #498 in SNORT/snort3 from mask_output to master

Squashed commit of the following:

commit b1dcbe2bf95cb19a7198f0081c9b270e0fd384da
Merge: 245f606 58d0670
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Thu Jun 2 16:49:22 2016 -0400

    Merge branch 'mask_output' of ssh://bitbucket-eng-rtp1.cisco.com:7999/snort/snort3 into mask_output

commit 245f606dc0fa084268348c818df93ac27a51ead1
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Wed Jun 1 16:20:53 2016 -0400

    Add output configuration "obfuscate_pii" for SDF.

commit 58d067063eb8f0b325e79debdde0521658e40b43
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Thu Jun 2 15:32:33 2016 -0400

    Fix uninitialized value

commit 9d45cc73e356dee068e3d692b4f18b41709ed188
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Wed Jun 1 16:20:53 2016 -0400

    Add output configuration "obfuscate_pii" for SDF.

Merge pull request #475 in SNORT/snort3 from ~MIALTIZE/snort3:unprivileged to master

Squashed commit of the following:

commit a45424a74c8ebcef1862fc8ad2fcebc436c67c84
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Thu Jun 2 16:03:35 2016 -0400

    connectors: Add CppUTest CPPFLAGS to file_connector_module_test build

commit 7304302f6ba0ff6dd52343b67e17b13a2f7696f1
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Thu Jun 2 15:50:51 2016 -0400

    debug: Enable argument checking for DebugFormat and fix most fallout

commit 3f67a139df7978e00c7901e88a58ef19b05d1380
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Wed Jun 1 13:14:52 2016 -0400

    unprivileged: Initial privilege dropping support

commit be6e4d1591a323e5cf59c4666a6869d08dfbd84c
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Tue May 31 15:56:16 2016 -0400

    extra: Fix CPPFLAGS variable expansion and add m4 directory

commit 1985958afa96b634dc9a7cdc312a21c61e2774de
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Thu May 19 12:13:20 2016 -0400

    sfdaq: Remove reference to daq-mode option

commit 92efb5a5a3bfba1c9a8c8074d1f150d51ceb7687
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Wed May 18 12:48:29 2016 -0400

    packet_capture: Fix compiler warnings

commit f182c36194e63a0871e9c42f233b8dbc05a7666a
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Tue May 10 18:21:47 2016 -0400

    Remove unnecessary utils/stats.h includes

commit 5b278b811793511b732d6549eb447429968d29e5
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Mon May 9 12:32:12 2016 -0400

    Remove unnecessary analyzer.h includes

Merge pull request #480 in SNORT/snort3 from capture_dynamic to master

Squashed commit of the following:

commit f7fc67864687018236d81eca978adace0ecccd8e
Author: Carter Waxman <cwaxman@cisco.com>
Date:   Wed Jun 1 15:26:25 2016 -0400

    fixed bracket

commit d60fc658c497e423c9e4fd9904f77d6be428e917
Author: Carter Waxman <cwaxman@cisco.com>
Date:   Wed Jun 1 13:40:54 2016 -0400

    fixed AC_CHECK_LIBS

commit 0d127ff7ac711e2c8a53701fb57052459fa8b677
Author: Carter Waxman <cwaxman@cisco.com>
Date:   Wed Jun 1 12:04:10 2016 -0400

    removed --with-sfbpf* from cmake

commit 6aa83eafee31d63f6cef2ca433665444e4cebdac
Author: Carter Waxman <cwaxman@cisco.com>
Date:   Wed Jun 1 11:59:44 2016 -0400

    removed --with-sfbpf* from autoconf

commit 64a6b63402d4692358255c7755d7a65cc3318c02
Author: Carter Waxman <cwaxman@cisco.com>
Date:   Thu May 19 13:55:30 2016 -0400

    added options to configure_cmake.sh

commit ccee25d27c657a93c2f358d1e86367ef8c6683e7
Author: Carter Waxman <cwaxman@cisco.com>
Date:   Thu May 19 13:16:33 2016 -0400

    fixed autoconf bpf checks

commit ca39485171e73e783a9b464e0bbb46312a19d1fa
Author: Carter Waxman <cwaxman@cisco.com>
Date:   Thu May 19 10:58:17 2016 -0400

    added sfbpf linkage to autoconf

commit 5d3fb7d10950a97811f1e5bb237a2450edbb9d2e
Author: Carter Waxman <cwaxman@cisco.com>
Date:   Thu May 19 10:50:59 2016 -0400

    added sfbpf linkage to autoconf

commit fb24c868614e62030c8211d4ce9bd2cf3d5963ac
Author: Carter Waxman <cwaxman@cisco.com>
Date:   Thu May 19 10:46:42 2016 -0400

    added sfbpf linkage to autoconf

commit 5fc81a03f5c36c653dcc12eab2b62cc82e1c88eb
Author: Carter Waxman <cwaxman@cisco.com>
Date:   Wed May 18 15:20:40 2016 -0400

    added sfbpf linkage to cmake

commit e30157012baa15697cc7a219626ea76160456751
Author: Carter Waxman <cwaxman@cisco.com>
Date:   Wed May 18 15:20:27 2016 -0400

    added sfbpf linkage to cmake

Merge pull request #488 in SNORT/snort3 from memory_and_fixits to master

Squashed commit of the following:

commit 5f3e746d806428104a3632e0be7f88372b185438
Author: Russ Combs <rucombs@cisco.com>
Date:   Thu May 26 18:29:57 2016 -0400

    remove xmalloc and additional review updates

commit e067f738d1f49608d8419b25480b44e474f8aca7
Author: Russ Combs <rucombs@cisco.com>
Date:   Fri May 20 21:06:47 2016 -0400

    fixup fixits and other minor tweaks
    convert c style (void) args to c++ style ()
    wrap free() in snort_free() for cutover to delete
    wrap malloc()/calloc() in snort_alloc()/snort_calloc() for cutover to new
    convert SnortAlloc() to snort_calloc() for cutover to new
    cutover to new / delete for tracking and cap enforcement
    convert SnortStrdup() to snort_strdup()
    remove obsolete checks for failed allocations
    remove extraneous memsets
    remove Memcap and associated config

Merge pull request #483 in SNORT/snort3 from sd_pattern-fix to master

Squashed commit of the following:

commit 227c739765aac5c7c87bbd9a86976c845dab8488
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Thu May 19 15:57:56 2016 -0400

    Add new boundary matching pattern "\b"

Merge pull request #493 in SNORT/snort3 from nhttp45 to master

Squashed commit of the following:

commit 83b84059b9d7c5a442b06fe39ea0e3f173588bd4
Author: Tom Peters <thopeter@cisco.com>
Date:   Mon May 23 13:28:07 2016 -0400

    NHI alerts for abusive CL or TE

Merge pull request #497 in SNORT/snort3 from smb_warning to master

Squashed commit of the following:

commit 26f217baad0910709cb96c6c3b7d4d146e86a5e2
Author: mdagon <mdagon@cisco.com>
Date:   Fri May 27 09:04:23 2016 -0400

    Fix dce_smb.cc warnings

build 198

Merge pull request #496 in SNORT/snort3 from ~MIALTIZE/snort3:for-russ-trivial to master

Squashed commit of the following:

commit 90ba993f719096cd2683ae396a576ced67566d4f
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Thu May 26 19:12:01 2016 -0400

    sfdaq: Fix module unit test index usage

Merge pull request #485 in SNORT/snort3 from dce_smb to master

Squashed commit of the following:

commit 4f07d0b1f5c6d2fc5347c880272d44634fdfdecf
Author: mdagon <mdagon@cisco.com>
Date:   Wed May 25 13:07:13 2016 -0400

    Code review comments - fix for attr read only

commit 2e7b4d50df5f194872ec774c0fdda7b26f256601
Author: mdagon <mdagon@cisco.com>
Date:   Wed May 25 10:23:06 2016 -0400

    Code review: delete #if 0

commit 6a89d70677259c72296cb984cce4b89f8cb371df
Author: mdagon <mdagon@cisco.com>
Date:   Tue May 24 16:17:27 2016 -0400

    Code review comments: remove WIN32

commit d3b22b60cd0c820ca9a887d4948998aedd0e86a6
Author: mdagon <mdagon@cisco.com>
Date:   Mon May 23 04:12:18 2016 -0400

    1. Ported large portion of smb header processing, including required infrastructure.
    2. Replaced usage of ntohs, ntohl with smb version (now in packet.h).

Merge pull request #482 in SNORT/snort3 from file_type_ips to master

Squashed commit of the following:

commit 0ee7abae1918f2c5bf73e411a1ed77f8d2e68249
Author: huica <huica@cisco.com>
Date:   Wed May 25 09:01:16 2016 -0400

    Change cursor type

commit 46a53bc84c40fe82adc07096a7018430148fd393
Merge: d49abab f423c7b
Author: huica <huica@cisco.com>
Date:   Wed May 25 08:59:26 2016 -0400

    Merge branch 'master' of https://bitbucket-eng-rtp1.cisco.com/bitbucket/scm/snort/snort3.git into capture

commit d49abab562d510ba1b6a652ae01f7667d5362e7a
Author: huica <huica@cisco.com>
Date:   Fri May 20 13:51:33 2016 -0400

    change it to dynamic

commit 5f2cdc6ae315d494c0c58fca3241d8198e257ca2
Author: huica <huica@cisco.com>
Date:   Fri May 20 11:39:30 2016 -0400

    File type rule options

Merge pull request #494 in SNORT/snort3 from fix-stuff to master

Squashed commit of the following:

commit 60dd7d952631d56b25b2d8d82b7c7148bf4baf4b
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Wed May 25 17:29:12 2016 -0400

    Mess up Russ's pull request.

commit a3b83d87b93f8977d4fee400d9943485552770b2
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Wed May 25 17:12:40 2016 -0400

    Fix failing unit tests

Merge pull request #492 in SNORT/snort3 from perf_seg to master

Squashed commit of the following:

commit e3b1088fe97bde6220cbaa7cbca9c09c668aedb7
Author: Carter Waxman <cwaxman@cisco.com>
Date:   Wed May 25 15:23:07 2016 -0400

    fixed perf idle segfault

Merge pull request #489 in SNORT/snort3 from ~MIALTIZE/snort3:snort2lua to master

Squashed commit of the following:

commit 5c2f5c73a956b4da8513e32bfb72dbdafdedd56e
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Tue May 24 18:42:42 2016 +0000

    snort2lua: Allow for case-insensitive preprocessor keyword matching

Merge pull request #487 in SNORT/snort3 from ~MIALTIZE/snort3:for-russ-trivial to master

Squashed commit of the following:

commit 8b44097a7d6531e273a7dc20963712a4f4f77dc2
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Tue May 24 00:23:20 2016 +0000

    sfdaq: Fix memory leak in module per-instance configuration

commit a7681dfc7f788c5753f0962fed419e25c06410bd
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Tue May 24 00:08:52 2016 +0000

    sfdaq: Fix incorrectly overwriting last per-instance config

Merge pull request #481 in SNORT/snort3 from packet-struct to master

Squashed commit of the following:

commit 59def90162924e1037a0f52e6ed12d6133a53219
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Thu May 19 15:10:42 2016 -0400

    Add ctor/dtor to packet and cleanup packet_manager.

Merge pull request #479 in SNORT/snort3 from ha-sc to master

Squashed commit of the following:

commit 5e0a5bb14097eb2a3d1ab4e53c7335585afb1699
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Thu May 19 10:36:05 2016 -0400

    Fix a memory leak in the Flow object regarding the ha_state.

commit 02bc6738393e253473f57c6b1367e0fd982ac033
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 18 09:15:29 2016 -0400

    Fix mem leak issue in UT.

commit d44d4c3631b90a7a136810ac137033d8fe72115e
Merge: 9a643a8 b2f8cf7
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 18 07:57:29 2016 -0400

    Merge branch 'ha-sc' of https://bitbucket-eng-rtp1.cisco.com/bitbucket/scm/snort/snort3

commit b2f8cf7996253e13761d0ec773400a41e14c4b47
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 17 15:02:59 2016 -0400

    A few small code review fixes.

commit b903d32fe80c4a4f19e80145a420696716cdd535
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Fri May 6 10:07:21 2016 -0400

    Fix a compile warning.

commit bfbd5abccc7a79b3283430a3307ae3402517953d
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Fri May 6 09:28:29 2016 -0400

    Forgot to add the file_connector_module_test to cmake

commit a99fb124eeae1e6d52f40a6217cbe61f4ada4a00
Merge: 08612c6 fe16e75
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Thu May 5 14:10:32 2016 -0400

    Merge branch 'ha-sc' of https://bitbucket-eng-rtp1.cisco.com/bitbucket/scm/snort/snort3 into ha-sc

commit 08612c66de9c1750015fcbd1033661931bcda05e
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Thu May 5 14:08:35 2016 -0400

    UT's for file_connector.

commit 2c5d4c13e44a644572e012e593e72ebe3d2b2b59
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 4 10:07:52 2016 -0400

    Fixed test stubs to eliminate memory leaks.

commit cc50492ed3d0f1ef5ded6ffcf3bedc238f7e9e4b
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 15:06:02 2016 -0400

    Makefile.am cosmetic changes.

commit 03ff7b57fde7dd0ac747ed2f04707aefed0e6da9
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 13:00:14 2016 -0400

    Remove extraneous stuff.

commit 6b73c2c7ec76339f974875a6aa0f41825f70ea5d
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 10:53:29 2016 -0400

    Additional UT's for side_channel.

commit fe16e7515225e59e75c6a975262d99260a1235b1
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 4 10:07:52 2016 -0400

    Fixed test stubs to eliminate memory leaks.

commit 67dec135d68701f4e12e4eeb94a6b8d86ac85afb
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 15:06:02 2016 -0400

    Makefile.am cosmetic changes.

commit b83d121adaed4f6118b14319f6ce2d0dfc46d4f6
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 13:00:14 2016 -0400

    Remove extraneous stuff.

commit 0f903af76892e136b3a86ff538f8bbd5858ba0a6
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 10:53:29 2016 -0400

    Additional UT's for side_channel.

Merge pull request #478 in SNORT/snort3 from obfuscator-fix-asan to master

Squashed commit of the following:

commit 2615e341ddccff7506c341d416a77f58ce9ea3d7
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Wed May 18 16:24:38 2016 -0400

    Fix memory leak

commit 00399aa838a1978ddaa605e21a8a4a91b6d6a782
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Wed May 18 16:22:33 2016 -0400

    Fix memory leak

Merge pull request #477 in SNORT/snort3 from ~MIALTIZE/snort3:for-russ-trivial to master

Squashed commit of the following:

commit dc9d3b68c909b7e76465ea34e4e4a576b300b2c8
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Wed May 18 12:42:24 2016 -0400

    obfuscator: Add missing includes

Merge pull request #476 in SNORT/snort3 from ha-sc to master

Squashed commit of the following:

commit 02bc6738393e253473f57c6b1367e0fd982ac033
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 18 09:15:29 2016 -0400

    Fix mem leak issue in UT.

commit d44d4c3631b90a7a136810ac137033d8fe72115e
Merge: 9a643a8 b2f8cf7
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 18 07:57:29 2016 -0400

    Merge branch 'ha-sc' of https://bitbucket-eng-rtp1.cisco.com/bitbucket/scm/snort/snort3

commit b2f8cf7996253e13761d0ec773400a41e14c4b47
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 17 15:02:59 2016 -0400

    A few small code review fixes.

commit b903d32fe80c4a4f19e80145a420696716cdd535
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Fri May 6 10:07:21 2016 -0400

    Fix a compile warning.

commit bfbd5abccc7a79b3283430a3307ae3402517953d
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Fri May 6 09:28:29 2016 -0400

    Forgot to add the file_connector_module_test to cmake

commit a99fb124eeae1e6d52f40a6217cbe61f4ada4a00
Merge: 08612c6 fe16e75
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Thu May 5 14:10:32 2016 -0400

    Merge branch 'ha-sc' of https://bitbucket-eng-rtp1.cisco.com/bitbucket/scm/snort/snort3 into ha-sc

commit 08612c66de9c1750015fcbd1033661931bcda05e
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Thu May 5 14:08:35 2016 -0400

    UT's for file_connector.

commit 2c5d4c13e44a644572e012e593e72ebe3d2b2b59
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 4 10:07:52 2016 -0400

    Fixed test stubs to eliminate memory leaks.

commit cc50492ed3d0f1ef5ded6ffcf3bedc238f7e9e4b
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 15:06:02 2016 -0400

    Makefile.am cosmetic changes.

commit 03ff7b57fde7dd0ac747ed2f04707aefed0e6da9
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 13:00:14 2016 -0400

    Remove extraneous stuff.

commit 6b73c2c7ec76339f974875a6aa0f41825f70ea5d
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 10:53:29 2016 -0400

    Additional UT's for side_channel.

commit fe16e7515225e59e75c6a975262d99260a1235b1
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 4 10:07:52 2016 -0400

    Fixed test stubs to eliminate memory leaks.

commit 67dec135d68701f4e12e4eeb94a6b8d86ac85afb
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 15:06:02 2016 -0400

    Makefile.am cosmetic changes.

commit b83d121adaed4f6118b14319f6ce2d0dfc46d4f6
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 13:00:14 2016 -0400

    Remove extraneous stuff.

commit 0f903af76892e136b3a86ff538f8bbd5858ba0a6
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 10:53:29 2016 -0400

    Additional UT's for side_channel.

Merge pull request #460 in SNORT/snort3 from obfuscation-api to master

Squashed commit of the following:

commit 3e707fa72e163079a132af8699ca148d89ddb852
Merge: ac76a1a 83e338f
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Tue May 17 16:54:10 2016 -0400

    Merge branch 'master' into obfuscation-api

commit ac76a1ad4e20cffcac44bacef38f4ed994c5018f
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Tue May 17 13:47:15 2016 -0400

    Remove trailing whitespace

commit a6d150e701769644527410e9dff6b28733fbf421
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Tue May 17 13:29:46 2016 -0400

    Remove trash

commit ace390fda79ba27448bda368f1ffa5cbbdbadbbd
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Fri May 13 14:46:45 2016 -0400

    Update dev-notes

commit 262a239f6997a4a2549cb6d8445b55aee781fc84
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Fri May 13 14:30:19 2016 -0400

    Fix automake for obfuscator unit tests

commit c750d1244e7e4c28e626d1a4dd6b72bd3712dd86
Merge: 84bac2f c244baa
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Fri May 13 13:43:44 2016 -0400

    Merge branch 'master' into obfuscation-api

commit 84bac2f4fa6a1224119fc67a041d9becd278d65d
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Thu May 12 15:03:34 2016 -0400

    Save

commit 6a8d4effd1cd1ada909bbed45b4259826647c626
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Tue May 10 15:47:20 2016 -0400

    Fix is stuff

commit 0ba01748806065b55a6ebaa5f3d262ac185be862
Merge: b811509 d3a1c03
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Mon May 9 13:00:37 2016 -0400

    Merge branch 'master' into obfuscation-api

commit b81150957ff16bf7c288e4ed3603bcd2d58caa0d
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Mon May 9 12:57:37 2016 -0400

    First->first Next->next update dev_notes.txt

commit 4ce64861f11708f99a5de9de8c3149cb941a7b4d
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Fri May 6 12:34:31 2016 -0400

    Validate the memcmp in unit tests

commit 790d42af2ef7966b7e5ce16dc942329f687aa6f1
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Thu May 5 17:03:47 2016 -0400

    Update unit test

commit b45d5c417b200dde32bca35711a92f01555bff81
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Thu May 5 16:46:59 2016 -0400

    Cleanup

commit 05b8c622425a050bd75caf35278e2825c6c99336
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Thu May 5 14:27:06 2016 -0400

    Rename obfuscate -> obfuscator

commit ead6fa1e093c733b35e51a66d8feabd6e7f50153
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Wed May 4 14:57:19 2016 -0400

    Public before private

commit 303e0d1c85b2659e7df740f22e8df3ff7c68dd0b
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Wed Apr 27 16:56:13 2016 -0400

    Use a string instead of VLA

commit dfab53183fd7e7ca0297429c190236de938e42ec
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Wed Apr 27 16:41:33 2016 -0400

    Use auto iterator

commit c7786f5c6b289b0fa6d9d5558f3ec7f065d12c1f
Merge: 9c3388e 11690e4
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Wed Apr 27 16:14:53 2016 -0400

    Merge branch 'master' into obfuscation-api

commit 9c3388e3046006cfdf7a1c7497b1be997f06a0d8
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Wed Apr 27 16:00:50 2016 -0400

    Remove dead code

commit ecc4a7a440bb90e9672b61d967a309ef11f08810
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Wed Apr 27 15:51:15 2016 -0400

    Pull in unit tests for TDD outline.

commit e9fc8f99bdc652738ce155c554d54a995b348c48
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Tue Apr 26 16:54:36 2016 -0400

    Basically obfuscation for cmg and unified2 loggers

Merge pull request #466 in SNORT/snort3 from ha-sc to master

Squashed commit of the following:

commit b2f8cf7996253e13761d0ec773400a41e14c4b47
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 17 15:02:59 2016 -0400

    A few small code review fixes.

commit b903d32fe80c4a4f19e80145a420696716cdd535
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Fri May 6 10:07:21 2016 -0400

    Fix a compile warning.

commit bfbd5abccc7a79b3283430a3307ae3402517953d
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Fri May 6 09:28:29 2016 -0400

    Forgot to add the file_connector_module_test to cmake

commit a99fb124eeae1e6d52f40a6217cbe61f4ada4a00
Merge: 08612c6 fe16e75
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Thu May 5 14:10:32 2016 -0400

    Merge branch 'ha-sc' of https://bitbucket-eng-rtp1.cisco.com/bitbucket/scm/snort/snort3 into ha-sc

commit 08612c66de9c1750015fcbd1033661931bcda05e
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Thu May 5 14:08:35 2016 -0400

    UT's for file_connector.

commit 2c5d4c13e44a644572e012e593e72ebe3d2b2b59
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 4 10:07:52 2016 -0400

    Fixed test stubs to eliminate memory leaks.

commit cc50492ed3d0f1ef5ded6ffcf3bedc238f7e9e4b
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 15:06:02 2016 -0400

    Makefile.am cosmetic changes.

commit 03ff7b57fde7dd0ac747ed2f04707aefed0e6da9
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 13:00:14 2016 -0400

    Remove extraneous stuff.

commit 6b73c2c7ec76339f974875a6aa0f41825f70ea5d
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 10:53:29 2016 -0400

    Additional UT's for side_channel.

commit fe16e7515225e59e75c6a975262d99260a1235b1
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 4 10:07:52 2016 -0400

    Fixed test stubs to eliminate memory leaks.

commit 67dec135d68701f4e12e4eeb94a6b8d86ac85afb
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 15:06:02 2016 -0400

    Makefile.am cosmetic changes.

commit b83d121adaed4f6118b14319f6ce2d0dfc46d4f6
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 13:00:14 2016 -0400

    Remove extraneous stuff.

commit 0f903af76892e136b3a86ff538f8bbd5858ba0a6
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 10:53:29 2016 -0400

    Additional UT's for side_channel.

Merge pull request #473 in SNORT/snort3 from ~JOCORNET/snort3:prevent_profiler_reentrance to master

Squashed commit of the following:

commit 82c885365cb68fb0ca4fc920176d790c55f4ef35
Author: Joel Cornett <joel.cornett@gmail.com>
Date:   Mon May 9 17:25:07 2016 -0400

    fixed formatting

commit f25f307aca52a7d48f27ef03740cb68e766fc746
Author: Joel Cornett <joel.cornett@gmail.com>
Date:   Mon May 9 16:09:04 2016 -0400

    removed unused test case

commit a86c9f19a7193375e9b029154db9e0d69d840f3b
Author: Joel Cornett <joel.cornett@gmail.com>
Date:   Mon May 9 16:06:49 2016 -0400

    added refcount to profiler context to prevent reentrance

Merge pull request #472 in SNORT/snort3 from filecapture to master

* commit '3aaa5bdc3510b65c79cdb9d6439d557d9b653be7':
  update Cmake file
  Fix the link error in automake
  Add file_module file
  move file module to file api

update Cmake file

Merge pull request #470 in SNORT/snort3 from ~JOCORNET/snort3:options_cleanup to master

* commit '014667c540e52c2d0e1e5e6ebda2978f090fa01f':
  updated extra CMakeLists.txt from template
  moved daq build foo to top level
  removed unused macros & cleaned up
  removed ENABLE_SIDE_CHANNEL
  added large pcap options to config.cmake.h.in
  more updates
  cleanup cmake options

Merge branch 'master' of https://bitbucket-eng-rtp1.cisco.com/bitbucket/scm/snort/snort3.git into capture

Merge pull request #474 in SNORT/snort3 from ~JOCORNET/snort3:piglet_mode_leak_fix to master

* commit 'f2f6e6666e1badb896b41f769a81ec46f668c7b8':
  fixed leak due to early exit in piglet mode

fixed leak due to early exit in piglet mode

Fix the link error in automake

Add file_module file

updated extra CMakeLists.txt from template

moved daq build foo to top level

move file module to file api

removed unused macros & cleaned up

removed ENABLE_SIDE_CHANNEL

added large pcap options to config.cmake.h.in

more updates

cleanup cmake options

Merge pull request #469 in SNORT/snort3 from host_memleak2 to master

* commit '768507c544e86d0a2db71c0050be2ebcd0763b55':
  Fixed nits.
  Work around invalid memory leak report. Fix compiler warnings.

Fixed nits.

Work around invalid memory leak report. Fix compiler warnings.

Merge pull request #468 in SNORT/snort3 from nhttp44 to master

* commit 'aa149d6a15b65c554af363cbb8a1934117c3c816':
  NHI Double Decode

NHI Double Decode

Merge pull request #467 in SNORT/snort3 from capture_unit to master

* commit '1932dcce6e63ea6ee71ac11197c99529b3b8ae83':
  fixed unit test dropping files

fixed unit test dropping files

build 197

Squashed commit of the following:

commit 517940ed41c816656adfeff2d2a48dcc3e777822
Author: Russ Combs <rucombs@cisco.com>
Date:   Sat Apr 30 07:44:47 2016 -0400

    fix autotools build of extras
    fix cmake build of extras
    fix cmake visibility of flow and log libs
    fix nhi unit test stubs
    remove useless dev_notes.txt from utils/test/

build 196

Merge pull request #465 in SNORT/snort3 from crc/cmake to master

* commit 'c652a633a0eaf41c0cb4bbf15dbc757560064fa3':
  fix cmake c std and packaging

fix cmake c std and packaging

Merge pull request #459 in SNORT/snort3 from ha-sc to master

* commit '8dc406a905d94ce9093e98f300eae2e35862cb42':
  Missed two THREAD_LOCAL attributes on object pointers.
  Fixed errors in handling of connector configuration.  Previously the module created a static configuration list and then handed off a copy of this to side_channel.  This had some errors and was confusing.  Moved to a totally dynamically allocated config_set.  The module creates a vector of pointers and then hands this over to the side_channel.  No copying.  And no memory leaks.

Missed two THREAD_LOCAL attributes on object pointers.

Merge pull request #464 in SNORT/snort3 from ~JOCORNET/snort3:fix_extras_build to master

* commit 'dd2b42f8bfb84ce15e9cef007cfefd69dc8fccce':
  removing BUILDING_SO ifdefs and get daqs to build as -std=gnu99 -module

removing BUILDING_SO ifdefs and get daqs to build as -std=gnu99 -module

Merge pull request #463 in SNORT/snort3 from crc/scan to master

* commit 'd66e6a7d95dadc611aec2317767a728c8bd67d11':
  fix static analysis issues

fix static analysis issues

Merge pull request #462 in SNORT/snort3 from delete_alt_data to master

* commit 'ff20305fd19fc0797264f745fdb8d36ed352114f':
  Delete unused THREAD_LOCAL g_alt_data

Delete unused THREAD_LOCAL g_alt_data

Merge pull request #435 in SNORT/snort3 from ~JOCORNET/snort3:refactor_extras to master

* commit '783a2f028723b9a7b5f5c58f35d1d50e5c922adc':
  fixed merge conflicts
  fix merge conflicts in extra
  rename examples -> src
  rename examples -> src
  re-added extra/COPYING
  updated snort email address in configure.ac
  updated LICENSE + README
  merged in changes
  fixed make distcheck, cmake & make install
  imported refactored extras
  rebased from master

Fixed errors in handling of connector configuration.  Previously the module created a static configuration list and then handed off a copy of this to side_channel.  This had some errors and was confusing.  Moved to a totally dynamically allocated config_set.  The module creates a vector of pointers and then hands this over to the side_channel.  No copying.  And no memory leaks.

fixed merge conflicts

fix merge conflicts in extra

rename examples -> src

rename examples -> src

re-added extra/COPYING

updated snort email address in configure.ac

updated LICENSE + README

merged in changes

fixed make distcheck, cmake & make install

imported refactored extras

rebased from master

Merge pull request #458 in SNORT/snort3 from protocol_warnings to master

* commit '94de721b0862e68517deb01d52b899586c1c36ad':
  Fixed warnings due to protocol update.

Fixed warnings due to protocol update.

Merge pull request #456 in SNORT/snort3 from protocol1 to master

* commit 'eed6be9d525c7aa3a2d4f262e0b52241a5f476d9':
  Updated protocol types in extra sub-dir.
  Updates based on review.  Updated dev_notes.txt.
  Fix some bugs found during testing and uncrustify.
  Removed perf_flow.h which had been removed from master.
  ProtocolId and IpProtocol updates.
  Add IpProtocol and ProtocolId enums.

Merge pull request #457 in SNORT/snort3 from cap_build2 to master

* commit '3531ba4d015229c8dc404d762d0b8b75bdade775':
  fixed crossed static / dynamic inclusion for packet capture

fixed crossed static / dynamic inclusion for packet capture

Merge pull request #454 in SNORT/snort3 from stream_tcp_state_handling to master

* commit '12a43bb4e01c86831bcba4fefc4a33ea73e14662':
  fix copyright, uncrustify, alpha order file lists in Makefile.am
  make state machine allocation thread safe
  more changes to support tcp sm as flyweight/singleton, delete redundant typecasts of tracker objects