Fix printing of NP and NR over 99 in sourcestats

Use only 3 chars from refclock driver name in default refid

Add polltarget command

Add logbanner directive

Base poll adjustment on number of sourcestats samples

Instead of following skew changes, adjust polling interval so that the
number of measurements used in the regression algorithm remains close to
a target value. It can be configured with a new polltarget option
(6 by default).

Move default source parameters to macros

Add -m option to allow multiple commands on command line

Add retries and timeout commands

Adjust chronyc timeout

Start at 1 second and increase it exponentially with maximum number of
attempts 3.

Support prefer and noselect options in chronyc

Merge code for adding NTP server and peer in cmdmon

Add prefer and noselect options

Fix crash when reloading history with zero samples

Fix reloading sample histories with refclocks

Add minstratum command

Document minstratum option

Add minstratum option

Stratum in received packets is raised to the configured minimum.

Add -n option to allow using syslog without forking

Use 5% critical region for number of runs

This results in more samples used in regression and slightly improved
response with high jitters.

Extend runs test

Double the number of samples that are used in the runs test. E.g. with 64
samples in regression the runs test will be tried over the 64 samples and
up to 64 previous samples. The minimum number of samples in now 4.

This improves the response with low-mid jitters by about 50%.

Run configure tests with LDFLAGS

Fix updating of best_single_sample

Don't use timezone parameter in gettimeofday and settimeofday calls

Replace all CROAK calls with assert or LOG_FATAL

Remove croak() and use assert() or LOG_FATAL() everywhere. Hopefully
the problems with debugging mentioned in the croak() comment are long gone.

Regenerate critical values for number of runs

Generate more values to allow regression with 128 samples. Possibly a
different approach was used to generate the values, or the previous table
was actually using 11% critical region and had an extra value in the
12th place.

Assert number of points in regress functions

Update offset correction errors only when needed

Fix updating of nano slew offset correction error

Store sourcestats samples in circular buffer

The samples now don't have to be moved when pruning the register.

Cleanup sourcestats code a bit

Change length of resid buffer to MAX_POINTS

Remove weights from sourcestats record

Weights are calculated before each regression call, no need to store them.

Remove SST_DoUpdateRegression

The function is not used anywhere and it requires weights to be stored
sourcestats.

Add nanosecond slewing to Linux driver

For offset adjustments below 10 microseconds use kernel PLL with
locked frequency and 1s time constant.

Reset adjtime offset on start

Clarify some cmdmon warning messages

Don't hang in our_round

The routine could loop infinitely when rounding a large value, replace
it with our_lround.

Set minimum allowed skew to 1e-12

Read chrony.conf before checking/writing pid file

This fixes the pidfile directive.

Add rtcsync directive

The directive enables the 11 minute kernel mode. It cannot be used
when the normal RTC tracking is enabled.

Rehash NTP source table after removing source

This is needed to avoid breaking a probe sequence and losing another
source. It is costly, but it's not expected to happen frequently.

Make use of UTI_AdjustTimeval in slew handlers

Fix RTC slew handler

The frequency adjustment needs to be done in the opposite direction.

Don't use AI_ADDRCONFIG hint

We want to get IPv4/6 addresses even if the local system currently has
no IPv4/6 address configured.

Change online status also for unresolved sources

Retry name resolving before marking sources online

Don't log network is unreachable errors

Fix name resolving when IPv6 support is disabled

Add delayed name resolving for servers and peers

Resolving is retried in increasing intervals (maximum is one hour)
until it succeeds or fails with a non-temporary error.

Unresolved sources are included in the activity report as offline
sources and the online command can be used to retry it immediately.

This could be improved by resolving in a separate thread/process
to avoid blocking.

Don't retry resolving in DNS_Name2IPAddress

Instead of retrying to resolve it in the function and blocking for a
long time, return a TryAgain status and let the caller retry it later if
necessary.

Merge NSR/NCR server and peer functions

Set maxupdateskew to 1000 ppm by default

This will prevent from using unreliable frequency estimate on iburst
when starting without drift file.

Add iburst server option

Clamp tick value before calling adjtimex

If tick is outside allowed adjtimex range, clamp it and log a warning
instead of aborting.

Return actual frequency in drv_set_freq functions

This is needed to keep sourcestats accurate when the actual frequency is
different from the requested frequency due to clamping (or possibly
rounding in future system drivers).

Add dispersion after Linux makestep

Mark source unreachable after offline burst

Increase burst polling interval

To avoid getting KoD RATE from NTP server (triggering discard minimum 1)
when burst sampling, increase polling interval to 2 seconds.

Stop burst sampling when received KoD RATE

Update drift file at most once per hour

Instead of writing to the file on every reference update, update it
on first update, on exit and otherwise only once per hour.

Remove absolute frequency from handler parameters

None of the current handlers really need it and with temperature
compensation enabled it would be necessary to undo the compensation
before passing it to the handlers.

Add temperature compensation

A new tempcomp directive can be used to specify a file for reading
current temperature, update interval and compensation coefficients. The
clock frequency corrections are applied in local module and are invisible
in upper layers. The measurements and corrections can be logged to
tempcomp.log file.

Add fallback drifts

Fallback drifts are long-term averages of the system clock drift
calculated over exponentially increasing intervals. They are used when
the clock is unsynchronised to avoid quickly drifting away from true
time if there was a short-term deviation in drift before the
synchronisation was lost.

Fix frequency accumulation

Fix possible memory leak in mkdir_and_parents()

Refactor file logging

Avoid large times in chronyc sources / sourcestats overflowing lines

Main trouble was double values too large to be represented as ints being
converted to -INT_MAX and then passing the < 9999 cut.

Mark offline sources unreachable

Add refclock precision

Reduce noise in refclock sample dispersions

Use the estimated dispersion only if it's higher than long-term average.
This should improve performance with short polling intervals.

Log also filtered samples

Adjust refclock filter parameters

Drop only about 40 percent of samples, change default length to 64,
require at least 4 samples between polls (or full filter for lengths
below 4).

Make linear fit in refclock dispersion calculation

This should improve reaction to sudden temperature changes with
very precise refclocks and/or long polling intervals.

Estimate offset correction error in Linux driver

Add dispersion notification handlers

Include offset correction error in dispersion

Prepare for handling offset correction error

Don't set system precision to log2 based value

Fix stratum with locked PPS refclock and local stratum

Update NEWS

Limit rate of syslog messages

Error messages caused by incoming packets need to be rate limited
to avoid filling up disk space.

Don't reply to invalid chronyc packets

Update list of commands not using authentication in documentation

Initialize local_ntp_tx in ntp_core

This fixes another valgrind error.

Allow to set only permission bits with perm option

Add perm option to SHM driver

Add common refclock driver option parsing

Add lock option for PPS refclocks

Don't start chronyd with unrecognized command line options

Fix scheduler to allow stepping clock from timeout handler

Add makestep directive

Handle immediate step in local module instead of system driver

This fixes the problem where scheduler wasn't notified about performed
steps and it also makes the command available on all supported systems.

Limit timeout for end of slew to avoid overflow

Don't require _bigadj kernel symbol in NetBSD driver

Print only printable characters from refid

Fix name resolving on NetBSD

Increase buffers used to print IPv6 addresses

Return 0 from DNS_IPAddress2Name when name was truncated

Write banner to tracking log when not synchronized

Log warning when changing file ownership fails