Merge pull request #489 in SNORT/snort3 from ~MIALTIZE/snort3:snort2lua to master

Squashed commit of the following:

commit 5c2f5c73a956b4da8513e32bfb72dbdafdedd56e
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Tue May 24 18:42:42 2016 +0000

    snort2lua: Allow for case-insensitive preprocessor keyword matching

Merge pull request #487 in SNORT/snort3 from ~MIALTIZE/snort3:for-russ-trivial to master

Squashed commit of the following:

commit 8b44097a7d6531e273a7dc20963712a4f4f77dc2
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Tue May 24 00:23:20 2016 +0000

    sfdaq: Fix memory leak in module per-instance configuration

commit a7681dfc7f788c5753f0962fed419e25c06410bd
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Tue May 24 00:08:52 2016 +0000

    sfdaq: Fix incorrectly overwriting last per-instance config

Merge pull request #481 in SNORT/snort3 from packet-struct to master

Squashed commit of the following:

commit 59def90162924e1037a0f52e6ed12d6133a53219
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Thu May 19 15:10:42 2016 -0400

    Add ctor/dtor to packet and cleanup packet_manager.

Merge pull request #479 in SNORT/snort3 from ha-sc to master

Squashed commit of the following:

commit 5e0a5bb14097eb2a3d1ab4e53c7335585afb1699
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Thu May 19 10:36:05 2016 -0400

    Fix a memory leak in the Flow object regarding the ha_state.

commit 02bc6738393e253473f57c6b1367e0fd982ac033
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 18 09:15:29 2016 -0400

    Fix mem leak issue in UT.

commit d44d4c3631b90a7a136810ac137033d8fe72115e
Merge: 9a643a8 b2f8cf7
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 18 07:57:29 2016 -0400

    Merge branch 'ha-sc' of https://bitbucket-eng-rtp1.cisco.com/bitbucket/scm/snort/snort3

commit b2f8cf7996253e13761d0ec773400a41e14c4b47
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 17 15:02:59 2016 -0400

    A few small code review fixes.

commit b903d32fe80c4a4f19e80145a420696716cdd535
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Fri May 6 10:07:21 2016 -0400

    Fix a compile warning.

commit bfbd5abccc7a79b3283430a3307ae3402517953d
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Fri May 6 09:28:29 2016 -0400

    Forgot to add the file_connector_module_test to cmake

commit a99fb124eeae1e6d52f40a6217cbe61f4ada4a00
Merge: 08612c6 fe16e75
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Thu May 5 14:10:32 2016 -0400

    Merge branch 'ha-sc' of https://bitbucket-eng-rtp1.cisco.com/bitbucket/scm/snort/snort3 into ha-sc

commit 08612c66de9c1750015fcbd1033661931bcda05e
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Thu May 5 14:08:35 2016 -0400

    UT's for file_connector.

commit 2c5d4c13e44a644572e012e593e72ebe3d2b2b59
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 4 10:07:52 2016 -0400

    Fixed test stubs to eliminate memory leaks.

commit cc50492ed3d0f1ef5ded6ffcf3bedc238f7e9e4b
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 15:06:02 2016 -0400

    Makefile.am cosmetic changes.

commit 03ff7b57fde7dd0ac747ed2f04707aefed0e6da9
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 13:00:14 2016 -0400

    Remove extraneous stuff.

commit 6b73c2c7ec76339f974875a6aa0f41825f70ea5d
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 10:53:29 2016 -0400

    Additional UT's for side_channel.

commit fe16e7515225e59e75c6a975262d99260a1235b1
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 4 10:07:52 2016 -0400

    Fixed test stubs to eliminate memory leaks.

commit 67dec135d68701f4e12e4eeb94a6b8d86ac85afb
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 15:06:02 2016 -0400

    Makefile.am cosmetic changes.

commit b83d121adaed4f6118b14319f6ce2d0dfc46d4f6
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 13:00:14 2016 -0400

    Remove extraneous stuff.

commit 0f903af76892e136b3a86ff538f8bbd5858ba0a6
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 10:53:29 2016 -0400

    Additional UT's for side_channel.

Merge pull request #478 in SNORT/snort3 from obfuscator-fix-asan to master

Squashed commit of the following:

commit 2615e341ddccff7506c341d416a77f58ce9ea3d7
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Wed May 18 16:24:38 2016 -0400

    Fix memory leak

commit 00399aa838a1978ddaa605e21a8a4a91b6d6a782
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Wed May 18 16:22:33 2016 -0400

    Fix memory leak

Merge pull request #477 in SNORT/snort3 from ~MIALTIZE/snort3:for-russ-trivial to master

Squashed commit of the following:

commit dc9d3b68c909b7e76465ea34e4e4a576b300b2c8
Author: Michael Altizer <mialtize@cisco.com>
Date:   Wed May 18 12:42:24 2016 -0400

    obfuscator: Add missing includes

Merge pull request #476 in SNORT/snort3 from ha-sc to master

Squashed commit of the following:

commit 02bc6738393e253473f57c6b1367e0fd982ac033
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 18 09:15:29 2016 -0400

    Fix mem leak issue in UT.

commit d44d4c3631b90a7a136810ac137033d8fe72115e
Merge: 9a643a8 b2f8cf7
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 18 07:57:29 2016 -0400

    Merge branch 'ha-sc' of https://bitbucket-eng-rtp1.cisco.com/bitbucket/scm/snort/snort3

commit b2f8cf7996253e13761d0ec773400a41e14c4b47
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 17 15:02:59 2016 -0400

    A few small code review fixes.

commit b903d32fe80c4a4f19e80145a420696716cdd535
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Fri May 6 10:07:21 2016 -0400

    Fix a compile warning.

commit bfbd5abccc7a79b3283430a3307ae3402517953d
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Fri May 6 09:28:29 2016 -0400

    Forgot to add the file_connector_module_test to cmake

commit a99fb124eeae1e6d52f40a6217cbe61f4ada4a00
Merge: 08612c6 fe16e75
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Thu May 5 14:10:32 2016 -0400

    Merge branch 'ha-sc' of https://bitbucket-eng-rtp1.cisco.com/bitbucket/scm/snort/snort3 into ha-sc

commit 08612c66de9c1750015fcbd1033661931bcda05e
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Thu May 5 14:08:35 2016 -0400

    UT's for file_connector.

commit 2c5d4c13e44a644572e012e593e72ebe3d2b2b59
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 4 10:07:52 2016 -0400

    Fixed test stubs to eliminate memory leaks.

commit cc50492ed3d0f1ef5ded6ffcf3bedc238f7e9e4b
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 15:06:02 2016 -0400

    Makefile.am cosmetic changes.

commit 03ff7b57fde7dd0ac747ed2f04707aefed0e6da9
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 13:00:14 2016 -0400

    Remove extraneous stuff.

commit 6b73c2c7ec76339f974875a6aa0f41825f70ea5d
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 10:53:29 2016 -0400

    Additional UT's for side_channel.

commit fe16e7515225e59e75c6a975262d99260a1235b1
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 4 10:07:52 2016 -0400

    Fixed test stubs to eliminate memory leaks.

commit 67dec135d68701f4e12e4eeb94a6b8d86ac85afb
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 15:06:02 2016 -0400

    Makefile.am cosmetic changes.

commit b83d121adaed4f6118b14319f6ce2d0dfc46d4f6
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 13:00:14 2016 -0400

    Remove extraneous stuff.

commit 0f903af76892e136b3a86ff538f8bbd5858ba0a6
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 10:53:29 2016 -0400

    Additional UT's for side_channel.

Merge pull request #460 in SNORT/snort3 from obfuscation-api to master

Squashed commit of the following:

commit 3e707fa72e163079a132af8699ca148d89ddb852
Merge: ac76a1a 83e338f
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Tue May 17 16:54:10 2016 -0400

    Merge branch 'master' into obfuscation-api

commit ac76a1ad4e20cffcac44bacef38f4ed994c5018f
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Tue May 17 13:47:15 2016 -0400

    Remove trailing whitespace

commit a6d150e701769644527410e9dff6b28733fbf421
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Tue May 17 13:29:46 2016 -0400

    Remove trash

commit ace390fda79ba27448bda368f1ffa5cbbdbadbbd
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Fri May 13 14:46:45 2016 -0400

    Update dev-notes

commit 262a239f6997a4a2549cb6d8445b55aee781fc84
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Fri May 13 14:30:19 2016 -0400

    Fix automake for obfuscator unit tests

commit c750d1244e7e4c28e626d1a4dd6b72bd3712dd86
Merge: 84bac2f c244baa
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Fri May 13 13:43:44 2016 -0400

    Merge branch 'master' into obfuscation-api

commit 84bac2f4fa6a1224119fc67a041d9becd278d65d
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Thu May 12 15:03:34 2016 -0400

    Save

commit 6a8d4effd1cd1ada909bbed45b4259826647c626
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Tue May 10 15:47:20 2016 -0400

    Fix is stuff

commit 0ba01748806065b55a6ebaa5f3d262ac185be862
Merge: b811509 d3a1c03
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Mon May 9 13:00:37 2016 -0400

    Merge branch 'master' into obfuscation-api

commit b81150957ff16bf7c288e4ed3603bcd2d58caa0d
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Mon May 9 12:57:37 2016 -0400

    First->first Next->next update dev_notes.txt

commit 4ce64861f11708f99a5de9de8c3149cb941a7b4d
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Fri May 6 12:34:31 2016 -0400

    Validate the memcmp in unit tests

commit 790d42af2ef7966b7e5ce16dc942329f687aa6f1
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Thu May 5 17:03:47 2016 -0400

    Update unit test

commit b45d5c417b200dde32bca35711a92f01555bff81
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Thu May 5 16:46:59 2016 -0400

    Cleanup

commit 05b8c622425a050bd75caf35278e2825c6c99336
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Thu May 5 14:27:06 2016 -0400

    Rename obfuscate -> obfuscator

commit ead6fa1e093c733b35e51a66d8feabd6e7f50153
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Wed May 4 14:57:19 2016 -0400

    Public before private

commit 303e0d1c85b2659e7df740f22e8df3ff7c68dd0b
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Wed Apr 27 16:56:13 2016 -0400

    Use a string instead of VLA

commit dfab53183fd7e7ca0297429c190236de938e42ec
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Wed Apr 27 16:41:33 2016 -0400

    Use auto iterator

commit c7786f5c6b289b0fa6d9d5558f3ec7f065d12c1f
Merge: 9c3388e 11690e4
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Wed Apr 27 16:14:53 2016 -0400

    Merge branch 'master' into obfuscation-api

commit 9c3388e3046006cfdf7a1c7497b1be997f06a0d8
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Wed Apr 27 16:00:50 2016 -0400

    Remove dead code

commit ecc4a7a440bb90e9672b61d967a309ef11f08810
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Wed Apr 27 15:51:15 2016 -0400

    Pull in unit tests for TDD outline.

commit e9fc8f99bdc652738ce155c554d54a995b348c48
Author: Victor Roemer <viroemer@cisco.com>
Date:   Tue Apr 26 16:54:36 2016 -0400

    Basically obfuscation for cmg and unified2 loggers

Merge pull request #466 in SNORT/snort3 from ha-sc to master

Squashed commit of the following:

commit b2f8cf7996253e13761d0ec773400a41e14c4b47
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 17 15:02:59 2016 -0400

    A few small code review fixes.

commit b903d32fe80c4a4f19e80145a420696716cdd535
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Fri May 6 10:07:21 2016 -0400

    Fix a compile warning.

commit bfbd5abccc7a79b3283430a3307ae3402517953d
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Fri May 6 09:28:29 2016 -0400

    Forgot to add the file_connector_module_test to cmake

commit a99fb124eeae1e6d52f40a6217cbe61f4ada4a00
Merge: 08612c6 fe16e75
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Thu May 5 14:10:32 2016 -0400

    Merge branch 'ha-sc' of https://bitbucket-eng-rtp1.cisco.com/bitbucket/scm/snort/snort3 into ha-sc

commit 08612c66de9c1750015fcbd1033661931bcda05e
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Thu May 5 14:08:35 2016 -0400

    UT's for file_connector.

commit 2c5d4c13e44a644572e012e593e72ebe3d2b2b59
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 4 10:07:52 2016 -0400

    Fixed test stubs to eliminate memory leaks.

commit cc50492ed3d0f1ef5ded6ffcf3bedc238f7e9e4b
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 15:06:02 2016 -0400

    Makefile.am cosmetic changes.

commit 03ff7b57fde7dd0ac747ed2f04707aefed0e6da9
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 13:00:14 2016 -0400

    Remove extraneous stuff.

commit 6b73c2c7ec76339f974875a6aa0f41825f70ea5d
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 10:53:29 2016 -0400

    Additional UT's for side_channel.

commit fe16e7515225e59e75c6a975262d99260a1235b1
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Wed May 4 10:07:52 2016 -0400

    Fixed test stubs to eliminate memory leaks.

commit 67dec135d68701f4e12e4eeb94a6b8d86ac85afb
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 15:06:02 2016 -0400

    Makefile.am cosmetic changes.

commit b83d121adaed4f6118b14319f6ce2d0dfc46d4f6
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 13:00:14 2016 -0400

    Remove extraneous stuff.

commit 0f903af76892e136b3a86ff538f8bbd5858ba0a6
Author: Ed Borgoyn <eborgoyn@cisco.com>
Date:   Tue May 3 10:53:29 2016 -0400

    Additional UT's for side_channel.

Merge pull request #473 in SNORT/snort3 from ~JOCORNET/snort3:prevent_profiler_reentrance to master

Squashed commit of the following:

commit 82c885365cb68fb0ca4fc920176d790c55f4ef35
Author: Joel Cornett <joel.cornett@gmail.com>
Date:   Mon May 9 17:25:07 2016 -0400

    fixed formatting

commit f25f307aca52a7d48f27ef03740cb68e766fc746
Author: Joel Cornett <joel.cornett@gmail.com>
Date:   Mon May 9 16:09:04 2016 -0400

    removed unused test case

commit a86c9f19a7193375e9b029154db9e0d69d840f3b
Author: Joel Cornett <joel.cornett@gmail.com>
Date:   Mon May 9 16:06:49 2016 -0400

    added refcount to profiler context to prevent reentrance

Merge pull request #472 in SNORT/snort3 from filecapture to master

* commit '3aaa5bdc3510b65c79cdb9d6439d557d9b653be7':
  update Cmake file
  Fix the link error in automake
  Add file_module file
  move file module to file api

update Cmake file

Merge pull request #470 in SNORT/snort3 from ~JOCORNET/snort3:options_cleanup to master

* commit '014667c540e52c2d0e1e5e6ebda2978f090fa01f':
  updated extra CMakeLists.txt from template
  moved daq build foo to top level
  removed unused macros & cleaned up
  removed ENABLE_SIDE_CHANNEL
  added large pcap options to config.cmake.h.in
  more updates
  cleanup cmake options

Merge branch 'master' of https://bitbucket-eng-rtp1.cisco.com/bitbucket/scm/snort/snort3.git into capture

Merge pull request #474 in SNORT/snort3 from ~JOCORNET/snort3:piglet_mode_leak_fix to master

* commit 'f2f6e6666e1badb896b41f769a81ec46f668c7b8':
  fixed leak due to early exit in piglet mode

fixed leak due to early exit in piglet mode

Fix the link error in automake

Add file_module file

updated extra CMakeLists.txt from template

moved daq build foo to top level

move file module to file api

removed unused macros & cleaned up

removed ENABLE_SIDE_CHANNEL

added large pcap options to config.cmake.h.in

more updates

cleanup cmake options

Merge pull request #469 in SNORT/snort3 from host_memleak2 to master

* commit '768507c544e86d0a2db71c0050be2ebcd0763b55':
  Fixed nits.
  Work around invalid memory leak report. Fix compiler warnings.

Fixed nits.

Work around invalid memory leak report. Fix compiler warnings.

Merge pull request #468 in SNORT/snort3 from nhttp44 to master

* commit 'aa149d6a15b65c554af363cbb8a1934117c3c816':
  NHI Double Decode

NHI Double Decode

Merge pull request #467 in SNORT/snort3 from capture_unit to master

* commit '1932dcce6e63ea6ee71ac11197c99529b3b8ae83':
  fixed unit test dropping files

fixed unit test dropping files

build 197

Squashed commit of the following:

commit 517940ed41c816656adfeff2d2a48dcc3e777822
Author: Russ Combs <rucombs@cisco.com>
Date:   Sat Apr 30 07:44:47 2016 -0400

    fix autotools build of extras
    fix cmake build of extras
    fix cmake visibility of flow and log libs
    fix nhi unit test stubs
    remove useless dev_notes.txt from utils/test/

build 196

Merge pull request #465 in SNORT/snort3 from crc/cmake to master

* commit 'c652a633a0eaf41c0cb4bbf15dbc757560064fa3':
  fix cmake c std and packaging

fix cmake c std and packaging

Merge pull request #459 in SNORT/snort3 from ha-sc to master

* commit '8dc406a905d94ce9093e98f300eae2e35862cb42':
  Missed two THREAD_LOCAL attributes on object pointers.
  Fixed errors in handling of connector configuration.  Previously the module created a static configuration list and then handed off a copy of this to side_channel.  This had some errors and was confusing.  Moved to a totally dynamically allocated config_set.  The module creates a vector of pointers and then hands this over to the side_channel.  No copying.  And no memory leaks.

Missed two THREAD_LOCAL attributes on object pointers.

Merge pull request #464 in SNORT/snort3 from ~JOCORNET/snort3:fix_extras_build to master

* commit 'dd2b42f8bfb84ce15e9cef007cfefd69dc8fccce':
  removing BUILDING_SO ifdefs and get daqs to build as -std=gnu99 -module

removing BUILDING_SO ifdefs and get daqs to build as -std=gnu99 -module

Merge pull request #463 in SNORT/snort3 from crc/scan to master

* commit 'd66e6a7d95dadc611aec2317767a728c8bd67d11':
  fix static analysis issues

fix static analysis issues

Merge pull request #462 in SNORT/snort3 from delete_alt_data to master

* commit 'ff20305fd19fc0797264f745fdb8d36ed352114f':
  Delete unused THREAD_LOCAL g_alt_data

Delete unused THREAD_LOCAL g_alt_data

Merge pull request #435 in SNORT/snort3 from ~JOCORNET/snort3:refactor_extras to master

* commit '783a2f028723b9a7b5f5c58f35d1d50e5c922adc':
  fixed merge conflicts
  fix merge conflicts in extra
  rename examples -> src
  rename examples -> src
  re-added extra/COPYING
  updated snort email address in configure.ac
  updated LICENSE + README
  merged in changes
  fixed make distcheck, cmake & make install
  imported refactored extras
  rebased from master

Fixed errors in handling of connector configuration.  Previously the module created a static configuration list and then handed off a copy of this to side_channel.  This had some errors and was confusing.  Moved to a totally dynamically allocated config_set.  The module creates a vector of pointers and then hands this over to the side_channel.  No copying.  And no memory leaks.

fixed merge conflicts

fix merge conflicts in extra

rename examples -> src

rename examples -> src

re-added extra/COPYING

updated snort email address in configure.ac

updated LICENSE + README

merged in changes

fixed make distcheck, cmake & make install

imported refactored extras

rebased from master

Merge pull request #458 in SNORT/snort3 from protocol_warnings to master

* commit '94de721b0862e68517deb01d52b899586c1c36ad':
  Fixed warnings due to protocol update.

Fixed warnings due to protocol update.

Merge pull request #456 in SNORT/snort3 from protocol1 to master

* commit 'eed6be9d525c7aa3a2d4f262e0b52241a5f476d9':
  Updated protocol types in extra sub-dir.
  Updates based on review.  Updated dev_notes.txt.
  Fix some bugs found during testing and uncrustify.
  Removed perf_flow.h which had been removed from master.
  ProtocolId and IpProtocol updates.
  Add IpProtocol and ProtocolId enums.

Merge pull request #457 in SNORT/snort3 from cap_build2 to master

* commit '3531ba4d015229c8dc404d762d0b8b75bdade775':
  fixed crossed static / dynamic inclusion for packet capture

fixed crossed static / dynamic inclusion for packet capture

Merge pull request #454 in SNORT/snort3 from stream_tcp_state_handling to master

* commit '12a43bb4e01c86831bcba4fefc4a33ea73e14662':
  fix copyright, uncrustify, alpha order file lists in Makefile.am
  make state machine allocation thread safe
  more changes to support tcp sm as flyweight/singleton, delete redundant typecasts of tracker objects

fix copyright, uncrustify, alpha order file lists in Makefile.am

Updated protocol types in extra sub-dir.

Merge pull request #455 in SNORT/snort3 from ~JOCORNET/snort3:fix_error_message_for_memcap to master

* commit 'de01fb42408cd1b92ae6c2bb585d469b58b32764':
  foo

foo

Merge pull request #453 in SNORT/snort3 from ~JOCORNET/snort3:fix_daqs_cmake_build to master

* commit 'c67f769d947b7201aa7d77044095f92eeec63e0c':
  build daq modules as .so (instead of .dylib)

build daq modules as .so (instead of .dylib)

make state machine allocation thread safe

more changes to support tcp sm as flyweight/singleton, delete redundant typecasts of tracker objects

use packet helper functions to determine packet direction (client or server)

Merge pull request #448 in SNORT/snort3 from dce_smb to master

* commit 'd0526e8cc127e06790ccd2e8151ca29a6356568c':
  Code review comments
  Fix build warning
  Port of dce request tracking infrastructure, SmbInspect function

Merge pull request #452 in SNORT/snort3 from stream_tcp_cleanup_tweak to master

* commit '76bd441402ad3a9c2e867fd281c980bdfd5d2fa1':
  flush queued segments first when cleaning up a session

flush queued segments first when cleaning up a session

Merge pull request #451 in SNORT/snort3 from stream_tcp_cleanup_fix to master

* commit '11085f3ece10fc5beac307a01991099564bc7e38':
  delete splitter on session restart, origanize cleanup sequence a little more logical
  simplify session cleanup/restart handling on timeout/reset/prune, rename paremeters to following coding standard, fix out of order tcp stat

delete splitter on session restart, origanize cleanup sequence a little more logical

fix packet_capture module ctor

build 195; fix packet_capture build

Merge pull request #450 in SNORT/snort3 from cap_build to master

* commit 'd70dd309fe7910be005401525cd7ad61604b1412':
  fixed broken build

simplify session cleanup/restart handling on timeout/reset/prune, rename paremeters to following coding standard, fix out of order tcp stat

fixed broken build

Merge pull request #445 in SNORT/snort3 from session_capture to master

* commit '76d3a46109a09326dc8e66d3fa66863f97e4287c':
  fixed lua default in packet capture
  added lua config option to start capture at startup
  added early bail to failed capture init. minor refactoring.
  removed old declarations
  stubbed pcap file handling. updated error handling in capture_init.
  fixed copyrights. removed useless code.
  fixed sigabrt. fixed command naming.
  fixed header guard. moved commands to CaptureModule. added option to build dynamically.
  added peg counts
  fixed output formatting for shell command
  fixed compiler warning
  added console interface for packet capture
  completed PacketCapture code with exception of shell interface
  bpf filter added.
  added bpf code. still need to fix segfault.
  added bpf code. still need to fix segfault.
  added bpf code. still need to fix segfault.
  packet capture works internally. no external interface. bpf under dev

fixed lua default in packet capture

Merge pull request #449 in SNORT/snort3 from ha-sc to master

* commit '043ff988caed8f785a000401c5ccd45b3f2e17e7':
  Fix two memory leaks, a few build warnings, and removed a remnant #include.

Fix two memory leaks, a few build warnings, and removed a remnant #include.

added lua config option to start capture at startup

added early bail to failed capture init. minor refactoring.

removed old declarations

Code review comments

stubbed pcap file handling. updated error handling in capture_init.

fixed copyrights. removed useless code.

Merge pull request #420 in SNORT/snort3 from ha-sc to master

* commit 'f805a510ec3a17a14f632c5af0004bbcfc078516':
  Forgot one fix..
  Code review fixes.
  Additional code review patches.
  Merge and review fixes.
  Code review fixes.
  Remove ha.h as an include in flow.h as it caused a build error for 'extra'
  Update CMake scripts and dev_notes.
  HA-SC effort.
  Interim ha commit
  Initial UDP HA.
  Review comment fixes.
  Fix some HA-SC memory leaks.
  Remove ha.h as an include in flow.h as it caused a build error for 'extra'
  Update CMake scripts and dev_notes.
  HA-SC effort.
  Interim ha commit
  Initial UDP HA.

Merge pull request #447 in SNORT/snort3 from unit_test to master

* commit 'de27ee8dd80f9dadd933bf2236a3f007c029cfa3':
  NHI unit testing

Forgot one fix..

Code review fixes.

Fix build warning

fixed sigabrt. fixed command naming.

fixed header guard. moved commands to CaptureModule. added option to build dynamically.