sources: select only when reference can be updated

Before selecting the new synchronization source wait until the reference
can be updated, i.e. the source has new samples.

sources: drop selectable flag

This is no longer needed with new NTP packet processing as the sources
are always selectable after first sample is accumulated.

sources: reorder SRC_SelectSource()

Reorder the code to improve readability and also update coding style.
No functional changes.

sources: keep synchronized status with unreachable/unselectable sources

Following RFC 5905, don't call REF_SetUnsynchronised() when there are no
reachable or selectable sources. It's up to the client to consider the
source unsynchronized when the root distance exceeds a threshold.

The unsynchronized status is still set when no majority is reached.

sources: update reference only with new sample

This follows the section 11.2.3. from RFC 5905.

ntp: fix Clang warning

ntp: merge broadcast code with ntp_core

ntp: define NTP_MAX_STRATUM for other modules

doc: update for NTPv4 support

Update comments referencing RFC 1305

ntp: update packet processing to NTPv4 (RFC 5905)

ntp: clamp value set by minstratum option

sources: use correct specifier for refid in debug message

ntp: print number of bytes sent in debug message

ntp: enable PKTINFO on client sockets

This will be useful to detect synchronization loops.

util: fix sockaddr function naming

client: improve sources caption

util: use common functions to convert to/from sockaddr

client: print full date in manual list

ntp: fix NSR_TakeSourcesOffline()

This was broken when switching to dynamic allocation in commit 9e7193.

keys: store IDs in uint32_t

logging: remove warning on missing debug messages

The state of the DEBUG feature is now printed with chronyd version.

cmdmon: fix initialization of allocated reply slots

The next pointer in the last allocated reply slot was not set. This
could cause a crash when more slots were needed. (the slots are used to
save unacknowledged replies to authenticated commands)

cmdmon: allocate reply slots in smaller quantums

cmdmon: use char for permissions table

refclock: include refid in some debug messages

util: optimize UTI_RefidToString()

rtc: allocate samples dynamically

conf: allocate sources dynamically

This removes the limits on maximum number of sources specified by the
initstepslew, server and refclock directives in the config file.

ntp: allocate source records dynamically

This removes the limit on maximum number of added NTP sources.

refclocks: allocate refclock instances dynamically

keys: allocate keys dynamically

This removes the limit on maximum number of keys in the key file.

sched: allocate file handlers dynamically

sources: reallocate arrays in exponentially increasing sizes

ntp: improve hashing of sources

Use 32-bit hash and switch to quadratic probing. This will be useful to
allow resizing of the hash table and not limit the number of sources.

Add array utility functions

Free allocated memory on exit

This should reduce the number of possible memory leaks reported by
valgrind. The remaining reported leaks are sched tqe allocation, async
DNS instance allocation, cmdmon response/timestamp cell allocation, and
clientlog subnet allocation.

cmdparse: don't duplicate hostname in CPS_ParseNTPSourceAdd()

Let the caller duplicate the string if needed.

Check for memory allocation errors

test: make 114-presend more tolerant

nameserv: move fallback DNS_Name2IPAddressAsync() to stubs.c

configure: add --disable-sechash option

Print enabled/disabled features with version

configure: unify macro naming for optional features

configure: allow building without cmdmon, NTP, refclock support

configure: unify macro naming for available headers

configure: don't remove config files with --help

sourcestats: remove tracking of skew change

This is not used since commit 7a6ee1d.

doc: update NEWS

doc: mention that directives are not case-sensitive

doc: add section to FAQ on improving accuracy with NTP

doc: remove minpoll and maxpoll options from configuration example

sched: fix Clang warning

client: describe error when could not open config or keyfile

Ignore measurements around leap second

When current time is within 5 seconds of a leap second, don't accumulate
new samples or update the leap second status to increase the chances of
getting through safely.

ntp: print warning 10 years before supported time ends

configure: check if pkg-config is available

This is needed with some shells to prevent "pkg-config: not found"
errors from being displayed.

Fix compiler warnings on NetBSD

examples: add NetworkManager dispatcher script

examples: add systemd services

examples: add logrotate configuration

Move chrony.spec to examples

sys: fix typo in prctl() error message

util: fix compiler warning with 32-bit time_t

Update NEWS

ntp: don't stop online burst when sending fails

Don't stop online burst for unreachable sources until sending succeeds.
This is mainly useful with iburst when chronyd is started before the
network is configured.

ntp: don't adjust polling interval when sending fails

ntp: return with status from functions sending packets

doc: clarify description of -s option

sched: improve time jump detection

To detect forward time jumps, use a timestamp made before calling
select() instead of the first timeout in the queue. Also, if the timeout
value is modified by select() (e.g. on Linux) use it to get a more
accurate estimate of the elapsed time.

ntp: restart timer when poll interval changes on reset

ntp: add function to restart transmit timer

sched: make sure scheduler parameter change handler is first

This is needed to allow other handlers to add new timers.

local: use common function to invoke parameter change handlers

This was missing in commit b69b648d.

reference: always update driftfile on exit

This is useful with the new fallback function of the -s option to
restore the system time at which chronyd was previously stopped.

rtc: set clock to mtime of driftfile when RTC preinit fails

When the RTC preinit function fails, set the system clock to the time of
the last modification of the driftfile if it's in the future. This makes
the -s option somewhat useful on systems where RTC is not supported or
missing.

This is similar to the functionality implemented in the fake-hwclock
script.

rtc: don't try to open rtcfile when not set

rtc: use fscanf() to read coefficients

rtc: return status from preinit function

rtc: use LCL functions to read and step system clock

rtc: improve accuracy of preinit step

rtc: minor cleanup in RTC_Linux_TimePreInit()

rtc: move preinit call to RTC_Initialise()

rtc: cleanup in error messages

test: add 115-cmdmontime

util: update functions converting cmdmon timestamps

cmdmon: convert LOGON timestamp only with LOGON message

Avoid always calling UTI_TimevalNetworkToHost() and make the code more
readable.

sched: check that added file descriptor fits in fd_set

sched: use FD_SETSIZE if defined

test: add 114-presend

ntp: add debug message for received packet

ntp: use NTP instead of echo for presend

Switch to NTP for presend as the echo service (RFC 862) is rarely
enabled. When presend is active, send an NTP client packet to the
server/peer and ignore the reply.

This also fixes presend with separate client sockets. The destination
port can't be changed on connected sockets, so the echo packet was sent
to the NTP port instead of the echo port.

Check for truncated source address when receiving packets

test: fix check in run script

test: add 008-ntpera

test: allow tests to be skipped

util: add support for other NTP eras

NTP timestamps use only 32 bits to count seconds and the current NTP era
ends in 2036. Add support for converting NTP timestamps from other NTP
eras on systems with 64-bit time_t.

The earliest assumed NTP time is set by the configure script (by default
to 50 years before the date of the build) and earlier NTP timestamps
underflow to the following NTP era.

ntp: move packet size asserts to ntp_core

util: fix printing of timestamps when time_t is longer than long

configure: check for 64-bit time_t