defrag: use 'struct timeval' for timeout tracking

Until now the time out handling in defrag was done using a single
uint32_t that tracked seconds. This lead to corner cases, where
defrag trackers could be timed out a little too early.

ipv6: set event on unsupported nh

If a next header / protocol is encountered that we can't handle (yet)
set an event. Disabled the rule by default.

    decode-event:ipv6.unknown_next_header;

ipv6: more robust ipv6 exthdr handling

Skip past Shim6, HIP and Mobility header.

Detect data after 'none' header.
    decode-event:ipv6.data_after_none_header;

ipv6: detect frag header reserved field non-zero

Frag Header length field is reserved, and should be set to 0.

    decode-event:ipv6.fh_non_zero_reserved_field;

ipv6: make exthdr parsing more robust

Improve data length checks. Detect PadN option with 0 length.

ipv6: set flag on type 0 routing header

Type 0 Routing headers are deprecated per RFC 5095.

This patch sets an decode event flag that can be matched on through:
    decode-event:ipv6.rh_type_0;

ipv6 defrag: fix unfragmentable exthdr handling

Fix or rather implement handling of unfragmentable exthdrs in ipv6.
The exthdr(s) appearing before the frag header were copied into the
reassembled packet correctly, however the stripping of the frag header
did not work correctly.

Example:
The common case is a frag header directly after the ipv6 header:

[ipv6 header]->[frag header]->[icmpv6 (part1)]
[ipv6 header]->[frag header]->[icmpv6 (part2)]

This would result in:
[ipv6 header]->[icmpv6]

The ipv6 headers 'next header' setting would be updated to point to
whatever the frag header was pointing to.

This would also happen when is this case:

[ipv6 header]->[hop header]->[frag header]->[icmpv6 (part1)]
[ipv6 header]->[hop header]->[frag header]->[icmpv6 (part2)]

The result would be:
[ipv6 header]->[hop header]->[icmpv6]

However, here too the ipv6 header would have been updated to point
to what the frag header pointed at. So it would consider the hop header
as if it was an ICMPv6 header, or whatever the frag header pointed at.

The result is that packets would not be correctly parsed, and thus this
issue can lead to evasion.

This patch implements handling of the unfragmentable part. In the first
segment that is stored in the list for reassembly, this patch detects
unfragmentable headers and updates it to have the last unfragmentable
header point to the layer after the frag header.

Also, the ipv6 headers 'next hdr' is only updated if no unfragmentable
headers are used. If they are used, the original value is correct.

Reported-By: Rafael Schaefer <rschaefer@ernw.de>
Bug #1244.

prscript: update URL

Buildbot server has been moved to another box.

magic: disable tests depending on magic version

Some tests depend on specific results by specific magic versions.
Disable these.

Update app-layer-htp.c

When keyword "boundary=" doesn't exist in the http_header, the value of r is 0 and this condition shouldn't return 0 instead 1;

travis-ci: use make check

This patch replaces unittest run by make check. It also install
coccinelle so we should have more test.

coccinelle: fix problem with coccinelle 1.0rc21

coccinelle 1.0rc21 has a problem with regular expression handling.
This result in a Fatal Error when test system detects an coding
error.

This patch fixes the problem by using a simple blob inside
semantic patch instead of using a regular expression to define
the function.

It also fixes add an optimization on matching suppressing a
useless <.. ..> construction.

Fixes have been suggested by Julia Lawall.

Profiling: fix compilation on CentOS5

Bug #1207

htp: init memuse atomics

In case of the spinlocked fallback code the lock was uninitialized.

ethtool: add missing include necessary for CentOS5

Fix compile-time error on old kernels and ethtool.h

Update log-file.c

test whether tx_ud is NULL

Add initial travis-ci integration.

Fix __thread configure check on Clang

AC_TRY_COMPILE puts the code in a function already, and Clang didn't like
the function within the function declaration. This lead to test failure.

Clang now properly detects __thread support.

valgrind/magic: add suppression for known issue

Add suppression for Ubuntu 14.04 64bit.

Fix lowercase table initialization (bug 1221)

The for loop needed to check for < 256, not < 255.

Update Changelog for 2.0.2 release

lua: fix liblua use on OS X with macports

Set the correct lua pkg-config name used by macports.

defrag: fix timeout setting when config is missing

When the config is missing, DefragPolicyGetHostTimeout will default
to returning -1. This will effectively set no timeout at all, leading
to defrag trackers being freed too early.

defrag: fix reconstruction

This patch is fixing an issue in defragmentation code. The
insertion of a fragment in the list of fragments is done with
respect to the offset of the fragment. But the code was using
the original offset of the fragment and not the one of the
new reconstructed fragment (which can be different in the
case of overlapping segment where the left part is trimmed).

This case could lead to some evasion techniques by causing
Suricata to analyse a different payload.

unix socket: fix valgrind issue

This patch fixes the following issue reported by valgrind:
 31 errors in context 1 of 1:
 Conditional jump or move depends on uninitialised value(s)
    at 0x8AB2F8: UnixSocketPcapFilesCheck (runmode-unix-socket.c:279)
    by 0x97725D: UnixCommandBackgroundTasks (unix-manager.c:368)
    by 0x97BC52: UnixManagerThread (unix-manager.c:884)
    by 0x6155F6D: start_thread (pthread_create.c:311)
    by 0x6E3A9CC: clone (clone.S:113)

The running field in PcapCommand was not initialized.

unix-manager: fix crash when client disconnect

This patch fixes an issue in unix socket handling. It is possible
that a socket did disconnect when analysing a command and because
the data treatment is done in a loop on clients this was leading
to a update of the list of clients during the loop. So we need
in fact to use TAILQ_FOREACH_SAFE instead of TAILQ_FOREACH.

Reported-by: Luigi Sandon <luigi.sandon@gmail.com>
Fix-suggested-by: Luigi Sandon <luigi.sandon@gmail.com>

Rework Tile CPU affinity setting to handle non-contiguous sets of CPUs.

It is possible to have a non-contiguous CPU set, which was not being
handled correctly on the TILE architecture.

Added a "rank" field in the ThreadVar to store the worker's rank separately
from the cpu for this case.

Fix bug #1206

PF_RING ZC uses clusters in the same way as PF_RING DNA. Therefore,
this bug can be fixed as it was fixed for DNA (bug #598).

htp: make htp state handling function more robust

Also, fix wrong cast that worked only by luck.

http: remove BUG_ON(1) statement

Remove BUG_ON(1) statement that was a leftover from debugging.

Bug #1189
Bug #1212

Fix issue #1214

When applying wildcard thresholds (with sid = 0 and/or gid = 0) it's wrong
to exit on the first signature already having an event filter. Indeed,
doing so results in the theshold not being applied to all subsequent
signatures. Change the code in order to skip signatures with event
filters instead of breaking out of the loop.

Fix libcap-ng configure typo.

Bug 1098: improve invalid pcre/R handling

When not using a file_data or similar 'sticky buffer', a pcre/R option
needs a content in the same buffer.

nflog: fix memory leaks

This fixes the following memory leaks:

[src/source-nflog.c:222]: (error) Memory leak: ntv
[src/source-nflog.c:236]: (error) Memory leak: ntv
[src/source-nflog.c:253]: (error) Memory leak: ntv
[src/source-nflog.c:258]: (error) Memory leak: ntv

cygwin: fix lua configure

Fix lua configure for cygwin. Tested with lua 5.1.5.

Fix live reload segv when startup isn't complete

If a live reload signal was given before the engine was fully started
up (e.g. pcap file thread waiting for a disk to spin up), a segv could
occur.

This patch only enables live reloads after the threads have been
started up completely.

Fix Coverity 1220098 and 1220099

*** CID 1220098:  Missing unlock  (LOCK)
/src/log-droplog.c: 195 in LogDropLogNetFilter()
189         SCMutexLock(&dlt->file_ctx->fp_mutex);
190
191         if (dlt->file_ctx->rotation_flag) {
192             dlt->file_ctx->rotation_flag  = 0;
193             if (SCConfLogReopen(dlt->file_ctx) != 0) {
194                 /* Rotation failed, error already logged. */
>>>     CID 1220098:  Missing unlock  (LOCK)
>>>     Returning without unlocking "dlt->file_ctx->fp_mutex".
195                 return TM_ECODE_FAILED;
196             }
197         }
198
199         if (dlt->file_ctx == NULL) {
200             return TM_ECODE_FAILED;

*** CID 1220099:  Dereference before null check  (REVERSE_INULL)
/src/log-droplog.c: 199 in LogDropLogNetFilter()
193             if (SCConfLogReopen(dlt->file_ctx) != 0) {
194                 /* Rotation failed, error already logged. */
195                 return TM_ECODE_FAILED;
196             }
197         }
198
>>>     CID 1220099:  Dereference before null check  (REVERSE_INULL)
>>>     Null-checking "dlt->file_ctx" suggests that it may be null, but it has already been dereferenced on all paths leading to the check.
199         if (dlt->file_ctx == NULL) {
200             return TM_ECODE_FAILED;
201         }
202
203         char srcip[46] = "";
204         char dstip[46] = "";

Fix Coverity 1220097

*** CID 1220097:  Missing unlock  (LOCK)
/src/log-file.c: 160 in LogFileWriteJsonRecord()
154             }
155         }
156
157         /* Bail early if no file pointer to write to (in the unlikely
158          * event file rotation failed. */
159         if (aft->file_ctx->fp == NULL) {
>>>     CID 1220097:  Missing unlock  (LOCK)
>>>     Returning without unlocking "aft->file_ctx->fp_mutex".
160             return;
161         }
162
163         FILE *fp = aft->file_ctx->fp;
164         char timebuf[64];
165         AppProto alproto = FlowGetAppProtocol(p->flow);

Unregister for file rotation notification when a context is
de-initialized.  Required for unix-socket mode where
contexts come and go.

Add signal based file rotation for:
- alert debug log
- fast log
- stats log
- dns log
- drop log
- file log
- http log
- tls log
- eve/json log

Add macros for access to the underlying buffer and offset.
Useful for using passing the buffer through to another writer
such as LogFileCtx.

Add a rotation flag to LogFileCtx which loggers can use to register
for log rotation.  Have the LogFileCtx handle the log rotation.

Registration for SIGHUP notification - for loggers interested
in file rotation on SIGHUP.

lua/luajit: use HAVE_LUA mostly

Only use HAVE_LUAJIT if things are done differently from HAVE_LUA,
like in the states pool.

lua: deal with FreeBSD and OpenBSD

FreeBSD pkg-config lua-5.1.pc, lib liblua-5.1.so
OpenBSD pkg-config lua51.pc, lib liblua5.1.so

Default (linux) pkg-config: lua5.1.pc, lib liblua5.1.so

lua: support regular lua C library

Not all systems have luajit or a need for luajit. For low bandwidth
and offline support regular lua may be sufficient.

profiling: use wider columns in keyword output

Use wider columns in keyword output so that even on high end sensors
the stats tables remain readable.

fix regression in 'make distclean' due to commit cd305c3a

the files under scripts/suricatasc/src are actual sources and should not
be cleaned

bugfix in debug mode:

removed function calls from SCReturnX macros

nflog: set socket timeout

Set socket timeout so that we can exit if there is no traffic.

It would hang after the SIGINT signal, until packets arived.

nflog: warn if buffer-size is larger than max-size

If buffer-size is larger than max size, give a warning and adjust
buffer-size to max-size.

dns: unify type to string logging utility

Both DNS loggers had their own CreateTypeString. This patch unifies
them.

dns: add names for common types

Add names for SRV, NAPTR, DS, RRSIG, NSEC, NSEC3 types.

nflog: fix typo rising->raising

nflog: improve error handling on NOBUFS

Don't fall through to handle_packet on any NOBUFS condition. Make
sure we catch all NOBUFS.

This patch adds the fields into PacketVars struct to setup a packet from a nflog message

Adds nflog option

Declare a wrapper to parse group option for nflog

Implements NFLOG runmode

Bootstraping NFLOG capture mode

Adds nflog error code

Updating the Tmm Id for declaration of nflog capture mode

Adds a configuration example for nflog support in suricata.yaml

Checks if libnetfilter_log is found on the system
and enable it if it's specified.

tls: check SSL3/TLS version per record

Set event if SSL3/TLS record isn't within the acceptable range.

dns: add tests for TXT response parsing

Add valid and invalid examples.

dns json: log TXT response data

Log TXT data in the rdata field.

dns: parse and store TXT responses

This way the TXT data can be logged by the loggers.

Ticket #1158

Update Changelog for 2.0.1

Update Changelog for 2.0.1rc1 changes

json output: don't set 'unknown' for missing data

Instead of setting 'unknown' or '<unknown>' just pass NULL to json_*
function, which results in omitting the data.

eve-log: swap ip/port pairs in dns answers

http-json: fix coverity warning

*** CID 1211009:  Bad bit shift operation  (BAD_SHIFT)
/src/output-json-http.c: 265 in JsonHttpLogJSON()
259         /* log custom fields if configured */
260         if (http_ctx->fields != 0)
261         {
262             HttpField f;
263             for (f = HTTP_FIELD_ACCEPT; f < HTTP_FIELD_SIZE; f++)
264             {
>>>     CID 1211009:  Bad bit shift operation  (BAD_SHIFT)
>>>     In expression "1 << f", left shifting by more than 31 bits has undefined behavior.  The shift amount, "f", is as much as 46.
265                 if ((http_ctx->fields & (1<<f)) != 0)
266                 {
267                     /* prevent logging a field twice if extended logging is
268                        enabled */
269                     if (((http_ctx->flags & LOG_HTTP_EXTENDED) == 0) ||
270                         ((http_ctx->flags & LOG_HTTP_EXTENDED) !=

________________________________________________________________________________________________________
*** CID 1211010:  Bad bit shift operation  (BAD_SHIFT)
/src/output-json-http.c: 492 in OutputHttpLogInitSub()
486                         {
487                             if ((strcmp(http_fields[f].config_field,
488                                        field->val) == 0) ||
489                                 (strcasecmp(http_fields[f].htp_field,
490                                             field->val) == 0))
491                             {
>>>     CID 1211010:  Bad bit shift operation  (BAD_SHIFT)
>>>     In expression "1 << f", left shifting by more than 31 bits has undefined behavior.  The shift amount, "f", is as much as 46.
492                                 http_ctx->fields |= (1<<f);
493                                 break;
494                             }
495                         }
496                     }
497                 }

unix-socket: reset logging api's properly

Lack of proper reset lead to logs not being written after the first
pcap had been processed.

stream: cleanup

StreamTcpSetDisableRawReassemblyFlag() has the same effect as
AppLayerParserTriggerRawStreamReassembly in that it will force the
raw reassembly to flush out asap. So it is redundant to call both.

stream: implement raw reassembly stop api

Implement StreamTcpSetDisableRawReassemblyFlag() which stops raw
reassembly for _NEW_ segments in a stream direction.

It is used only by TLS/SSL now, to flag the streams as encrypted.
Existing segments will still be reassembled and inspected, while
new segments won't be. This allows for pattern based inspection
of the TLS handshake.

Like is the case with completely disabled 'raw' reassembly, the
logic is that the segments are flagged as completed for 'raw' right
away. So they are not considered in raw reassembly anymore.

As no new segments will be considered, the chunk limit check will
return true on the next call.

stream: unify segment discard handling

Have a single function StreamTcpReturnSegmentCheck determine if a
segment is ready to be removed from the stream.

Handle FLOW_NOPAYLOAD_INSPECT in raw reassembly.

app-layer: improve no payload inspect flag

If setting APP_LAYER_PARSER_NO_INSPECTION_PAYLOAD, trigger raw
reassembly.

tls/heartbleed: fix test

Now that we continue to track ssl/tls after the handshake, we need
to fix tests that checked for the cutoff flags.

tls/heartbleed: improve encrypted logic

Don't assume that if the type field isn't 01 or 02 it's an encrypted
heartbeat. Instead, use our knowledge of the SSL state.

tls/heartbleed: formatting fixes

tls/heartbleed: add rule for invalid encrypted hb

Add rule to tls-events.rules to match on the invalid encrypted
heartbeat.

Look for Mismatched Encrypted HB request and response sizes, along with multiple in-flight HB requests from the same direction

detect: add more defensive checks for flow handling

Don't unconditionally deref f->alparser in detection through
DeStateFlowHasInspectableState(). In very rare cases it can
be NULL.

http-json: init 'fields' to 0 before setting it

httplog_ctx->fields would not be initialized before setting flags in
it:

Scanbuild:
output-json-http.c:491:46: warning: The left expression of the compound assignment is an uninitialized value. The computed value will also be garbage
                            http_ctx->fields |= (1<<f);
                            ~~~~~~~~~~~~~~~~ ^
1 warning generated.

Drmemory:
~~27874~~ Error #1: UNINITIALIZED READ: reading register eax
~~27874~~ # 0 JsonHttpLogJSON                       [/home/buildbot/qa/buildbot/donkey/drmemory/Suricata/src/output-json-http.c:260]
~~27874~~ # 1 JsonHttpLogger                        [/home/buildbot/qa/buildbot/donkey/drmemory/Suricata/src/output-json-http.c:375]

Just memset the whole structure right after initialition.

json: address custom output capability to http eve log review comments

json: add custom output capability to http eve log

doxygen: add source browser

rohash: fix potential bad shift

Fix issue detected byCoverity:

*** CID 1197756:  Bad bit shift operation  (BAD_SHIFT)
/src/util-rohash.c: 74 in ROHashInit()
68         }
69         if (hash_bits < 4 || hash_bits > 32) {
70             SCLogError(SC_ERR_HASH_TABLE_INIT, "invalid hash_bits setting, valid range is 4-32");
71             return NULL;
72         }
73
>>>     CID 1197756:  Bad bit shift operation  (BAD_SHIFT)
>>>     In expression "1U << hash_bits", left shifting by more than 31 bits has undefined behavior.  The shift amount, "hash_bits", is as much as 32.
74         uint32_t size = hashsize(hash_bits) * sizeof(ROHashTableOffsets);
75
76         ROHashTable *table = SCMalloc(sizeof(ROHashTable) + size);
77         if (unlikely(table == NULL)) {
78             SCLogError(SC_ERR_HASH_TABLE_INIT, "failed to alloc memory");
79             return NULL;

This was only a potential issue as ROHashInit was only called with
hash_bits 16 in the code.

Bug #1170.

af-packet: exit in case of a fatal error

During socket creation all error cases were leading to suricata to
retry the opening of capture. This patch updates this behavior to
have fatal and recoverable error case. In case of a fatal error,
suricata is leaving cleanly.

DAG: Pull some raw values out into defines.

DAG: Consistent code style.

DAG: Sync dag packet and drop counts to live device on exit for better exit
logging.

json-file: improve error handling

If the functions getting uri, etc fail. Return "unknown" instead of
NULL pointer. This improves consistency.

json-file: check pointer before using

A check was missing to see if ht_ud was not null before using the
pointer. This should be rare, but it can happen.

Reported-by: Will Metcalf

stream: improve retransmission handling

Improve retransmission handling in the CLOSE_WAIT state.

Bug #1180.

stream: update GAP detection

Change GAP detection logic. If we encounter missing data before
last_ack, we know we have missed data. The receiving host has ack'd
it already, so a retransmission of the missing data is highly
unlikely.

stream: fix raw reassembly flag issue

AppLayer reassembly correctly only flags a segment as done when it's
completely used in reassembly. Raw reassembly could flag a partially
used segment as complete as well. In this case the segment could be
discarded early. Further reassembly would miss data, leading to a
gap. Due to this, up to 'window size' bytes worth of segments could
remain in the session for a long time, leading to memory resource
pressure.

This patch sets the flag correctly.

stream: improve StreamTcpPruneSession

Check if a segment is done for the app-layer using
StreamTcpAppLayerSegmentProcessed instead of the flag directly so the
gap case works better.