]> git.ipfire.org Git - thirdparty/zstd.git/commitdiff
Update rolling hash
authorStella Lau <laus@fb.com>
Wed, 12 Jul 2017 01:13:26 +0000 (18:13 -0700)
committerStella Lau <laus@fb.com>
Wed, 12 Jul 2017 01:13:26 +0000 (18:13 -0700)
18 files changed:
contrib/long_distance_matching/ldm.c
contrib/long_distance_matching/ldm.h
contrib/long_distance_matching/main-ldm.c
contrib/long_distance_matching/util.c
contrib/long_distance_matching/util.h
contrib/long_distance_matching/versions/v0.1/ldm.c [new file with mode: 0644]
contrib/long_distance_matching/versions/v0.1/ldm.h [new file with mode: 0644]
contrib/long_distance_matching/versions/v0.1/main-ldm.c [new file with mode: 0644]
contrib/long_distance_matching/versions/v0.2/Makefile [new file with mode: 0644]
contrib/long_distance_matching/versions/v0.2/ldm.c [new file with mode: 0644]
contrib/long_distance_matching/versions/v0.2/ldm.h [new file with mode: 0644]
contrib/long_distance_matching/versions/v0.2/main-ldm.c [new file with mode: 0644]
contrib/long_distance_matching/versions/v0.3/Makefile [new file with mode: 0644]
contrib/long_distance_matching/versions/v0.3/ldm.c [new file with mode: 0644]
contrib/long_distance_matching/versions/v0.3/ldm.h [new file with mode: 0644]
contrib/long_distance_matching/versions/v0.3/main-ldm.c [new file with mode: 0644]
contrib/long_distance_matching/versions/v0.3/util.c [new file with mode: 0644]
contrib/long_distance_matching/versions/v0.3/util.h [new file with mode: 0644]

index 1dedf5c37988fcfdbb45236fddba125c8bf489f9..ca4f0f2cf7f6e86d5948954585a95a8da35953cf 100644 (file)
@@ -9,7 +9,7 @@
 
 #define HASH_EVERY 1
 
-#define LDM_MEMORY_USAGE 16
+#define LDM_MEMORY_USAGE 22
 #define LDM_HASHLOG (LDM_MEMORY_USAGE-2)
 #define LDM_HASHTABLESIZE (1 << (LDM_MEMORY_USAGE))
 #define LDM_HASHTABLESIZE_U32 ((LDM_HASHTABLESIZE) >> 2)
 
 #define LDM_OFFSET_SIZE 4
 
-#define WINDOW_SIZE (1 << 20)
+#define WINDOW_SIZE (1 << 23)
 #define MAX_WINDOW_SIZE 31
 #define HASH_SIZE 4
-#define LDM_HASH_LENGTH 4
+#define LDM_HASH_LENGTH 100
+
+// Should be multiple of four
 #define MINMATCH 4
 
 #define ML_BITS 4
@@ -28,7 +30,9 @@
 #define RUN_BITS (8-ML_BITS)
 #define RUN_MASK ((1U<<RUN_BITS)-1)
 
-//#define LDM_ROLLING_HASH
+#define LDM_ROLLING_HASH
+#define COMPUTE_STATS
+//#define RUN_CHECKS
 //#define LDM_DEBUG
 
 typedef  uint8_t BYTE;
@@ -41,6 +45,7 @@ typedef uint32_t offset_t;
 typedef uint32_t hash_t;
 typedef signed char schar;
 
+
 typedef struct LDM_hashEntry {
   offset_t offset;
 } LDM_hashEntry;
@@ -50,6 +55,9 @@ typedef struct LDM_compressStats {
   U32 totalMatchLength;
   U32 totalLiteralLength;
   U64 totalOffset;
+
+  U32 numCollisions;
+  U32 numHashInserts;
 } LDM_compressStats;
 
 static void LDM_printCompressStats(const LDM_compressStats *stats) {
@@ -62,6 +70,11 @@ static void LDM_printCompressStats(const LDM_compressStats *stats) {
          ((double)stats->totalLiteralLength) / (double)stats->numMatches);
   printf("Average offset length: %.1f\n",
          ((double)stats->totalOffset) / (double)stats->numMatches);
+  printf("Num collisions, num hash inserts, %% collisions: %u, %u, %.3f\n",
+         stats->numCollisions, stats->numHashInserts,
+         stats->numHashInserts == 0 ?
+            1.0 : (100.0 * (double)stats->numCollisions) /
+                  (double)stats->numHashInserts);
   printf("=====================\n");
 }
 
@@ -95,17 +108,43 @@ typedef struct LDM_CCtx {
   const BYTE *nextIp;
   hash_t nextHash;                    /* Hash corresponding to nextIp */
 
+  // Members for rolling hash.
+  U32 lastSum;
+  U32 nextSum;
+
   unsigned step;
+
+  // DEBUG
+  const BYTE *DEBUG_setNextHash;
 } LDM_CCtx;
 
+static int LDM_isValidMatch(const BYTE *p, const BYTE *match) {
+  U16 lengthLeft = MINMATCH;
+  const BYTE *curP = p;
+  const BYTE *curMatch = match;
+
+  for (; lengthLeft >= 8; lengthLeft -= 8) {
+    if (LDM_read64(curP) != LDM_read64(curMatch)) {
+      return 0;
+    }
+    curP += 8;
+    curMatch += 8;
+  }
+  if (lengthLeft > 0) {
+    return LDM_read32(curP) == LDM_read32(curMatch);
+  }
+  return 1;
+}
+
+
+
 #ifdef LDM_ROLLING_HASH
 /**
  * Convert a sum computed from LDM_getRollingHash to a hash value in the range
  * of the hash table.
  */
 static hash_t LDM_sumToHash(U32 sum) {
-  return sum % (LDM_HASHTABLESIZE >> 2);
-//  return sum & (LDM_HASHTABLESIZE - 1);
+  return sum & (LDM_HASH_SIZE_U32 - 1);
 }
 
 static U32 LDM_getRollingHash(const char *data, U32 len) {
@@ -126,18 +165,102 @@ static U32 LDM_getRollingHash(const char *data, U32 len) {
   return (s1 & 0xffff) + (s2 << 16);
 }
 
-static hash_t LDM_hashPosition(const void * const p) {
-  return LDM_sumToHash(LDM_getRollingHash((const char *)p, LDM_HASH_LENGTH));
-}
-
 typedef struct LDM_sumStruct {
   U16 s1, s2;
 } LDM_sumStruct;
 
+static U32 LDM_updateRollingHash(U32 sum, U32 len,
+                                 schar toRemove, schar toAdd) {
+  U32 s1 = (sum & 0xffff) - toRemove + toAdd;
+  U32 s2 = (sum >> 16) - (toRemove * len) + s1;
+
+  return (s1 & 0xffff) + (s2 << 16);
+}
+
+
+/*
+static hash_t LDM_hashPosition(const void * const p) {
+  return LDM_sumToHash(LDM_getRollingHash((const char *)p, LDM_HASH_LENGTH));
+}
+*/
+
+/*
 static void LDM_getRollingHashParts(U32 sum, LDM_sumStruct *sumStruct) {
   sumStruct->s1 = sum & 0xffff;
   sumStruct->s2 = sum >> 16;
 }
+*/
+
+static void LDM_setNextHash(LDM_CCtx *cctx) {
+  U32 check;
+
+#ifdef RUN_CHECKS
+  if ((cctx->nextIp - cctx->ibase != 1) &&
+      (cctx->nextIp - cctx->DEBUG_setNextHash != 1)) {
+    printf("CHECK debug fail: %zu %zu\n", cctx->nextIp - cctx->ibase,
+            cctx->DEBUG_setNextHash - cctx->ibase);
+  }
+
+  cctx->DEBUG_setNextHash = cctx->nextIp;
+#endif
+
+  cctx->nextSum = LDM_getRollingHash((const char *)cctx->nextIp, LDM_HASH_LENGTH);
+  /*
+  check = LDM_updateRollingHash(
+      cctx->lastSum, LDM_HASH_LENGTH,
+      (schar)((cctx->lastPosHashed)[0]),
+      (schar)((cctx->lastPosHashed)[LDM_HASH_LENGTH]));
+      */
+
+#ifdef RUN_CHECKS
+  if (check != cctx->nextSum) {
+    printf("CHECK: setNextHash failed %u %u\n", check, cctx->nextSum);
+//    printf("INFO: %u %u %u\n", LDM_read32(cctx->nextIp),
+  } else {
+//    printf("CHECK: setNextHash passed\n");
+  }
+#endif
+  cctx->nextHash = LDM_sumToHash(cctx->nextSum);
+
+#ifdef RUN_CHECKS
+  if ((cctx->nextIp - cctx->lastPosHashed) != 1) {
+    printf("setNextHash: nextIp != lastPosHashed + 1. %zu %zu %zu\n",
+            cctx->nextIp - cctx->ibase, cctx->lastPosHashed - cctx->ibase,
+            cctx->ip - cctx->ibase);
+  }
+#endif
+
+}
+
+static void LDM_putHashOfCurrentPositionFromHash(
+    LDM_CCtx *cctx, hash_t hash, U32 sum) {
+  /*
+  if (((cctx->ip - cctx->ibase) & HASH_EVERY) != HASH_EVERY) {
+    return;
+  }
+  */
+#ifdef COMPUTE_STATS
+  if (cctx->stats.numHashInserts < LDM_HASHTABLESIZE_U32) {
+    offset_t offset = (cctx->hashTable)[hash].offset;
+    cctx->stats.numHashInserts++;
+    if (offset == 0 && !LDM_isValidMatch(cctx->ip, offset + cctx->ibase)) {
+      cctx->stats.numCollisions++;
+    }
+  }
+#endif
+  (cctx->hashTable)[hash] = (LDM_hashEntry){ (hash_t)(cctx->ip - cctx->ibase) };
+  cctx->lastPosHashed = cctx->ip;
+  cctx->lastHash = hash;
+  cctx->lastSum = sum;
+}
+
+static void LDM_putHashOfCurrentPosition(LDM_CCtx *cctx) {
+  U32 sum = LDM_getRollingHash((const char *)cctx->ip, LDM_HASH_LENGTH);
+  hash_t hash = LDM_sumToHash(sum);
+//  hash_t hash = LDM_hashPosition(cctx->ip);
+  LDM_putHashOfCurrentPositionFromHash(cctx, hash, sum);
+//  printf("Offset %zu\n", cctx->ip - cctx->ibase);
+}
 
 #else
 static hash_t LDM_hash(U32 sequence) {
@@ -147,26 +270,30 @@ static hash_t LDM_hash(U32 sequence) {
 static hash_t LDM_hashPosition(const void * const p) {
   return LDM_hash(LDM_read32(p));
 }
-#endif
-
-/*
-static hash_t LDM_hash5(U64 sequence) {
-  static const U64 prime5bytes = 889523592379ULL;
-  static const U64 prime8bytes = 11400714785074694791ULL;
-  const U32 hashLog = LDM_HASHLOG;
-  if (LDM_isLittleEndian())
-    return (((sequence << 24) * prime5bytes) >> (64 - hashLog));
-  else
-    return (((sequence >> 24) * prime8bytes) >> (64 - hashLog));
-}
-*/
 
 static void LDM_putHashOfCurrentPositionFromHash(
     LDM_CCtx *cctx, hash_t hash) {
+  /*
   if (((cctx->ip - cctx->ibase) & HASH_EVERY) != HASH_EVERY) {
     return;
   }
+  */
+#ifdef COMPUTE_STATS
+  if (cctx->stats.numHashInserts < LDM_HASHTABLESIZE_U32) {
+    offset_t offset = (cctx->hashTable)[hash].offset;
+    cctx->stats.numHashInserts++;
+    if (offset == 0 && !LDM_isValidMatch(cctx->ip, offset + cctx->ibase)) {
+      cctx->stats.numCollisions++;
+    }
+  }
+#endif
+
   (cctx->hashTable)[hash] = (LDM_hashEntry){ (hash_t)(cctx->ip - cctx->ibase) };
+#ifdef RUN_CHECKS
+  if (cctx->ip - cctx->lastPosHashed != 1) {
+    printf("putHashError\n");
+  }
+#endif
   cctx->lastPosHashed = cctx->ip;
   cctx->lastHash = hash;
 }
@@ -176,23 +303,33 @@ static void LDM_putHashOfCurrentPosition(LDM_CCtx *cctx) {
   LDM_putHashOfCurrentPositionFromHash(cctx, hash);
 }
 
-static const BYTE *LDM_get_position_on_hash(
+#endif
+
+/*
+static hash_t LDM_hash5(U64 sequence) {
+  static const U64 prime5bytes = 889523592379ULL;
+  static const U64 prime8bytes = 11400714785074694791ULL;
+  const U32 hashLog = LDM_HASHLOG;
+  if (LDM_isLittleEndian())
+    return (((sequence << 24) * prime5bytes) >> (64 - hashLog));
+  else
+    return (((sequence >> 24) * prime8bytes) >> (64 - hashLog));
+}
+*/
+
+
+static const BYTE *LDM_getPositionOnHash(
     hash_t h, void *tableBase, const BYTE *srcBase) {
   const LDM_hashEntry * const hashTable = (LDM_hashEntry *)tableBase;
   return hashTable[h].offset + srcBase;
 }
 
-static BYTE LDM_read_byte(const void *memPtr) {
-  BYTE val;
-  memcpy(&val, memPtr, 1);
-  return val;
-}
 
 static unsigned LDM_count(const BYTE *pIn, const BYTE *pMatch,
                           const BYTE *pInLimit) {
   const BYTE * const pStart = pIn;
   while (pIn < pInLimit - 1) {
-    BYTE const diff = LDM_read_byte(pMatch) ^ LDM_read_byte(pIn);
+    BYTE const diff = LDM_readByte(pMatch) ^ LDM_readByte(pIn);
     if (!diff) {
       pIn++;
       pMatch++;
@@ -220,7 +357,11 @@ static void LDM_initializeCCtx(LDM_CCtx *cctx,
   cctx->ip = cctx->ibase;
   cctx->iend = cctx->ibase + srcSize;
 
+#ifdef LDM_ROLLING_HASH
+  cctx->ihashLimit = cctx->iend - LDM_HASH_LENGTH;
+#else
   cctx->ihashLimit = cctx->iend - HASH_SIZE;
+#endif
   cctx->imatchLimit = cctx->iend - MINMATCH;
 
   cctx->obase = (BYTE *)dst;
@@ -232,11 +373,46 @@ static void LDM_initializeCCtx(LDM_CCtx *cctx,
   memset(cctx->hashTable, 0, sizeof(cctx->hashTable));
 
   cctx->lastPosHashed = NULL;
-  cctx->nextIp = NULL;
 
   cctx->step = 1;
+  cctx->nextIp = cctx->ip + cctx->step;
+
+  cctx->DEBUG_setNextHash = 0;
 }
 
+#ifdef LDM_ROLLING_HASH
+static int LDM_findBestMatch(LDM_CCtx *cctx, const BYTE **match) {
+  cctx->nextIp = cctx->ip + cctx->step;
+
+  do {
+    hash_t h;
+    U32 sum;
+//    printf("Call A\n");
+    LDM_setNextHash(cctx);
+//    printf("End call a\n");
+    h = cctx->nextHash;
+    sum = cctx->nextSum;
+    cctx->ip = cctx->nextIp;
+    cctx->nextIp += cctx->step;
+
+    if (cctx->ip > cctx->imatchLimit) {
+      return 1;
+    }
+
+    *match = LDM_getPositionOnHash(h, cctx->hashTable, cctx->ibase);
+
+//    // Compute cctx->nextSum and cctx->nextHash from cctx->nextIp.
+//    LDM_setNextHash(cctx);
+    LDM_putHashOfCurrentPositionFromHash(cctx, h, sum);
+
+//    printf("%u %u\n", cctx->lastHash, cctx->nextHash);
+  } while (cctx->ip - *match > WINDOW_SIZE ||
+           !LDM_isValidMatch(cctx->ip, *match));
+//           LDM_read64(*match) != LDM_read64(cctx->ip));
+  LDM_setNextHash(cctx);
+  return 0;
+}
+#else
 static int LDM_findBestMatch(LDM_CCtx *cctx, const BYTE **match) {
   cctx->nextIp = cctx->ip;
 
@@ -245,33 +421,131 @@ static int LDM_findBestMatch(LDM_CCtx *cctx, const BYTE **match) {
     cctx->ip = cctx->nextIp;
     cctx->nextIp += cctx->step;
 
-    if (cctx->nextIp > cctx->imatchLimit) {
+    if (cctx->ip > cctx->imatchLimit) {
       return 1;
     }
 
-    *match = LDM_get_position_on_hash(h, cctx->hashTable, cctx->ibase);
+    *match = LDM_getPositionOnHash(h, cctx->hashTable, cctx->ibase);
 
     cctx->nextHash = LDM_hashPosition(cctx->nextIp);
     LDM_putHashOfCurrentPositionFromHash(cctx, h);
+
   } while (cctx->ip - *match > WINDOW_SIZE ||
-           LDM_read64(*match) != LDM_read64(cctx->ip));
+           !LDM_isValidMatch(cctx->ip, *match));
   return 0;
 }
 
+#endif
+
+/**
+ * Write current block (literals, literal length, match offset,
+ * match length).
+ *
+ * Update input pointer, inserting hashes into hash table along the
+ * way.
+ */
+static void LDM_outputBlock(LDM_CCtx *cctx, const BYTE *match) {
+  unsigned const literalLength = (unsigned)(cctx->ip - cctx->anchor);
+  unsigned const offset = cctx->ip - match;
+  unsigned const matchLength = LDM_count(
+      cctx->ip + MINMATCH, match + MINMATCH, cctx->ihashLimit);
+  BYTE *token = cctx->op++;
+
+  cctx->stats.totalLiteralLength += literalLength;
+  cctx->stats.totalOffset += offset;
+  cctx->stats.totalMatchLength += matchLength + MINMATCH;
+
+  /* Encode the literal length. */
+  if (literalLength >= RUN_MASK) {
+    int len = (int)literalLength - RUN_MASK;
+    *token = (RUN_MASK << ML_BITS);
+    for (; len >= 255; len -= 255) {
+      *(cctx->op)++ = 255;
+    }
+    *(cctx->op)++ = (BYTE)len;
+  } else {
+    *token = (BYTE)(literalLength << ML_BITS);
+  }
+
+  /* Encode the literals. */
+  memcpy(cctx->op, cctx->anchor, literalLength);
+  cctx->op += literalLength;
+
+  /* Encode the offset. */
+  LDM_write32(cctx->op, offset);
+  cctx->op += LDM_OFFSET_SIZE;
+
+  /* Encode match length */
+  if (matchLength >= ML_MASK) {
+    unsigned matchLengthRemaining = matchLength;
+    *token += ML_MASK;
+    matchLengthRemaining -= ML_MASK;
+    LDM_write32(cctx->op, 0xFFFFFFFF);
+    while (matchLengthRemaining >= 4*0xFF) {
+      cctx->op += 4;
+      LDM_write32(cctx->op, 0xffffffff);
+      matchLengthRemaining -= 4*0xFF;
+    }
+    cctx->op += matchLengthRemaining / 255;
+    *(cctx->op)++ = (BYTE)(matchLengthRemaining % 255);
+  } else {
+    *token += (BYTE)(matchLength);
+  }
+
+//  LDM_setNextHash(cctx);
+//  cctx->ip = cctx->lastPosHashed + 1;
+//  cctx->nextIp = cctx->ip + cctx->step;
+//  printf("HERE: %zu %zu %zu\n", cctx->ip - cctx->ibase,
+//         cctx->lastPosHashed - cctx->ibase, cctx->nextIp - cctx->ibase);
+
+  cctx->nextIp = cctx->ip + cctx->step;
+
+  while (cctx->ip < cctx->anchor + MINMATCH + matchLength + literalLength) {
+//    printf("Loop\n");
+    if (cctx->ip > cctx->lastPosHashed) {
+      LDM_putHashOfCurrentPosition(cctx);
+#ifdef LDM_ROLLING_HASH
+      LDM_setNextHash(cctx);
+#endif
+    }
+    /*
+    printf("Call b %zu %zu %zu\n",
+            cctx->lastPosHashed - cctx->ibase,
+            cctx->nextIp - cctx->ibase,
+            cctx->ip - cctx->ibase);
+            */
+//    printf("end call b\n");
+    cctx->ip++;
+    cctx->nextIp++;
+  }
+
+//  printf("There: %zu %zu\n", cctx->ip - cctx->ibase, cctx->lastPosHashed - cctx->ibase);
+}
+
 // TODO: srcSize and maxDstSize is unused
 size_t LDM_compress(const void *src, size_t srcSize,
                     void *dst, size_t maxDstSize) {
   LDM_CCtx cctx;
+  U32 tmp_hash;
   LDM_initializeCCtx(&cctx, src, srcSize, dst, maxDstSize);
 
   /* Hash the first position and put it into the hash table. */
   LDM_putHashOfCurrentPosition(&cctx);
+#ifdef LDM_ROLLING_HASH
+//  LDM_setNextHash(&cctx);
+//  tmp_hash = LDM_updateRollingHash(cctx.lastSum, LDM_HASH_LENGTH,
+//                                   cctx.ip[0], cctx.ip[LDM_HASH_LENGTH]);
+//  printf("Update test: %u %u\n", tmp_hash, cctx.nextSum);
+//  cctx.ip++;
+#else
   cctx.ip++;
   cctx.nextHash = LDM_hashPosition(cctx.ip);
+#endif
 
   // TODO: loop condition is not accurate.
   while (1) {
     const BYTE *match;
+//    printf("Start of loop\n");
 
     /**
      * Find a match.
@@ -282,6 +556,7 @@ size_t LDM_compress(const void *src, size_t srcSize,
     if (LDM_findBestMatch(&cctx, &match) != 0) {
       goto _last_literals;
     }
+//    printf("End of match finding\n");
 
     cctx.stats.numMatches++;
 
@@ -290,6 +565,7 @@ size_t LDM_compress(const void *src, size_t srcSize,
      */
     while (cctx.ip > cctx.anchor && match > cctx.ibase &&
            cctx.ip[-1] == match[-1]) {
+//      printf("Catch up\n");
       cctx.ip--;
       match--;
     }
@@ -298,67 +574,24 @@ size_t LDM_compress(const void *src, size_t srcSize,
      * Write current block (literals, literal length, match offset, match
      * length) and update pointers and hashes.
      */
-    {
-      unsigned const literalLength = (unsigned)(cctx.ip - cctx.anchor);
-      unsigned const offset = cctx.ip - match;
-      unsigned const matchLength = LDM_count(
-          cctx.ip + MINMATCH, match + MINMATCH, cctx.ihashLimit);
-      BYTE *token = cctx.op++;
-
-      cctx.stats.totalLiteralLength += literalLength;
-      cctx.stats.totalOffset += offset;
-      cctx.stats.totalMatchLength += matchLength + MINMATCH;
-
-      /* Encode the literal length. */
-      if (literalLength >= RUN_MASK) {
-        int len = (int)literalLength - RUN_MASK;
-        *token = (RUN_MASK << ML_BITS);
-        for (; len >= 255; len -= 255) {
-          *(cctx.op)++ = 255;
-        }
-        *(cctx.op)++ = (BYTE)len;
-      } else {
-        *token = (BYTE)(literalLength << ML_BITS);
-      }
-
-      /* Encode the literals. */
-      memcpy(cctx.op, cctx.anchor, literalLength);
-      cctx.op += literalLength;
-
-      /* Encode the offset. */
-      LDM_write32(cctx.op, offset);
-      cctx.op += LDM_OFFSET_SIZE;
-
-      /* Encode match length */
-      if (matchLength >= ML_MASK) {
-        unsigned matchLengthRemaining = matchLength;
-        *token += ML_MASK;
-        matchLengthRemaining -= ML_MASK;
-        LDM_write32(cctx.op, 0xFFFFFFFF);
-        while (matchLengthRemaining >= 4*0xFF) {
-          cctx.op += 4;
-          LDM_write32(cctx.op, 0xffffffff);
-          matchLengthRemaining -= 4*0xFF;
-        }
-        cctx.op += matchLengthRemaining / 255;
-        *(cctx.op)++ = (BYTE)(matchLengthRemaining % 255);
-      } else {
-        *token += (BYTE)(matchLength);
-      }
-
-      /* Update input pointer, inserting hashes into hash table along the
-       * way.
-       */
-      while (cctx.ip < cctx.anchor + MINMATCH + matchLength + literalLength) {
-        LDM_putHashOfCurrentPosition(&cctx);
-        cctx.ip++;
-      }
-    }
+    LDM_outputBlock(&cctx, match);
+//    printf("End of loop\n");
 
     // Set start of next block to current input pointer.
     cctx.anchor = cctx.ip;
     LDM_putHashOfCurrentPosition(&cctx);
-    cctx.nextHash = LDM_hashPosition(++cctx.ip);
+#ifndef LDM_ROLLING_HASH
+    cctx.ip++;
+#endif
+
+    /*
+    LDM_putHashOfCurrentPosition(&cctx);
+    printf("Call c\n");
+    LDM_setNextHash(&cctx);
+    printf("End call c\n");
+    cctx.ip++;
+    cctx.nextIp++;
+    */
   }
 _last_literals:
   /* Encode the last literals (no more matches). */
@@ -453,7 +686,7 @@ size_t LDM_decompress(const void *src, size_t compressSize,
     /* Copy match. */
     cpy = dctx.op + length;
 
-    // Inefficient for now
+    // Inefficient for now.
     while (match < cpy - offset && dctx.op < dctx.oend) {
       *(dctx.op)++ = *match++;
     }
@@ -461,4 +694,20 @@ size_t LDM_decompress(const void *src, size_t compressSize,
   return dctx.op - (BYTE *)dst;
 }
 
+void LDM_test(const void *src, size_t srcSize,
+              void *dst, size_t maxDstSize) {
+#ifdef LDM_ROLLING_HASH
+  const BYTE *ip = (const BYTE *)src + 1125;
+  U32 sum = LDM_getRollingHash((const char *)ip, LDM_HASH_LENGTH);
+  U32 sum2;
+  ++ip;
+  for (; ip < (const BYTE *)src + 1125 + 100; ip++) {
+    sum2 = LDM_updateRollingHash(sum, LDM_HASH_LENGTH,
+                                 ip[-1], ip[LDM_HASH_LENGTH - 1]);
+    sum = LDM_getRollingHash((const char *)ip, LDM_HASH_LENGTH);
+    printf("TEST HASH: %zu %u %u\n", ip - (const BYTE *)src, sum, sum2);
+  }
+#endif
+}
+
 
index 287d444dd90e53252e3538a576a6624c1c57d047..a34faac4f20bca1d65e3a6f0d5322b8dcfba2312 100644 (file)
@@ -16,4 +16,7 @@ size_t LDM_decompress(const void *src, size_t srcSize,
 void LDM_readHeader(const void *src, size_t *compressSize,
                     size_t *decompressSize);
 
+void LDM_test(const void *src, size_t srcSize,
+              void *dst, size_t maxDstSize);
+
 #endif /* LDM_H */
index 724d735dddf4349071671bd72bb0da6894a0d289..f8ae54698bc3a1b1a258d4eb5823f43668aab548 100644 (file)
@@ -15,6 +15,7 @@
 
 // #define BUF_SIZE 16*1024  // Block size
 #define DEBUG
+//#define TEST
 
 //#define ZSTD
 
@@ -74,6 +75,11 @@ static int compress(const char *fname, const char *oname) {
       return 1;
   }
 
+#ifdef TEST
+  LDM_test(src, statbuf.st_size,
+           dst + LDM_HEADER_SIZE, statbuf.st_size);
+#endif
+
 #ifdef ZSTD
   compressSize = ZSTD_compress(dst, statbuf.st_size,
                                   src, statbuf.st_size, 1);
@@ -144,11 +150,6 @@ static int decompress(const char *fname, const char *oname) {
   /* Read the header. */
   LDM_readHeader(src, &compressSize, &decompressSize);
 
-#ifdef DEBUG
-  printf("Size, compressSize, decompressSize: %zu %zu %zu\n",
-         (size_t)statbuf.st_size, compressSize, decompressSize);
-#endif
-
   /* Go to the location corresponding to the last byte. */
   if (lseek(fdout, decompressSize - 1, SEEK_SET) == -1) {
     perror("lseek error");
@@ -256,7 +257,7 @@ int main(int argc, const char *argv[]) {
         return 1;
     }
     gettimeofday(&tv2, NULL);
-    printf("Total time = %f seconds\n",
+    printf("Total compress time = %f seconds\n",
            (double) (tv2.tv_usec - tv1.tv_usec) / 1000000 +
            (double) (tv2.tv_sec - tv1.tv_sec));
   }
@@ -270,7 +271,7 @@ int main(int argc, const char *argv[]) {
         return 1;
     }
     gettimeofday(&tv2, NULL);
-    printf("Total time = %f seconds\n",
+    printf("Total decompress time = %f seconds\n",
           (double) (tv2.tv_usec - tv1.tv_usec) / 1000000 +
           (double) (tv2.tv_sec - tv1.tv_sec));
   }
index 9ea4ca1e5f2e9d1677a462dc7882cca0472aae01..70fcbc2ce43711af66d3a9d1bf54bd90022ece36 100644 (file)
@@ -61,4 +61,9 @@ void LDM_copy8(void *dst, const void *src) {
   memcpy(dst, src, 8);
 }
 
+BYTE LDM_readByte(const void *memPtr) {
+  BYTE val;
+  memcpy(&val, memPtr, 1);
+  return val;
+}
 
index 90726412e19aad601e6229ce9ca546e28f37aa13..d1c3c999b19f8c6ac09fc61c0360264add5de3e3 100644 (file)
@@ -19,5 +19,7 @@ uint64_t LDM_read64(const void *ptr);
 
 void LDM_copy8(void *dst, const void *src);
 
+uint8_t LDM_readByte(const void *ptr);
+
 
 #endif /* LDM_UTIL_H */
diff --git a/contrib/long_distance_matching/versions/v0.1/ldm.c b/contrib/long_distance_matching/versions/v0.1/ldm.c
new file mode 100644 (file)
index 0000000..266425f
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,394 @@
+#include <stdlib.h>
+#include <string.h>
+#include <stdint.h>
+#include <stdio.h>
+
+#include "ldm.h"
+
+#define LDM_MEMORY_USAGE 14
+#define LDM_HASHLOG (LDM_MEMORY_USAGE-2)
+#define LDM_HASHTABLESIZE (1 << (LDM_MEMORY_USAGE))
+#define LDM_HASHTABLESIZE_U32 ((LDM_HASHTABLESIZE) >> 2)
+#define LDM_HASH_SIZE_U32 (1 << (LDM_HASHLOG))
+
+#define WINDOW_SIZE (1 << 20)
+#define MAX_WINDOW_SIZE 31
+#define HASH_SIZE 4
+#define MINMATCH 4
+
+#define ML_BITS 4
+#define ML_MASK ((1U<<ML_BITS)-1)
+#define RUN_BITS (8-ML_BITS)
+#define RUN_MASK ((1U<<RUN_BITS)-1)
+
+//#define LDM_DEBUG
+
+typedef  uint8_t BYTE;
+typedef uint16_t U16;
+typedef uint32_t U32;
+typedef  int32_t S32;
+typedef uint64_t U64;
+
+typedef uint64_t tag;
+
+static unsigned LDM_isLittleEndian(void)
+{
+    const union { U32 u; BYTE c[4]; } one = { 1 };
+    return one.c[0];
+}
+
+static U16 LDM_read16(const void *memPtr) {
+  U16 val;
+  memcpy(&val, memPtr, sizeof(val));
+  return val;
+}
+
+static U16 LDM_readLE16(const void *memPtr) {
+  if (LDM_isLittleEndian()) {
+    return LDM_read16(memPtr);
+  } else {
+    const BYTE *p = (const BYTE *)memPtr;
+    return (U16)((U16)p[0] + (p[1] << 8));
+  }
+}
+
+static void LDM_write32(void *memPtr, U32 value) {
+  memcpy(memPtr, &value, sizeof(value));
+}
+
+static void LDM_write16(void *memPtr, U16 value) {
+  memcpy(memPtr, &value, sizeof(value));
+}
+
+static void LDM_writeLE16(void *memPtr, U16 value) {
+  if (LDM_isLittleEndian()) {
+    LDM_write16(memPtr, value);
+  } else {
+    BYTE* p = (BYTE*)memPtr;
+    p[0] = (BYTE) value;
+    p[1] = (BYTE)(value>>8);
+  }
+}
+
+static U32 LDM_read32(const void *ptr) {
+  return *(const U32 *)ptr;
+}
+
+static U64 LDM_read64(const void *ptr) {
+  return *(const U64 *)ptr;
+}
+
+
+static void LDM_copy8(void *dst, const void *src) {
+  memcpy(dst, src, 8);
+}
+
+static void LDM_wild_copy(void *dstPtr, const void *srcPtr, void *dstEnd) {
+  BYTE *d = (BYTE *)dstPtr;
+  const BYTE *s = (const BYTE *)srcPtr;
+  BYTE * const e = (BYTE *)dstEnd;
+
+  do {
+    LDM_copy8(d, s);
+    d += 8;
+    s += 8;
+  } while (d < e);
+
+}
+
+struct hash_entry {
+  U64 offset;
+  tag t;
+};
+
+static U32 LDM_hash(U32 sequence) {
+  return ((sequence * 2654435761U) >> ((32)-LDM_HASHLOG));
+}
+
+static U32 LDM_hash5(U64 sequence) {
+  static const U64 prime5bytes = 889523592379ULL;
+  static const U64 prime8bytes = 11400714785074694791ULL;
+  const U32 hashLog = LDM_HASHLOG;
+  if (LDM_isLittleEndian())
+    return (U32)(((sequence << 24) * prime5bytes) >> (64 - hashLog));
+  else
+    return (U32)(((sequence >> 24) * prime8bytes) >> (64 - hashLog));
+}
+
+static U32 LDM_hash_position(const void * const p) {
+  return LDM_hash(LDM_read32(p));
+}
+
+static void LDM_put_position_on_hash(const BYTE *p, U32 h, void *tableBase,
+                                     const BYTE *srcBase) {
+  U32 *hashTable = (U32 *) tableBase;
+  hashTable[h] = (U32)(p - srcBase);
+}
+
+static void LDM_put_position(const BYTE *p, void *tableBase,
+                             const BYTE *srcBase) {
+  U32 const h = LDM_hash_position(p);
+  LDM_put_position_on_hash(p, h, tableBase, srcBase);
+}
+
+static const BYTE *LDM_get_position_on_hash(
+    U32 h, void *tableBase, const BYTE *srcBase) {
+  const U32 * const hashTable = (U32*)tableBase;
+  return hashTable[h] + srcBase;
+}
+
+static BYTE LDM_read_byte(const void *memPtr) {
+  BYTE val;
+  memcpy(&val, memPtr, 1);
+  return val;
+}
+
+static unsigned LDM_count(const BYTE *pIn, const BYTE *pMatch,
+                          const BYTE *pInLimit) {
+  const BYTE * const pStart = pIn;
+  while (pIn < pInLimit - 1) {
+    BYTE const diff = LDM_read_byte(pMatch) ^ LDM_read_byte(pIn);
+    if (!diff) {
+      pIn++;
+      pMatch++;
+      continue;
+    }
+    return (unsigned)(pIn - pStart);
+  }
+  return (unsigned)(pIn - pStart);
+}
+
+void LDM_read_header(void const *source, size_t *compressed_size,
+                     size_t *decompressed_size) {
+  const U32 *ip = (const U32 *)source;
+  *compressed_size = *ip++;
+  *decompressed_size = *ip;
+}
+
+size_t LDM_compress(void const *source, void *dest, size_t source_size,
+                    size_t max_dest_size) {
+  const BYTE * const istart = (const BYTE*)source;
+  const BYTE *ip = istart;
+  const BYTE * const iend = istart + source_size;
+  const BYTE *ilimit = iend - HASH_SIZE;
+  const BYTE * const matchlimit = iend - HASH_SIZE;
+  const BYTE * const mflimit = iend - MINMATCH;
+  BYTE *op = (BYTE*) dest;
+  U32 hashTable[LDM_HASHTABLESIZE_U32];
+  memset(hashTable, 0, sizeof(hashTable));
+
+  const BYTE *anchor = (const BYTE *)source;
+//  struct LDM_cctx cctx;
+  size_t output_size = 0;
+
+  U32 forwardH;
+
+  /* Hash first byte: put into hash table */
+
+  LDM_put_position(ip, hashTable, istart);
+  ip++;
+  forwardH = LDM_hash_position(ip);
+
+  //TODO Loop terminates before ip>=ilimit.
+  while (ip < ilimit) {
+    const BYTE *match;
+    BYTE *token;
+
+    /* Find a match */
+    {
+      const BYTE *forwardIp = ip;
+      unsigned step = 1;
+
+      do {
+        U32 const h = forwardH;
+        ip = forwardIp;
+        forwardIp += step;
+
+        if (forwardIp > mflimit) {
+          goto _last_literals;
+        }
+
+        match = LDM_get_position_on_hash(h, hashTable, istart);
+
+        forwardH = LDM_hash_position(forwardIp);
+        LDM_put_position_on_hash(ip, h, hashTable, istart);
+      } while (ip - match > WINDOW_SIZE ||
+               LDM_read64(match) != LDM_read64(ip));
+    }
+
+    // TODO catchup
+    while (ip > anchor && match > istart && ip[-1] == match[-1]) {
+      ip--;
+      match--;
+    }
+
+    /* Encode literals */
+    {
+      unsigned const litLength = (unsigned)(ip - anchor);
+      token = op++;
+
+#ifdef LDM_DEBUG
+      printf("Cur position: %zu\n", anchor - istart);
+      printf("LitLength %zu. (Match offset). %zu\n", litLength, ip - match);
+#endif
+      /*
+      fwrite(match, 4, 1, stdout);
+      printf("\n");
+      */
+
+      if (litLength >= RUN_MASK) {
+        int len = (int)litLength - RUN_MASK;
+        *token = (RUN_MASK << ML_BITS);
+        for (; len >= 255; len -= 255) {
+          *op++ = 255;
+        }
+        *op++ = (BYTE)len;
+      } else {
+        *token = (BYTE)(litLength << ML_BITS);
+      }
+#ifdef LDM_DEBUG
+      printf("Literals ");
+      fwrite(anchor, litLength, 1, stdout);
+      printf("\n");
+#endif
+      memcpy(op, anchor, litLength);
+      //LDM_wild_copy(op, anchor, op + litLength);
+      op += litLength;
+    }
+_next_match:
+    /* Encode offset */
+    {
+      LDM_write32(op, ip - match);
+      op += 4;
+    }
+
+    /* Encode Match Length */
+    {
+      unsigned matchCode;
+      matchCode = LDM_count(ip + MINMATCH, match + MINMATCH,
+                            matchlimit);
+#ifdef LDM_DEBUG
+      printf("Match length %zu\n", matchCode + MINMATCH);
+      fwrite(ip, MINMATCH + matchCode, 1, stdout);
+      printf("\n");
+#endif
+      ip += MINMATCH + matchCode;
+      if (matchCode >= ML_MASK) {
+        *token += ML_MASK;
+        matchCode -= ML_MASK;
+        LDM_write32(op, 0xFFFFFFFF);
+        while (matchCode >= 4*0xFF) {
+          op += 4;
+          LDM_write32(op, 0xffffffff);
+          matchCode -= 4*0xFF;
+        }
+        op += matchCode / 255;
+        *op++ = (BYTE)(matchCode % 255);
+      } else {
+        *token += (BYTE)(matchCode);
+      }
+#ifdef LDM_DEBUG
+      printf("\n");
+#endif
+    }
+
+    anchor = ip;
+
+    LDM_put_position(ip, hashTable, istart);
+    forwardH = LDM_hash_position(++ip);
+  }
+_last_literals:
+    /* Encode last literals */
+  {
+    size_t const lastRun = (size_t)(iend - anchor);
+    if (lastRun >= RUN_MASK) {
+      size_t accumulator = lastRun - RUN_MASK;
+      *op++ = RUN_MASK << ML_BITS;
+      for(; accumulator >= 255; accumulator -= 255) {
+        *op++ = 255;
+      }
+      *op++ = (BYTE)accumulator;
+    } else {
+      *op++ = (BYTE)(lastRun << ML_BITS);
+    }
+    memcpy(op, anchor, lastRun);
+    op += lastRun;
+  }
+  return (op - (BYTE *)dest);
+}
+
+size_t LDM_decompress(void const *source, void *dest, size_t compressed_size,
+                      size_t max_decompressed_size) {
+  const BYTE *ip = (const BYTE *)source;
+  const BYTE * const iend = ip + compressed_size;
+  BYTE *op = (BYTE *)dest;
+  BYTE * const oend = op + max_decompressed_size;
+  BYTE *cpy;
+
+  while (ip < iend) {
+    size_t length;
+    const BYTE *match;
+    size_t offset;
+
+    /* get literal length */
+    unsigned const token = *ip++;
+    if ((length=(token >> ML_BITS)) == RUN_MASK) {
+      unsigned s;
+      do {
+        s = *ip++;
+        length += s;
+      } while (s == 255);
+    }
+#ifdef LDM_DEBUG
+    printf("Literal length: %zu\n", length);
+#endif
+
+    /* copy literals */
+    cpy = op + length;
+#ifdef LDM_DEBUG
+    printf("Literals ");
+    fwrite(ip, length, 1, stdout);
+    printf("\n");
+#endif
+    memcpy(op, ip, length);
+//    LDM_wild_copy(op, ip, cpy);
+    ip += length;
+    op = cpy;
+
+    /* get offset */
+    offset = LDM_read32(ip);
+
+#ifdef LDM_DEBUG
+    printf("Offset: %zu\n", offset);
+#endif
+    ip += 4;
+    match = op - offset;
+ //   LDM_write32(op, (U32)offset);
+
+    /* get matchlength */
+    length = token & ML_MASK;
+    if (length == ML_MASK) {
+      unsigned s;
+      do {
+        s = *ip++;
+        length += s;
+      } while (s == 255);
+    }
+    length += MINMATCH;
+#ifdef LDM_DEBUG
+    printf("Match length: %zu\n", length);
+#endif
+    /* copy match */
+    cpy = op + length;
+
+    // Inefficient for now
+
+    while (match < cpy - offset && op < oend) {
+      *op++ = *match++;
+    }
+  }
+//  memcpy(dest, source, compressed_size);
+  return op - (BYTE *)dest;
+}
+
+
diff --git a/contrib/long_distance_matching/versions/v0.1/ldm.h b/contrib/long_distance_matching/versions/v0.1/ldm.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..f4ca25a
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,19 @@
+#ifndef LDM_H
+#define LDM_H
+
+#include <stddef.h>   /* size_t */
+
+#define LDM_COMPRESS_SIZE 4
+#define LDM_DECOMPRESS_SIZE 4
+#define LDM_HEADER_SIZE ((LDM_COMPRESS_SIZE)+(LDM_DECOMPRESS_SIZE))
+
+size_t LDM_compress(void const *source, void *dest, size_t source_size,
+                    size_t max_dest_size);
+
+size_t LDM_decompress(void const *source, void *dest, size_t compressed_size,
+                      size_t max_decompressed_size);
+
+void LDM_read_header(void const *source, size_t *compressed_size,
+                     size_t *decompressed_size);
+
+#endif /* LDM_H */
diff --git a/contrib/long_distance_matching/versions/v0.1/main-ldm.c b/contrib/long_distance_matching/versions/v0.1/main-ldm.c
new file mode 100644 (file)
index 0000000..10869cc
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,459 @@
+// TODO: file size must fit into a U32
+
+#include <stdio.h>
+#include <stdlib.h>
+#include <string.h>
+#include <sys/time.h>
+#include <sys/types.h>
+#include <sys/mman.h>
+#include <sys/stat.h>
+#include <unistd.h>
+#include <zstd.h>
+
+#include <fcntl.h>
+#include "ldm.h"
+
+// #define BUF_SIZE 16*1024  // Block size
+#define DEBUG
+
+//#define ZSTD
+
+#if 0
+static size_t compress_file(FILE *in, FILE *out, size_t *size_in,
+                            size_t *size_out) {
+  char *src, *buf = NULL;
+  size_t r = 1;
+  size_t size, n, k, count_in = 0, count_out = 0, offset, frame_size = 0;
+
+  src = malloc(BUF_SIZE);
+  if (!src) {
+    printf("Not enough memory\n");
+    goto cleanup;
+  }
+
+  size = BUF_SIZE + LDM_HEADER_SIZE;
+  buf = malloc(size);
+  if (!buf) {
+    printf("Not enough memory\n");
+    goto cleanup;
+  }
+
+
+  for (;;) {
+    k = fread(src, 1, BUF_SIZE, in);
+    if (k == 0)
+      break;
+    count_in += k;
+
+    n = LDM_compress(src, buf, k, BUF_SIZE);
+
+    // n = k;
+    // offset += n;
+    offset = k;
+    count_out += k;
+
+//    k = fwrite(src, 1, offset, out);
+
+    k = fwrite(buf, 1, offset, out);
+    if (k < offset) {
+      if (ferror(out))
+        printf("Write failed\n");
+      else
+        printf("Short write\n");
+      goto cleanup;
+    }
+
+  }
+  *size_in = count_in;
+  *size_out = count_out;
+  r = 0;
+ cleanup:
+  free(src);
+  free(buf);
+  return r;
+}
+
+static size_t decompress_file(FILE *in, FILE *out) {
+  void *src = malloc(BUF_SIZE);
+  void *dst = NULL;
+  size_t dst_capacity = BUF_SIZE;
+  size_t ret = 1;
+  size_t bytes_written = 0;
+
+  if (!src) {
+    perror("decompress_file(src)");
+    goto cleanup;
+  }
+
+  while (ret != 0) {
+    /* Load more input */
+    size_t src_size = fread(src, 1, BUF_SIZE, in);
+    void *src_ptr = src;
+    void *src_end = src_ptr + src_size;
+    if (src_size == 0 || ferror(in)) {
+      printf("(TODO): Decompress: not enough input or error reading file\n");
+      //TODO
+      ret = 0;
+      goto cleanup;
+    }
+
+    /* Allocate destination buffer if it hasn't been allocated already */
+    if (!dst) {
+      dst = malloc(dst_capacity);
+      if (!dst) {
+        perror("decompress_file(dst)");
+        goto cleanup;
+      }
+    }
+
+    // TODO
+
+    /* Decompress:
+     * Continue while there is more input to read.
+     */
+    while (src_ptr != src_end && ret != 0) {
+      // size_t dst_size = src_size;
+      size_t dst_size = LDM_decompress(src, dst, src_size, dst_capacity);
+      size_t written = fwrite(dst, 1, dst_size, out);
+//      printf("Writing %zu bytes\n", dst_size);
+      bytes_written += dst_size;
+      if (written != dst_size) {
+        printf("Decompress: Failed to write to file\n");
+        goto cleanup;
+      }
+      src_ptr += src_size;
+      src_size = src_end - src_ptr;
+    }
+
+    /* Update input */
+
+  }
+
+  printf("Wrote %zu bytes\n", bytes_written);
+
+ cleanup:
+  free(src);
+  free(dst);
+
+  return ret;
+}
+#endif
+
+static size_t compress(const char *fname, const char *oname) {
+  int fdin, fdout;
+  struct stat statbuf;
+  char *src, *dst;
+
+  /* open the input file */
+  if ((fdin = open(fname, O_RDONLY)) < 0) {
+    perror("Error in file opening");
+    return 1;
+  }
+
+  /* open the output file */
+  if ((fdout = open(oname, O_RDWR | O_CREAT | O_TRUNC, (mode_t)0600)) < 0) {
+    perror("Can't create output file");
+    return 1;
+  }
+
+  /* find size of input file */
+  if (fstat (fdin, &statbuf) < 0) {
+    perror("Fstat error");
+    return 1;
+  }
+  size_t size_in = statbuf.st_size;
+
+ /* go to the location corresponding to the last byte */
+ if (lseek(fdout, size_in + LDM_HEADER_SIZE - 1, SEEK_SET) == -1) {
+    perror("lseek error");
+    return 1;
+ }
+
+ /* write a dummy byte at the last location */
+ if (write(fdout, "", 1) != 1) {
+     perror("write error");
+     return 1;
+ }
+
+  /* mmap the input file */
+  if ((src = mmap(0, statbuf.st_size, PROT_READ,  MAP_SHARED, fdin, 0))
+          == (caddr_t) - 1) {
+      perror("mmap error for input");
+      return 1;
+  }
+  size_t out_size = statbuf.st_size + LDM_HEADER_SIZE;
+
+  /* mmap the output file */
+  if ((dst = mmap(0, out_size, PROT_READ | PROT_WRITE,
+                  MAP_SHARED, fdout, 0)) == (caddr_t) - 1) {
+      perror("mmap error for output");
+      return 1;
+  }
+
+  #ifdef ZSTD
+    size_t size_out = ZSTD_compress(dst, statbuf.st_size,
+                                    src, statbuf.st_size, 1);
+  #else
+    size_t size_out = LDM_compress(src, dst + LDM_HEADER_SIZE, statbuf.st_size,
+                                   statbuf.st_size);
+    size_out += LDM_HEADER_SIZE;
+
+    // TODO: should depend on LDM_DECOMPRESS_SIZE write32
+    memcpy(dst, &size_out, 4);
+    memcpy(dst + 4, &(statbuf.st_size), 4);
+    printf("Compressed size: %zu\n", size_out);
+    printf("Decompressed size: %zu\n", statbuf.st_size);
+  #endif
+  ftruncate(fdout, size_out);
+
+  printf("%25s : %6u -> %7u - %s (%.1f%%)\n", fname,
+         (unsigned)statbuf.st_size, (unsigned)size_out, oname,
+         (double)size_out / (statbuf.st_size) * 100);
+
+  close(fdin);
+  close(fdout);
+  return 0;
+}
+
+static size_t decompress(const char *fname, const char *oname) {
+  int fdin, fdout;
+  struct stat statbuf;
+  char *src, *dst;
+
+  /* open the input file */
+  if ((fdin = open(fname, O_RDONLY)) < 0) {
+    perror("Error in file opening");
+    return 1;
+  }
+
+  /* open the output file */
+  if ((fdout = open(oname, O_RDWR | O_CREAT | O_TRUNC, (mode_t)0600)) < 0) {
+    perror("Can't create output file");
+    return 1;
+  }
+
+  /* find size of input file */
+  if (fstat (fdin, &statbuf) < 0) {
+    perror("Fstat error");
+    return 1;
+  }
+
+  /* mmap the input file */
+  if ((src = mmap(0, statbuf.st_size, PROT_READ,  MAP_SHARED, fdin, 0))
+          == (caddr_t) - 1) {
+      perror("mmap error for input");
+      return 1;
+  }
+
+  /* read header */
+  size_t compressed_size, decompressed_size;
+  LDM_read_header(src, &compressed_size, &decompressed_size);
+
+  printf("Size, compressed_size, decompressed_size: %zu %zu %zu\n",
+         statbuf.st_size, compressed_size, decompressed_size);
+
+  /* go to the location corresponding to the last byte */
+  if (lseek(fdout, decompressed_size - 1, SEEK_SET) == -1) {
+    perror("lseek error");
+    return 1;
+  }
+
+  /* write a dummy byte at the last location */
+  if (write(fdout, "", 1) != 1) {
+    perror("write error");
+    return 1;
+  }
+
+  /* mmap the output file */
+  if ((dst = mmap(0, decompressed_size, PROT_READ | PROT_WRITE,
+                  MAP_SHARED, fdout, 0)) == (caddr_t) - 1) {
+      perror("mmap error for output");
+      return 1;
+  }
+
+  /* Copy input file to output file */
+//  memcpy(dst, src, statbuf.st_size);
+
+  #ifdef ZSTD
+    size_t size_out = ZSTD_decompress(dst, decomrpessed_size,
+                                      src + LDM_HEADER_SIZE,
+                                      statbuf.st_size - LDM_HEADER_SIZE);
+  #else
+    size_t size_out = LDM_decompress(src + LDM_HEADER_SIZE, dst,
+                                     statbuf.st_size - LDM_HEADER_SIZE,
+                                     decompressed_size);
+    printf("Ret size out: %zu\n", size_out);
+  #endif
+  ftruncate(fdout, size_out);
+
+  close(fdin);
+  close(fdout);
+  return 0;
+}
+
+static int compare(FILE *fp0, FILE *fp1) {
+  int result = 0;
+  while (result == 0) {
+    char b0[1024];
+    char b1[1024];
+    const size_t r0 = fread(b0, 1, sizeof(b0), fp0);
+    const size_t r1 = fread(b1, 1, sizeof(b1), fp1);
+
+    result = (int)r0 - (int)r1;
+
+    if (0 == r0 || 0 == r1) {
+      break;
+    }
+    if (0 == result) {
+      result = memcmp(b0, b1, r0);
+    }
+  }
+  return result;
+}
+
+static void verify(const char *inpFilename, const char *decFilename) {
+  FILE *inpFp = fopen(inpFilename, "rb");
+  FILE *decFp = fopen(decFilename, "rb");
+
+  printf("verify : %s <-> %s\n", inpFilename, decFilename);
+       const int cmp = compare(inpFp, decFp);
+       if(0 == cmp) {
+               printf("verify : OK\n");
+       } else {
+               printf("verify : NG\n");
+       }
+
+       fclose(decFp);
+       fclose(inpFp);
+}
+
+int main(int argc, const char *argv[]) {
+  const char * const exeName = argv[0];
+  char inpFilename[256] = { 0 };
+  char ldmFilename[256] = { 0 };
+  char decFilename[256] = { 0 };
+
+  if (argc < 2) {
+    printf("Wrong arguments\n");
+    printf("Usage:\n");
+    printf("%s FILE\n", exeName);
+    return 1;
+  }
+
+  snprintf(inpFilename, 256, "%s", argv[1]);
+  snprintf(ldmFilename, 256, "%s.ldm", argv[1]);
+  snprintf(decFilename, 256, "%s.ldm.dec", argv[1]);
+
+       printf("inp = [%s]\n", inpFilename);
+       printf("ldm = [%s]\n", ldmFilename);
+       printf("dec = [%s]\n", decFilename);
+
+  struct timeval tv1, tv2;
+  /* compress */
+  {
+  gettimeofday(&tv1, NULL);
+  if (compress(inpFilename, ldmFilename)) {
+      printf("Compress error");
+      return 1;
+  }
+  gettimeofday(&tv2, NULL);
+  printf("Total time = %f seconds\n",
+         (double) (tv2.tv_usec - tv1.tv_usec) / 1000000 +
+         (double) (tv2.tv_sec - tv1.tv_sec));
+  }
+
+  /* decompress */
+
+  gettimeofday(&tv1, NULL);
+  if (decompress(ldmFilename, decFilename)) {
+      printf("Decompress error");
+      return 1;
+  }
+  gettimeofday(&tv2, NULL);
+  printf("Total time = %f seconds\n",
+        (double) (tv2.tv_usec - tv1.tv_usec) / 1000000 +
+        (double) (tv2.tv_sec - tv1.tv_sec));
+
+  /* verify */
+  verify(inpFilename, decFilename);
+  return 0;
+}
+
+#if 0
+int main2(int argc, char *argv[]) {
+  char inpFilename[256] = { 0 };
+  char ldmFilename[256] = { 0 };
+  char decFilename[256] = { 0 };
+
+  if (argc < 2) {
+    printf("Please specify input filename\n");
+    return 0;
+  }
+  snprintf(inpFilename, 256, "%s", argv[1]);
+  snprintf(ldmFilename, 256, "%s.ldm", argv[1]);
+  snprintf(decFilename, 256, "%s.ldm.dec", argv[1]);
+
+    printf("inp = [%s]\n", inpFilename);
+       printf("ldm = [%s]\n", ldmFilename);
+       printf("dec = [%s]\n", decFilename);
+
+  /* compress */
+  {
+    FILE *inpFp = fopen(inpFilename, "rb");
+    FILE *outFp = fopen(ldmFilename, "wb");
+    size_t sizeIn = 0;
+    size_t sizeOut = 0;
+    size_t ret;
+               printf("compress : %s -> %s\n", inpFilename, ldmFilename);
+               ret = compress_file(inpFp, outFp, &sizeIn, &sizeOut);
+               if (ret) {
+                       printf("compress : failed with code %zu\n", ret);
+                       return ret;
+               }
+               printf("%s: %zu → %zu bytes, %.1f%%\n",
+                       inpFilename, sizeIn, sizeOut,
+                       (double)sizeOut / sizeIn * 100);
+               printf("compress : done\n");
+
+               fclose(outFp);
+               fclose(inpFp);
+  }
+
+       /* decompress */
+       {
+    FILE *inpFp = fopen(ldmFilename, "rb");
+               FILE *outFp = fopen(decFilename, "wb");
+               size_t ret;
+
+               printf("decompress : %s -> %s\n", ldmFilename, decFilename);
+               ret = decompress_file(inpFp, outFp);
+               if (ret) {
+                       printf("decompress : failed with code %zu\n", ret);
+                       return ret;
+               }
+               printf("decompress : done\n");
+
+               fclose(outFp);
+               fclose(inpFp);
+       }
+
+       /* verify */
+       {
+    FILE *inpFp = fopen(inpFilename, "rb");
+               FILE *decFp = fopen(decFilename, "rb");
+
+               printf("verify : %s <-> %s\n", inpFilename, decFilename);
+               const int cmp = compare(inpFp, decFp);
+               if(0 == cmp) {
+                       printf("verify : OK\n");
+               } else {
+                       printf("verify : NG\n");
+               }
+
+               fclose(decFp);
+               fclose(inpFp);
+       }
+  return 0;
+}
+#endif
+
diff --git a/contrib/long_distance_matching/versions/v0.2/Makefile b/contrib/long_distance_matching/versions/v0.2/Makefile
new file mode 100644 (file)
index 0000000..4e04fd6
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,32 @@
+# ################################################################
+# Copyright (c) 2016-present, Yann Collet, Facebook, Inc.
+# All rights reserved.
+#
+# This source code is licensed under the BSD-style license found in the
+# LICENSE file in the root directory of this source tree. An additional grant
+# of patent rights can be found in the PATENTS file in the same directory.
+# ################################################################
+
+# This Makefile presumes libzstd is installed, using `sudo make install`
+
+
+LDFLAGS += -lzstd
+
+.PHONY: default all clean
+
+default: all
+
+all: main-ldm
+
+
+#main : ldm.c main.c
+#      $(CC) $(CPPFLAGS) $(CFLAGS) $^ $(LDFLAGS) -o $@
+
+main-ldm : ldm.c main-ldm.c
+       $(CC) $(CPPFLAGS) $(CFLAGS) $^ $(LDFLAGS) -o $@
+
+clean:
+       @rm -f core *.o tmp* result* *.ldm *.ldm.dec \
+       main main-ldm
+       @echo Cleaning completed
+
diff --git a/contrib/long_distance_matching/versions/v0.2/ldm.c b/contrib/long_distance_matching/versions/v0.2/ldm.c
new file mode 100644 (file)
index 0000000..9081d13
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,436 @@
+#include <stdlib.h>
+#include <string.h>
+#include <stdint.h>
+#include <stdio.h>
+
+#include "ldm.h"
+
+#define HASH_EVERY 7
+
+#define LDM_MEMORY_USAGE 14
+#define LDM_HASHLOG (LDM_MEMORY_USAGE-2)
+#define LDM_HASHTABLESIZE (1 << (LDM_MEMORY_USAGE))
+#define LDM_HASHTABLESIZE_U32 ((LDM_HASHTABLESIZE) >> 2)
+#define LDM_HASH_SIZE_U32 (1 << (LDM_HASHLOG))
+
+#define WINDOW_SIZE (1 << 20)
+#define MAX_WINDOW_SIZE 31
+#define HASH_SIZE 8
+#define MINMATCH 8
+
+#define ML_BITS 4
+#define ML_MASK ((1U<<ML_BITS)-1)
+#define RUN_BITS (8-ML_BITS)
+#define RUN_MASK ((1U<<RUN_BITS)-1)
+
+//#define LDM_DEBUG
+
+typedef  uint8_t BYTE;
+typedef uint16_t U16;
+typedef uint32_t U32;
+typedef  int32_t S32;
+typedef uint64_t U64;
+
+typedef uint64_t tag;
+
+static unsigned LDM_isLittleEndian(void) {
+    const union { U32 u; BYTE c[4]; } one = { 1 };
+    return one.c[0];
+}
+
+static U16 LDM_read16(const void *memPtr) {
+  U16 val;
+  memcpy(&val, memPtr, sizeof(val));
+  return val;
+}
+
+static U16 LDM_readLE16(const void *memPtr) {
+  if (LDM_isLittleEndian()) {
+    return LDM_read16(memPtr);
+  } else {
+    const BYTE *p = (const BYTE *)memPtr;
+    return (U16)((U16)p[0] + (p[1] << 8));
+  }
+}
+
+static void LDM_write16(void *memPtr, U16 value){
+  memcpy(memPtr, &value, sizeof(value));
+}
+
+static void LDM_write32(void *memPtr, U32 value) {
+  memcpy(memPtr, &value, sizeof(value));
+}
+
+static void LDM_writeLE16(void *memPtr, U16 value) {
+  if (LDM_isLittleEndian()) {
+    LDM_write16(memPtr, value);
+  } else {
+    BYTE* p = (BYTE*)memPtr;
+    p[0] = (BYTE) value;
+    p[1] = (BYTE)(value>>8);
+  }
+}
+
+static U32 LDM_read32(const void *ptr) {
+  return *(const U32 *)ptr;
+}
+
+static U64 LDM_read64(const void *ptr) {
+  return *(const U64 *)ptr;
+}
+
+static void LDM_copy8(void *dst, const void *src) {
+  memcpy(dst, src, 8);
+}
+
+typedef struct compress_stats {
+  U32 num_matches;
+  U32 total_match_length;
+  U32 total_literal_length;
+  U64 total_offset;
+} compress_stats;
+
+static void LDM_printCompressStats(const compress_stats *stats) {
+  printf("=====================\n");
+  printf("Compression statistics\n");
+  printf("Total number of matches: %u\n", stats->num_matches);
+  printf("Average match length: %.1f\n", ((double)stats->total_match_length) /
+                                         (double)stats->num_matches);
+  printf("Average literal length: %.1f\n",
+         ((double)stats->total_literal_length) / (double)stats->num_matches);
+  printf("Average offset length: %.1f\n",
+         ((double)stats->total_offset) / (double)stats->num_matches);
+  printf("=====================\n");
+}
+
+// TODO: unused.
+struct hash_entry {
+  U64 offset;
+  tag t;
+};
+
+static U32 LDM_hash(U32 sequence) {
+  return ((sequence * 2654435761U) >> ((32)-LDM_HASHLOG));
+}
+
+static U32 LDM_hash5(U64 sequence) {
+  static const U64 prime5bytes = 889523592379ULL;
+  static const U64 prime8bytes = 11400714785074694791ULL;
+  const U32 hashLog = LDM_HASHLOG;
+  if (LDM_isLittleEndian())
+    return (U32)(((sequence << 24) * prime5bytes) >> (64 - hashLog));
+  else
+    return (U32)(((sequence >> 24) * prime8bytes) >> (64 - hashLog));
+}
+
+static U32 LDM_hash_position(const void * const p) {
+  return LDM_hash(LDM_read32(p));
+}
+
+static void LDM_put_position_on_hash(const BYTE *p, U32 h, void *tableBase,
+                                     const BYTE *srcBase) {
+  if (((p - srcBase) & HASH_EVERY) != HASH_EVERY) {
+    return;
+  }
+
+  U32 *hashTable = (U32 *) tableBase;
+  hashTable[h] = (U32)(p - srcBase);
+}
+
+static void LDM_put_position(const BYTE *p, void *tableBase,
+                             const BYTE *srcBase) {
+  if (((p - srcBase) & HASH_EVERY) != HASH_EVERY) {
+    return;
+  }
+  U32 const h = LDM_hash_position(p);
+  LDM_put_position_on_hash(p, h, tableBase, srcBase);
+}
+
+static const BYTE *LDM_get_position_on_hash(
+    U32 h, void *tableBase, const BYTE *srcBase) {
+  const U32 * const hashTable = (U32*)tableBase;
+  return hashTable[h] + srcBase;
+}
+
+static BYTE LDM_read_byte(const void *memPtr) {
+  BYTE val;
+  memcpy(&val, memPtr, 1);
+  return val;
+}
+
+static unsigned LDM_count(const BYTE *pIn, const BYTE *pMatch,
+                          const BYTE *pInLimit) {
+  const BYTE * const pStart = pIn;
+  while (pIn < pInLimit - 1) {
+    BYTE const diff = LDM_read_byte(pMatch) ^ LDM_read_byte(pIn);
+    if (!diff) {
+      pIn++;
+      pMatch++;
+      continue;
+    }
+    return (unsigned)(pIn - pStart);
+  }
+  return (unsigned)(pIn - pStart);
+}
+
+void LDM_read_header(const void *src, size_t *compressSize,
+                     size_t *decompressSize) {
+  const U32 *ip = (const U32 *)src;
+  *compressSize = *ip++;
+  *decompressSize = *ip;
+}
+
+// TODO: maxDstSize is unused
+size_t LDM_compress(const void *src, size_t srcSize,
+                    void *dst, size_t maxDstSize) {
+  const BYTE * const istart = (const BYTE*)src;
+  const BYTE *ip = istart;
+  const BYTE * const iend = istart + srcSize;
+  const BYTE *ilimit = iend - HASH_SIZE;
+  const BYTE * const matchlimit = iend - HASH_SIZE;
+  const BYTE * const mflimit = iend - MINMATCH;
+  BYTE *op = (BYTE*) dst;
+
+  compress_stats compressStats = { 0 };
+
+  U32 hashTable[LDM_HASHTABLESIZE_U32];
+  memset(hashTable, 0, sizeof(hashTable));
+
+  const BYTE *anchor = (const BYTE *)src;
+//  struct LDM_cctx cctx;
+  size_t output_size = 0;
+
+  U32 forwardH;
+
+  /* Hash first byte: put into hash table */
+
+  LDM_put_position(ip, hashTable, istart);
+  const BYTE *lastHash = ip;
+  ip++;
+  forwardH = LDM_hash_position(ip);
+
+  //TODO Loop terminates before ip>=ilimit.
+  while (ip < ilimit) {
+    const BYTE *match;
+    BYTE *token;
+
+    /* Find a match */
+    {
+      const BYTE *forwardIp = ip;
+      unsigned step = 1;
+
+      do {
+        U32 const h = forwardH;
+        ip = forwardIp;
+        forwardIp += step;
+
+        if (forwardIp > mflimit) {
+          goto _last_literals;
+        }
+
+        match = LDM_get_position_on_hash(h, hashTable, istart);
+
+        forwardH = LDM_hash_position(forwardIp);
+        LDM_put_position_on_hash(ip, h, hashTable, istart);
+        lastHash = ip;
+      } while (ip - match > WINDOW_SIZE ||
+               LDM_read64(match) != LDM_read64(ip));
+    }
+    compressStats.num_matches++;
+
+    /* Catchup: look back to extend match from found match */
+    while (ip > anchor && match > istart && ip[-1] == match[-1]) {
+      ip--;
+      match--;
+    }
+
+    /* Encode literals */
+    {
+      unsigned const litLength = (unsigned)(ip - anchor);
+      token = op++;
+
+      compressStats.total_literal_length += litLength;
+
+#ifdef LDM_DEBUG
+      printf("Cur position: %zu\n", anchor - istart);
+      printf("LitLength %zu. (Match offset). %zu\n", litLength, ip - match);
+#endif
+
+      if (litLength >= RUN_MASK) {
+        int len = (int)litLength - RUN_MASK;
+        *token = (RUN_MASK << ML_BITS);
+        for (; len >= 255; len -= 255) {
+          *op++ = 255;
+        }
+        *op++ = (BYTE)len;
+      } else {
+        *token = (BYTE)(litLength << ML_BITS);
+      }
+#ifdef LDM_DEBUG
+      printf("Literals ");
+      fwrite(anchor, litLength, 1, stdout);
+      printf("\n");
+#endif
+      memcpy(op, anchor, litLength);
+      op += litLength;
+    }
+_next_match:
+    /* Encode offset */
+    {
+      /*
+      LDM_writeLE16(op, ip-match);
+      op += 2;
+      */
+      LDM_write32(op, ip - match);
+      op += 4;
+      compressStats.total_offset += (ip - match);
+    }
+
+    /* Encode Match Length */
+    {
+      unsigned matchCode;
+      matchCode = LDM_count(ip + MINMATCH, match + MINMATCH,
+                            matchlimit);
+#ifdef LDM_DEBUG
+      printf("Match length %zu\n", matchCode + MINMATCH);
+      fwrite(ip, MINMATCH + matchCode, 1, stdout);
+      printf("\n");
+#endif
+      compressStats.total_match_length += matchCode + MINMATCH;
+      unsigned ctr = 1;
+      ip++;
+      for (; ctr < MINMATCH + matchCode; ip++, ctr++) {
+        LDM_put_position(ip, hashTable, istart);
+      }
+//      ip += MINMATCH + matchCode;
+      if (matchCode >= ML_MASK) {
+        *token += ML_MASK;
+        matchCode -= ML_MASK;
+        LDM_write32(op, 0xFFFFFFFF);
+        while (matchCode >= 4*0xFF) {
+          op += 4;
+          LDM_write32(op, 0xffffffff);
+          matchCode -= 4*0xFF;
+        }
+        op += matchCode / 255;
+        *op++ = (BYTE)(matchCode % 255);
+      } else {
+        *token += (BYTE)(matchCode);
+      }
+#ifdef LDM_DEBUG
+      printf("\n");
+
+#endif
+    }
+
+    anchor = ip;
+
+    LDM_put_position(ip, hashTable, istart);
+    forwardH = LDM_hash_position(++ip);
+    lastHash = ip;
+  }
+_last_literals:
+    /* Encode last literals */
+  {
+    size_t const lastRun = (size_t)(iend - anchor);
+    if (lastRun >= RUN_MASK) {
+      size_t accumulator = lastRun - RUN_MASK;
+      *op++ = RUN_MASK << ML_BITS;
+      for(; accumulator >= 255; accumulator -= 255) {
+        *op++ = 255;
+      }
+      *op++ = (BYTE)accumulator;
+    } else {
+      *op++ = (BYTE)(lastRun << ML_BITS);
+    }
+    memcpy(op, anchor, lastRun);
+    op += lastRun;
+  }
+  LDM_printCompressStats(&compressStats);
+  return (op - (BYTE *)dst);
+}
+
+typedef struct LDM_DCtx {
+  const BYTE * const ibase;   /* Pointer to base of input */
+  const BYTE *ip;             /* Pointer to current input position */
+  const BYTE *iend;           /* End of source */
+  BYTE *op;                   /* Pointer to output */
+  const BYTE * const oend;    /* Pointer to end of output */
+
+} LDM_DCtx;
+
+size_t LDM_decompress(const void *src, size_t compressed_size,
+                      void *dst, size_t max_decompressed_size) {
+  const BYTE *ip = (const BYTE *)src;
+  const BYTE * const iend = ip + compressed_size;
+  BYTE *op = (BYTE *)dst;
+  BYTE * const oend = op + max_decompressed_size;
+  BYTE *cpy;
+
+  while (ip < iend) {
+    size_t length;
+    const BYTE *match;
+    size_t offset;
+
+    /* get literal length */
+    unsigned const token = *ip++;
+    if ((length=(token >> ML_BITS)) == RUN_MASK) {
+      unsigned s;
+      do {
+        s = *ip++;
+        length += s;
+      } while (s == 255);
+    }
+#ifdef LDM_DEBUG
+    printf("Literal length: %zu\n", length);
+#endif
+
+    /* copy literals */
+    cpy = op + length;
+#ifdef LDM_DEBUG
+    printf("Literals ");
+    fwrite(ip, length, 1, stdout);
+    printf("\n");
+#endif
+    memcpy(op, ip, length);
+    ip += length;
+    op = cpy;
+
+    /* get offset */
+    /*
+    offset = LDM_readLE16(ip);
+    ip += 2;
+    */
+    offset = LDM_read32(ip);
+    ip += 4;
+#ifdef LDM_DEBUG
+    printf("Offset: %zu\n", offset);
+#endif
+    match = op - offset;
+ //   LDM_write32(op, (U32)offset);
+
+    /* get matchlength */
+    length = token & ML_MASK;
+    if (length == ML_MASK) {
+      unsigned s;
+      do {
+        s = *ip++;
+        length += s;
+      } while (s == 255);
+    }
+    length += MINMATCH;
+#ifdef LDM_DEBUG
+    printf("Match length: %zu\n", length);
+#endif
+    /* copy match */
+    cpy = op + length;
+
+    // Inefficient for now
+    while (match < cpy - offset && op < oend) {
+      *op++ = *match++;
+    }
+  }
+  return op - (BYTE *)dst;
+}
+
+
diff --git a/contrib/long_distance_matching/versions/v0.2/ldm.h b/contrib/long_distance_matching/versions/v0.2/ldm.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..0ac7b2e
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,19 @@
+#ifndef LDM_H
+#define LDM_H
+
+#include <stddef.h>   /* size_t */
+
+#define LDM_COMPRESS_SIZE 4
+#define LDM_DECOMPRESS_SIZE 4
+#define LDM_HEADER_SIZE ((LDM_COMPRESS_SIZE)+(LDM_DECOMPRESS_SIZE))
+
+size_t LDM_compress(const void *src, size_t srcSize,
+                    void *dst, size_t maxDstSize);
+
+size_t LDM_decompress(const void *src, size_t srcSize,
+                      void *dst, size_t maxDstSize);
+
+void LDM_read_header(const void *src, size_t *compressSize,
+                     size_t *decompressSize);
+
+#endif /* LDM_H */
diff --git a/contrib/long_distance_matching/versions/v0.2/main-ldm.c b/contrib/long_distance_matching/versions/v0.2/main-ldm.c
new file mode 100644 (file)
index 0000000..0017335
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,474 @@
+// TODO: file size must fit into a U32
+
+#include <stdio.h>
+#include <stdlib.h>
+#include <string.h>
+#include <sys/time.h>
+#include <sys/types.h>
+#include <sys/mman.h>
+#include <sys/stat.h>
+#include <unistd.h>
+#include <zstd.h>
+
+#include <fcntl.h>
+#include "ldm.h"
+
+// #define BUF_SIZE 16*1024  // Block size
+#define DEBUG
+
+//#define ZSTD
+
+/* Compress file given by fname and output to oname.
+ * Returns 0 if successful, error code otherwise.
+ */
+static int compress(const char *fname, const char *oname) {
+  int fdin, fdout;
+  struct stat statbuf;
+  char *src, *dst;
+
+  /* Open the input file. */
+  if ((fdin = open(fname, O_RDONLY)) < 0) {
+    perror("Error in file opening");
+    return 1;
+  }
+
+  /* Open the output file. */
+  if ((fdout = open(oname, O_RDWR | O_CREAT | O_TRUNC, (mode_t)0600)) < 0) {
+    perror("Can't create output file");
+    return 1;
+  }
+
+  /* Find the size of the input file. */
+  if (fstat (fdin, &statbuf) < 0) {
+    perror("Fstat error");
+    return 1;
+  }
+
+  size_t maxCompressSize = statbuf.st_size + LDM_HEADER_SIZE;
+
+ /* Go to the location corresponding to the last byte. */
+ /* TODO: fallocate? */ 
+  if (lseek(fdout, maxCompressSize - 1, SEEK_SET) == -1) {
+    perror("lseek error");
+    return 1;
+  }
+
+ /* Write a dummy byte at the last location. */
+  if (write(fdout, "", 1) != 1) {
+    perror("write error");
+    return 1;
+  }
+
+  /* mmap the input file. */
+  if ((src = mmap(0, statbuf.st_size, PROT_READ,  MAP_SHARED, fdin, 0))
+          == (caddr_t) - 1) {
+      perror("mmap error for input");
+      return 1;
+  }
+
+  /* mmap the output file */
+  if ((dst = mmap(0, maxCompressSize, PROT_READ | PROT_WRITE,
+                  MAP_SHARED, fdout, 0)) == (caddr_t) - 1) {
+      perror("mmap error for output");
+      return 1;
+  }
+
+#ifdef ZSTD
+  size_t compressSize = ZSTD_compress(dst, statbuf.st_size,
+                                  src, statbuf.st_size, 1);
+#else
+  size_t compressSize = LDM_HEADER_SIZE + 
+      LDM_compress(src, statbuf.st_size,
+                   dst + LDM_HEADER_SIZE, statbuf.st_size);
+
+    // Write compress and decompress size to header 
+    // TODO: should depend on LDM_DECOMPRESS_SIZE write32
+  memcpy(dst, &compressSize, 4);
+  memcpy(dst + 4, &(statbuf.st_size), 4);
+
+#ifdef DEBUG
+  printf("Compressed size: %zu\n", compressSize);
+  printf("Decompressed size: %zu\n", statbuf.st_size);
+#endif
+#endif
+
+  // Truncate file to compressSize.
+  ftruncate(fdout, compressSize);
+
+  printf("%25s : %6u -> %7u - %s (%.1f%%)\n", fname,
+         (unsigned)statbuf.st_size, (unsigned)compressSize, oname,
+         (double)compressSize / (statbuf.st_size) * 100);
+
+  // Close files.
+  close(fdin);
+  close(fdout);
+  return 0;
+}
+
+/* Decompress file compressed using LDM_compress.
+ * The input file should have the LDM_HEADER followed by payload.
+ * Returns 0 if succesful, and an error code otherwise. 
+ */
+static int decompress(const char *fname, const char *oname) {
+  int fdin, fdout;
+  struct stat statbuf;
+  char *src, *dst;
+
+  /* Open the input file. */
+  if ((fdin = open(fname, O_RDONLY)) < 0) {
+    perror("Error in file opening");
+    return 1;
+  }
+
+  /* Open the output file. */
+  if ((fdout = open(oname, O_RDWR | O_CREAT | O_TRUNC, (mode_t)0600)) < 0) {
+    perror("Can't create output file");
+    return 1;
+  }
+
+  /* Find the size of the input file. */
+  if (fstat (fdin, &statbuf) < 0) {
+    perror("Fstat error");
+    return 1;
+  }
+
+  /* mmap the input file. */
+  if ((src = mmap(0, statbuf.st_size, PROT_READ,  MAP_SHARED, fdin, 0))
+          == (caddr_t) - 1) {
+      perror("mmap error for input");
+      return 1;
+  }
+
+  /* Read the header. */
+  size_t compressSize, decompressSize;
+  LDM_read_header(src, &compressSize, &decompressSize);
+
+#ifdef DEBUG
+  printf("Size, compressSize, decompressSize: %zu %zu %zu\n",
+         statbuf.st_size, compressSize, decompressSize);
+#endif
+
+  /* Go to the location corresponding to the last byte. */
+  if (lseek(fdout, decompressSize - 1, SEEK_SET) == -1) {
+    perror("lseek error");
+    return 1;
+  }
+
+  /* write a dummy byte at the last location */
+  if (write(fdout, "", 1) != 1) {
+    perror("write error");
+    return 1;
+  }
+
+  /* mmap the output file */
+  if ((dst = mmap(0, decompressSize, PROT_READ | PROT_WRITE,
+                  MAP_SHARED, fdout, 0)) == (caddr_t) - 1) {
+      perror("mmap error for output");
+      return 1;
+  }
+
+#ifdef ZSTD
+  size_t outSize = ZSTD_decompress(dst, decomrpessed_size,
+                                  src + LDM_HEADER_SIZE,
+                                  statbuf.st_size - LDM_HEADER_SIZE);
+#else
+  size_t outSize = LDM_decompress(
+      src + LDM_HEADER_SIZE, statbuf.st_size - LDM_HEADER_SIZE,
+      dst, decompressSize);
+
+  printf("Ret size out: %zu\n", outSize);
+  #endif
+  ftruncate(fdout, outSize);
+
+  close(fdin);
+  close(fdout);
+  return 0;
+}
+
+/* Compare two files.
+ * Returns 0 iff they are the same.
+ */
+static int compare(FILE *fp0, FILE *fp1) {
+  int result = 0;
+  while (result == 0) {
+    char b0[1024];
+    char b1[1024];
+    const size_t r0 = fread(b0, 1, sizeof(b0), fp0);
+    const size_t r1 = fread(b1, 1, sizeof(b1), fp1);
+
+    result = (int)r0 - (int)r1;
+
+    if (0 == r0 || 0 == r1) break;
+
+    if (0 == result) result = memcmp(b0, b1, r0);
+  }
+  return result;
+}
+
+/* Verify the input file is the same as the decompressed file. */
+static void verify(const char *inpFilename, const char *decFilename) {
+  FILE *inpFp = fopen(inpFilename, "rb");
+  FILE *decFp = fopen(decFilename, "rb");
+
+  printf("verify : %s <-> %s\n", inpFilename, decFilename);
+       const int cmp = compare(inpFp, decFp);
+       if(0 == cmp) {
+               printf("verify : OK\n");
+       } else {
+               printf("verify : NG\n");
+       }
+
+       fclose(decFp);
+       fclose(inpFp);
+}
+
+int main(int argc, const char *argv[]) {
+  const char * const exeName = argv[0];
+  char inpFilename[256] = { 0 };
+  char ldmFilename[256] = { 0 };
+  char decFilename[256] = { 0 };
+
+  if (argc < 2) {
+    printf("Wrong arguments\n");
+    printf("Usage:\n");
+    printf("%s FILE\n", exeName);
+    return 1;
+  }
+
+  snprintf(inpFilename, 256, "%s", argv[1]);
+  snprintf(ldmFilename, 256, "%s.ldm", argv[1]);
+  snprintf(decFilename, 256, "%s.ldm.dec", argv[1]);
+
+       printf("inp = [%s]\n", inpFilename);
+       printf("ldm = [%s]\n", ldmFilename);
+       printf("dec = [%s]\n", decFilename);
+
+  struct timeval tv1, tv2;
+
+  /* Compress */
+
+  gettimeofday(&tv1, NULL);
+  if (compress(inpFilename, ldmFilename)) {
+      printf("Compress error");
+      return 1;
+  }
+  gettimeofday(&tv2, NULL);
+  printf("Total time = %f seconds\n",
+         (double) (tv2.tv_usec - tv1.tv_usec) / 1000000 +
+         (double) (tv2.tv_sec - tv1.tv_sec));
+
+  /* Decompress */
+
+  gettimeofday(&tv1, NULL);
+  if (decompress(ldmFilename, decFilename)) {
+      printf("Decompress error");
+      return 1;
+  }
+  gettimeofday(&tv2, NULL);
+  printf("Total time = %f seconds\n",
+        (double) (tv2.tv_usec - tv1.tv_usec) / 1000000 +
+        (double) (tv2.tv_sec - tv1.tv_sec));
+
+  /* verify */
+  verify(inpFilename, decFilename);
+  return 0;
+}
+
+
+#if 0
+static size_t compress_file(FILE *in, FILE *out, size_t *size_in,
+                            size_t *size_out) {
+  char *src, *buf = NULL;
+  size_t r = 1;
+  size_t size, n, k, count_in = 0, count_out = 0, offset, frame_size = 0;
+
+  src = malloc(BUF_SIZE);
+  if (!src) {
+    printf("Not enough memory\n");
+    goto cleanup;
+  }
+
+  size = BUF_SIZE + LDM_HEADER_SIZE;
+  buf = malloc(size);
+  if (!buf) {
+    printf("Not enough memory\n");
+    goto cleanup;
+  }
+
+
+  for (;;) {
+    k = fread(src, 1, BUF_SIZE, in);
+    if (k == 0)
+      break;
+    count_in += k;
+
+    n = LDM_compress(src, buf, k, BUF_SIZE);
+
+    // n = k;
+    // offset += n;
+    offset = k;
+    count_out += k;
+
+//    k = fwrite(src, 1, offset, out);
+
+    k = fwrite(buf, 1, offset, out);
+    if (k < offset) {
+      if (ferror(out))
+        printf("Write failed\n");
+      else
+        printf("Short write\n");
+      goto cleanup;
+    }
+
+  }
+  *size_in = count_in;
+  *size_out = count_out;
+  r = 0;
+ cleanup:
+  free(src);
+  free(buf);
+  return r;
+}
+
+static size_t decompress_file(FILE *in, FILE *out) {
+  void *src = malloc(BUF_SIZE);
+  void *dst = NULL;
+  size_t dst_capacity = BUF_SIZE;
+  size_t ret = 1;
+  size_t bytes_written = 0;
+
+  if (!src) {
+    perror("decompress_file(src)");
+    goto cleanup;
+  }
+
+  while (ret != 0) {
+    /* Load more input */
+    size_t src_size = fread(src, 1, BUF_SIZE, in);
+    void *src_ptr = src;
+    void *src_end = src_ptr + src_size;
+    if (src_size == 0 || ferror(in)) {
+      printf("(TODO): Decompress: not enough input or error reading file\n");
+      //TODO
+      ret = 0;
+      goto cleanup;
+    }
+
+    /* Allocate destination buffer if it hasn't been allocated already */
+    if (!dst) {
+      dst = malloc(dst_capacity);
+      if (!dst) {
+        perror("decompress_file(dst)");
+        goto cleanup;
+      }
+    }
+
+    // TODO
+
+    /* Decompress:
+     * Continue while there is more input to read.
+     */
+    while (src_ptr != src_end && ret != 0) {
+      // size_t dst_size = src_size;
+      size_t dst_size = LDM_decompress(src, dst, src_size, dst_capacity);
+      size_t written = fwrite(dst, 1, dst_size, out);
+//      printf("Writing %zu bytes\n", dst_size);
+      bytes_written += dst_size;
+      if (written != dst_size) {
+        printf("Decompress: Failed to write to file\n");
+        goto cleanup;
+      }
+      src_ptr += src_size;
+      src_size = src_end - src_ptr;
+    }
+
+    /* Update input */
+
+  }
+
+  printf("Wrote %zu bytes\n", bytes_written);
+
+ cleanup:
+  free(src);
+  free(dst);
+
+  return ret;
+}
+
+int main2(int argc, char *argv[]) {
+  char inpFilename[256] = { 0 };
+  char ldmFilename[256] = { 0 };
+  char decFilename[256] = { 0 };
+
+  if (argc < 2) {
+    printf("Please specify input filename\n");
+    return 0;
+  }
+  snprintf(inpFilename, 256, "%s", argv[1]);
+  snprintf(ldmFilename, 256, "%s.ldm", argv[1]);
+  snprintf(decFilename, 256, "%s.ldm.dec", argv[1]);
+
+    printf("inp = [%s]\n", inpFilename);
+       printf("ldm = [%s]\n", ldmFilename);
+       printf("dec = [%s]\n", decFilename);
+
+  /* compress */
+  {
+    FILE *inpFp = fopen(inpFilename, "rb");
+    FILE *outFp = fopen(ldmFilename, "wb");
+    size_t sizeIn = 0;
+    size_t sizeOut = 0;
+    size_t ret;
+               printf("compress : %s -> %s\n", inpFilename, ldmFilename);
+               ret = compress_file(inpFp, outFp, &sizeIn, &sizeOut);
+               if (ret) {
+                       printf("compress : failed with code %zu\n", ret);
+                       return ret;
+               }
+               printf("%s: %zu → %zu bytes, %.1f%%\n",
+                       inpFilename, sizeIn, sizeOut,
+                       (double)sizeOut / sizeIn * 100);
+               printf("compress : done\n");
+
+               fclose(outFp);
+               fclose(inpFp);
+  }
+
+       /* decompress */
+       {
+    FILE *inpFp = fopen(ldmFilename, "rb");
+               FILE *outFp = fopen(decFilename, "wb");
+               size_t ret;
+
+               printf("decompress : %s -> %s\n", ldmFilename, decFilename);
+               ret = decompress_file(inpFp, outFp);
+               if (ret) {
+                       printf("decompress : failed with code %zu\n", ret);
+                       return ret;
+               }
+               printf("decompress : done\n");
+
+               fclose(outFp);
+               fclose(inpFp);
+       }
+
+       /* verify */
+       {
+    FILE *inpFp = fopen(inpFilename, "rb");
+               FILE *decFp = fopen(decFilename, "rb");
+
+               printf("verify : %s <-> %s\n", inpFilename, decFilename);
+               const int cmp = compare(inpFp, decFp);
+               if(0 == cmp) {
+                       printf("verify : OK\n");
+               } else {
+                       printf("verify : NG\n");
+               }
+
+               fclose(decFp);
+               fclose(inpFp);
+       }
+  return 0;
+}
+#endif
+
diff --git a/contrib/long_distance_matching/versions/v0.3/Makefile b/contrib/long_distance_matching/versions/v0.3/Makefile
new file mode 100644 (file)
index 0000000..5ffd4ea
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,40 @@
+# ################################################################
+# Copyright (c) 2016-present, Yann Collet, Facebook, Inc.
+# All rights reserved.
+#
+# This source code is licensed under the BSD-style license found in the
+# LICENSE file in the root directory of this source tree. An additional grant
+# of patent rights can be found in the PATENTS file in the same directory.
+# ################################################################
+
+# This Makefile presumes libzstd is installed, using `sudo make install`
+
+CFLAGS  ?= -O3
+DEBUGFLAGS = -Wall -Wextra -Wcast-qual -Wcast-align -Wshadow \
+            -Wstrict-aliasing=1 -Wswitch-enum -Wdeclaration-after-statement \
+            -Wstrict-prototypes -Wundef -Wpointer-arith -Wformat-security \
+            -Wvla -Wformat=2 -Winit-self -Wfloat-equal -Wwrite-strings \
+            -Wredundant-decls
+CFLAGS  += $(DEBUGFLAGS) $(MOREFLAGS)
+FLAGS    = $(CPPFLAGS) $(CFLAGS)
+
+LDFLAGS += -lzstd
+
+.PHONY: default all clean
+
+default: all
+
+all: main-ldm
+
+
+#main : ldm.c main.c
+#      $(CC) $(CPPFLAGS) $(CFLAGS) $^ $(LDFLAGS) -o $@
+
+main-ldm : util.c ldm.c main-ldm.c
+       $(CC) $(CPPFLAGS) $(CFLAGS) $^ $(LDFLAGS) -o $@
+
+clean:
+       @rm -f core *.o tmp* result* *.ldm *.ldm.dec \
+       main main-ldm
+       @echo Cleaning completed
+
diff --git a/contrib/long_distance_matching/versions/v0.3/ldm.c b/contrib/long_distance_matching/versions/v0.3/ldm.c
new file mode 100644 (file)
index 0000000..1dedf5c
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,464 @@
+#include <stdlib.h>
+#include <string.h>
+#include <stdint.h>
+#include <stdio.h>
+
+
+#include "ldm.h"
+#include "util.h"
+
+#define HASH_EVERY 1
+
+#define LDM_MEMORY_USAGE 16
+#define LDM_HASHLOG (LDM_MEMORY_USAGE-2)
+#define LDM_HASHTABLESIZE (1 << (LDM_MEMORY_USAGE))
+#define LDM_HASHTABLESIZE_U32 ((LDM_HASHTABLESIZE) >> 2)
+#define LDM_HASH_SIZE_U32 (1 << (LDM_HASHLOG))
+
+#define LDM_OFFSET_SIZE 4
+
+#define WINDOW_SIZE (1 << 20)
+#define MAX_WINDOW_SIZE 31
+#define HASH_SIZE 4
+#define LDM_HASH_LENGTH 4
+#define MINMATCH 4
+
+#define ML_BITS 4
+#define ML_MASK ((1U<<ML_BITS)-1)
+#define RUN_BITS (8-ML_BITS)
+#define RUN_MASK ((1U<<RUN_BITS)-1)
+
+//#define LDM_ROLLING_HASH
+//#define LDM_DEBUG
+
+typedef  uint8_t BYTE;
+typedef uint16_t U16;
+typedef uint32_t U32;
+typedef  int32_t S32;
+typedef uint64_t U64;
+
+typedef uint32_t offset_t;
+typedef uint32_t hash_t;
+typedef signed char schar;
+
+typedef struct LDM_hashEntry {
+  offset_t offset;
+} LDM_hashEntry;
+
+typedef struct LDM_compressStats {
+  U32 numMatches;
+  U32 totalMatchLength;
+  U32 totalLiteralLength;
+  U64 totalOffset;
+} LDM_compressStats;
+
+static void LDM_printCompressStats(const LDM_compressStats *stats) {
+  printf("=====================\n");
+  printf("Compression statistics\n");
+  printf("Total number of matches: %u\n", stats->numMatches);
+  printf("Average match length: %.1f\n", ((double)stats->totalMatchLength) /
+                                         (double)stats->numMatches);
+  printf("Average literal length: %.1f\n",
+         ((double)stats->totalLiteralLength) / (double)stats->numMatches);
+  printf("Average offset length: %.1f\n",
+         ((double)stats->totalOffset) / (double)stats->numMatches);
+  printf("=====================\n");
+}
+
+typedef struct LDM_CCtx {
+  size_t isize;             /* Input size */
+  size_t maxOSize;          /* Maximum output size */
+
+  const BYTE *ibase;        /* Base of input */
+  const BYTE *ip;           /* Current input position */
+  const BYTE *iend;         /* End of input */
+
+  // Maximum input position such that hashing at the position does not exceed
+  // end of input.
+  const BYTE *ihashLimit;
+
+  // Maximum input position such that finding a match of at least the minimum
+  // match length does not exceed end of input.
+  const BYTE *imatchLimit;
+
+  const BYTE *obase;        /* Base of output */
+  BYTE *op;                 /* Output */
+
+  const BYTE *anchor;       /* Anchor to start of current (match) block */
+
+  LDM_compressStats stats;            /* Compression statistics */
+
+  LDM_hashEntry hashTable[LDM_HASHTABLESIZE_U32];
+
+  const BYTE *lastPosHashed;          /* Last position hashed */
+  hash_t lastHash;                    /* Hash corresponding to lastPosHashed */
+  const BYTE *nextIp;
+  hash_t nextHash;                    /* Hash corresponding to nextIp */
+
+  unsigned step;
+} LDM_CCtx;
+
+#ifdef LDM_ROLLING_HASH
+/**
+ * Convert a sum computed from LDM_getRollingHash to a hash value in the range
+ * of the hash table.
+ */
+static hash_t LDM_sumToHash(U32 sum) {
+  return sum % (LDM_HASHTABLESIZE >> 2);
+//  return sum & (LDM_HASHTABLESIZE - 1);
+}
+
+static U32 LDM_getRollingHash(const char *data, U32 len) {
+  U32 i;
+  U32 s1, s2;
+  const schar *buf = (const schar *)data;
+
+  s1 = s2 = 0;
+  for (i = 0; i < (len - 4); i += 4) {
+    s2 += (4 * (s1 + buf[i])) + (3 * buf[i + 1]) +
+          (2 * buf[i + 2]) + (buf[i + 3]);
+    s1 += buf[i] + buf[i + 1] + buf[i + 2] + buf[i + 3];
+  }
+  for(; i < len; i++) {
+    s1 += buf[i];
+    s2 += s1;
+  }
+  return (s1 & 0xffff) + (s2 << 16);
+}
+
+static hash_t LDM_hashPosition(const void * const p) {
+  return LDM_sumToHash(LDM_getRollingHash((const char *)p, LDM_HASH_LENGTH));
+}
+
+typedef struct LDM_sumStruct {
+  U16 s1, s2;
+} LDM_sumStruct;
+
+static void LDM_getRollingHashParts(U32 sum, LDM_sumStruct *sumStruct) {
+  sumStruct->s1 = sum & 0xffff;
+  sumStruct->s2 = sum >> 16;
+}
+
+#else
+static hash_t LDM_hash(U32 sequence) {
+  return ((sequence * 2654435761U) >> ((32)-LDM_HASHLOG));
+}
+
+static hash_t LDM_hashPosition(const void * const p) {
+  return LDM_hash(LDM_read32(p));
+}
+#endif
+
+/*
+static hash_t LDM_hash5(U64 sequence) {
+  static const U64 prime5bytes = 889523592379ULL;
+  static const U64 prime8bytes = 11400714785074694791ULL;
+  const U32 hashLog = LDM_HASHLOG;
+  if (LDM_isLittleEndian())
+    return (((sequence << 24) * prime5bytes) >> (64 - hashLog));
+  else
+    return (((sequence >> 24) * prime8bytes) >> (64 - hashLog));
+}
+*/
+
+static void LDM_putHashOfCurrentPositionFromHash(
+    LDM_CCtx *cctx, hash_t hash) {
+  if (((cctx->ip - cctx->ibase) & HASH_EVERY) != HASH_EVERY) {
+    return;
+  }
+  (cctx->hashTable)[hash] = (LDM_hashEntry){ (hash_t)(cctx->ip - cctx->ibase) };
+  cctx->lastPosHashed = cctx->ip;
+  cctx->lastHash = hash;
+}
+
+static void LDM_putHashOfCurrentPosition(LDM_CCtx *cctx) {
+  hash_t hash = LDM_hashPosition(cctx->ip);
+  LDM_putHashOfCurrentPositionFromHash(cctx, hash);
+}
+
+static const BYTE *LDM_get_position_on_hash(
+    hash_t h, void *tableBase, const BYTE *srcBase) {
+  const LDM_hashEntry * const hashTable = (LDM_hashEntry *)tableBase;
+  return hashTable[h].offset + srcBase;
+}
+
+static BYTE LDM_read_byte(const void *memPtr) {
+  BYTE val;
+  memcpy(&val, memPtr, 1);
+  return val;
+}
+
+static unsigned LDM_count(const BYTE *pIn, const BYTE *pMatch,
+                          const BYTE *pInLimit) {
+  const BYTE * const pStart = pIn;
+  while (pIn < pInLimit - 1) {
+    BYTE const diff = LDM_read_byte(pMatch) ^ LDM_read_byte(pIn);
+    if (!diff) {
+      pIn++;
+      pMatch++;
+      continue;
+    }
+    return (unsigned)(pIn - pStart);
+  }
+  return (unsigned)(pIn - pStart);
+}
+
+void LDM_readHeader(const void *src, size_t *compressSize,
+                    size_t *decompressSize) {
+  const U32 *ip = (const U32 *)src;
+  *compressSize = *ip++;
+  *decompressSize = *ip;
+}
+
+static void LDM_initializeCCtx(LDM_CCtx *cctx,
+                               const void *src, size_t srcSize,
+                               void *dst, size_t maxDstSize) {
+  cctx->isize = srcSize;
+  cctx->maxOSize = maxDstSize;
+
+  cctx->ibase = (const BYTE *)src;
+  cctx->ip = cctx->ibase;
+  cctx->iend = cctx->ibase + srcSize;
+
+  cctx->ihashLimit = cctx->iend - HASH_SIZE;
+  cctx->imatchLimit = cctx->iend - MINMATCH;
+
+  cctx->obase = (BYTE *)dst;
+  cctx->op = (BYTE *)dst;
+
+  cctx->anchor = cctx->ibase;
+
+  memset(&(cctx->stats), 0, sizeof(cctx->stats));
+  memset(cctx->hashTable, 0, sizeof(cctx->hashTable));
+
+  cctx->lastPosHashed = NULL;
+  cctx->nextIp = NULL;
+
+  cctx->step = 1;
+}
+
+static int LDM_findBestMatch(LDM_CCtx *cctx, const BYTE **match) {
+  cctx->nextIp = cctx->ip;
+
+  do {
+    hash_t const h = cctx->nextHash;
+    cctx->ip = cctx->nextIp;
+    cctx->nextIp += cctx->step;
+
+    if (cctx->nextIp > cctx->imatchLimit) {
+      return 1;
+    }
+
+    *match = LDM_get_position_on_hash(h, cctx->hashTable, cctx->ibase);
+
+    cctx->nextHash = LDM_hashPosition(cctx->nextIp);
+    LDM_putHashOfCurrentPositionFromHash(cctx, h);
+  } while (cctx->ip - *match > WINDOW_SIZE ||
+           LDM_read64(*match) != LDM_read64(cctx->ip));
+  return 0;
+}
+
+// TODO: srcSize and maxDstSize is unused
+size_t LDM_compress(const void *src, size_t srcSize,
+                    void *dst, size_t maxDstSize) {
+  LDM_CCtx cctx;
+  LDM_initializeCCtx(&cctx, src, srcSize, dst, maxDstSize);
+
+  /* Hash the first position and put it into the hash table. */
+  LDM_putHashOfCurrentPosition(&cctx);
+  cctx.ip++;
+  cctx.nextHash = LDM_hashPosition(cctx.ip);
+
+  // TODO: loop condition is not accurate.
+  while (1) {
+    const BYTE *match;
+
+    /**
+     * Find a match.
+     * If no more matches can be found (i.e. the length of the remaining input
+     * is less than the minimum match length), then stop searching for matches
+     * and encode the final literals.
+     */
+    if (LDM_findBestMatch(&cctx, &match) != 0) {
+      goto _last_literals;
+    }
+
+    cctx.stats.numMatches++;
+
+    /**
+     * Catch up: look back to extend the match backwards from the found match.
+     */
+    while (cctx.ip > cctx.anchor && match > cctx.ibase &&
+           cctx.ip[-1] == match[-1]) {
+      cctx.ip--;
+      match--;
+    }
+
+    /**
+     * Write current block (literals, literal length, match offset, match
+     * length) and update pointers and hashes.
+     */
+    {
+      unsigned const literalLength = (unsigned)(cctx.ip - cctx.anchor);
+      unsigned const offset = cctx.ip - match;
+      unsigned const matchLength = LDM_count(
+          cctx.ip + MINMATCH, match + MINMATCH, cctx.ihashLimit);
+      BYTE *token = cctx.op++;
+
+      cctx.stats.totalLiteralLength += literalLength;
+      cctx.stats.totalOffset += offset;
+      cctx.stats.totalMatchLength += matchLength + MINMATCH;
+
+      /* Encode the literal length. */
+      if (literalLength >= RUN_MASK) {
+        int len = (int)literalLength - RUN_MASK;
+        *token = (RUN_MASK << ML_BITS);
+        for (; len >= 255; len -= 255) {
+          *(cctx.op)++ = 255;
+        }
+        *(cctx.op)++ = (BYTE)len;
+      } else {
+        *token = (BYTE)(literalLength << ML_BITS);
+      }
+
+      /* Encode the literals. */
+      memcpy(cctx.op, cctx.anchor, literalLength);
+      cctx.op += literalLength;
+
+      /* Encode the offset. */
+      LDM_write32(cctx.op, offset);
+      cctx.op += LDM_OFFSET_SIZE;
+
+      /* Encode match length */
+      if (matchLength >= ML_MASK) {
+        unsigned matchLengthRemaining = matchLength;
+        *token += ML_MASK;
+        matchLengthRemaining -= ML_MASK;
+        LDM_write32(cctx.op, 0xFFFFFFFF);
+        while (matchLengthRemaining >= 4*0xFF) {
+          cctx.op += 4;
+          LDM_write32(cctx.op, 0xffffffff);
+          matchLengthRemaining -= 4*0xFF;
+        }
+        cctx.op += matchLengthRemaining / 255;
+        *(cctx.op)++ = (BYTE)(matchLengthRemaining % 255);
+      } else {
+        *token += (BYTE)(matchLength);
+      }
+
+      /* Update input pointer, inserting hashes into hash table along the
+       * way.
+       */
+      while (cctx.ip < cctx.anchor + MINMATCH + matchLength + literalLength) {
+        LDM_putHashOfCurrentPosition(&cctx);
+        cctx.ip++;
+      }
+    }
+
+    // Set start of next block to current input pointer.
+    cctx.anchor = cctx.ip;
+    LDM_putHashOfCurrentPosition(&cctx);
+    cctx.nextHash = LDM_hashPosition(++cctx.ip);
+  }
+_last_literals:
+  /* Encode the last literals (no more matches). */
+  {
+    size_t const lastRun = (size_t)(cctx.iend - cctx.anchor);
+    if (lastRun >= RUN_MASK) {
+      size_t accumulator = lastRun - RUN_MASK;
+      *(cctx.op)++ = RUN_MASK << ML_BITS;
+      for(; accumulator >= 255; accumulator -= 255) {
+        *(cctx.op)++ = 255;
+      }
+      *(cctx.op)++ = (BYTE)accumulator;
+    } else {
+      *(cctx.op)++ = (BYTE)(lastRun << ML_BITS);
+    }
+    memcpy(cctx.op, cctx.anchor, lastRun);
+    cctx.op += lastRun;
+  }
+  LDM_printCompressStats(&cctx.stats);
+  return (cctx.op - (const BYTE *)cctx.obase);
+}
+
+typedef struct LDM_DCtx {
+  size_t compressSize;
+  size_t maxDecompressSize;
+
+  const BYTE *ibase;   /* Base of input */
+  const BYTE *ip;      /* Current input position */
+  const BYTE *iend;    /* End of source */
+
+  const BYTE *obase;   /* Base of output */
+  BYTE *op;            /* Current output position */
+  const BYTE *oend;    /* End of output */
+} LDM_DCtx;
+
+static void LDM_initializeDCtx(LDM_DCtx *dctx,
+                               const void *src, size_t compressSize,
+                               void *dst, size_t maxDecompressSize) {
+  dctx->compressSize = compressSize;
+  dctx->maxDecompressSize = maxDecompressSize;
+
+  dctx->ibase = src;
+  dctx->ip = (const BYTE *)src;
+  dctx->iend = dctx->ip + dctx->compressSize;
+  dctx->op = dst;
+  dctx->oend = dctx->op + dctx->maxDecompressSize;
+
+}
+
+size_t LDM_decompress(const void *src, size_t compressSize,
+                      void *dst, size_t maxDecompressSize) {
+  LDM_DCtx dctx;
+  LDM_initializeDCtx(&dctx, src, compressSize, dst, maxDecompressSize);
+
+  while (dctx.ip < dctx.iend) {
+    BYTE *cpy;
+    const BYTE *match;
+    size_t length, offset;
+
+    /* Get the literal length. */
+    unsigned const token = *(dctx.ip)++;
+    if ((length = (token >> ML_BITS)) == RUN_MASK) {
+      unsigned s;
+      do {
+        s = *(dctx.ip)++;
+        length += s;
+      } while (s == 255);
+    }
+
+    /* Copy literals. */
+    cpy = dctx.op + length;
+    memcpy(dctx.op, dctx.ip, length);
+    dctx.ip += length;
+    dctx.op = cpy;
+
+    //TODO : dynamic offset size
+    offset = LDM_read32(dctx.ip);
+    dctx.ip += LDM_OFFSET_SIZE;
+    match = dctx.op - offset;
+
+    /* Get the match length. */
+    length = token & ML_MASK;
+    if (length == ML_MASK) {
+      unsigned s;
+      do {
+        s = *(dctx.ip)++;
+        length += s;
+      } while (s == 255);
+    }
+    length += MINMATCH;
+
+    /* Copy match. */
+    cpy = dctx.op + length;
+
+    // Inefficient for now
+    while (match < cpy - offset && dctx.op < dctx.oend) {
+      *(dctx.op)++ = *match++;
+    }
+  }
+  return dctx.op - (BYTE *)dst;
+}
+
+
diff --git a/contrib/long_distance_matching/versions/v0.3/ldm.h b/contrib/long_distance_matching/versions/v0.3/ldm.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..287d444
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,19 @@
+#ifndef LDM_H
+#define LDM_H
+
+#include <stddef.h>   /* size_t */
+
+#define LDM_COMPRESS_SIZE 4
+#define LDM_DECOMPRESS_SIZE 4
+#define LDM_HEADER_SIZE ((LDM_COMPRESS_SIZE)+(LDM_DECOMPRESS_SIZE))
+
+size_t LDM_compress(const void *src, size_t srcSize,
+                    void *dst, size_t maxDstSize);
+
+size_t LDM_decompress(const void *src, size_t srcSize,
+                      void *dst, size_t maxDstSize);
+
+void LDM_readHeader(const void *src, size_t *compressSize,
+                    size_t *decompressSize);
+
+#endif /* LDM_H */
diff --git a/contrib/long_distance_matching/versions/v0.3/main-ldm.c b/contrib/long_distance_matching/versions/v0.3/main-ldm.c
new file mode 100644 (file)
index 0000000..724d735
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,479 @@
+// TODO: file size must fit into a U32
+
+#include <stdio.h>
+#include <stdlib.h>
+#include <string.h>
+#include <sys/time.h>
+#include <sys/types.h>
+#include <sys/mman.h>
+#include <sys/stat.h>
+#include <unistd.h>
+#include <zstd.h>
+
+#include <fcntl.h>
+#include "ldm.h"
+
+// #define BUF_SIZE 16*1024  // Block size
+#define DEBUG
+
+//#define ZSTD
+
+/* Compress file given by fname and output to oname.
+ * Returns 0 if successful, error code otherwise.
+ */
+static int compress(const char *fname, const char *oname) {
+  int fdin, fdout;
+  struct stat statbuf;
+  char *src, *dst;
+  size_t maxCompressSize, compressSize;
+
+  /* Open the input file. */
+  if ((fdin = open(fname, O_RDONLY)) < 0) {
+    perror("Error in file opening");
+    return 1;
+  }
+
+  /* Open the output file. */
+  if ((fdout = open(oname, O_RDWR | O_CREAT | O_TRUNC, (mode_t)0600)) < 0) {
+    perror("Can't create output file");
+    return 1;
+  }
+
+  /* Find the size of the input file. */
+  if (fstat (fdin, &statbuf) < 0) {
+    perror("Fstat error");
+    return 1;
+  }
+
+  maxCompressSize = statbuf.st_size + LDM_HEADER_SIZE;
+
+ /* Go to the location corresponding to the last byte. */
+ /* TODO: fallocate? */
+  if (lseek(fdout, maxCompressSize - 1, SEEK_SET) == -1) {
+    perror("lseek error");
+    return 1;
+  }
+
+ /* Write a dummy byte at the last location. */
+  if (write(fdout, "", 1) != 1) {
+    perror("write error");
+    return 1;
+  }
+
+  /* mmap the input file. */
+  if ((src = mmap(0, statbuf.st_size, PROT_READ,  MAP_SHARED, fdin, 0))
+          == (caddr_t) - 1) {
+      perror("mmap error for input");
+      return 1;
+  }
+
+  /* mmap the output file */
+  if ((dst = mmap(0, maxCompressSize, PROT_READ | PROT_WRITE,
+                  MAP_SHARED, fdout, 0)) == (caddr_t) - 1) {
+      perror("mmap error for output");
+      return 1;
+  }
+
+#ifdef ZSTD
+  compressSize = ZSTD_compress(dst, statbuf.st_size,
+                                  src, statbuf.st_size, 1);
+#else
+  compressSize = LDM_HEADER_SIZE +
+      LDM_compress(src, statbuf.st_size,
+                   dst + LDM_HEADER_SIZE, statbuf.st_size);
+
+    // Write compress and decompress size to header
+    // TODO: should depend on LDM_DECOMPRESS_SIZE write32
+  memcpy(dst, &compressSize, 4);
+  memcpy(dst + 4, &(statbuf.st_size), 4);
+
+#ifdef DEBUG
+  printf("Compressed size: %zu\n", compressSize);
+  printf("Decompressed size: %zu\n", (size_t)statbuf.st_size);
+#endif
+#endif
+
+  // Truncate file to compressSize.
+  ftruncate(fdout, compressSize);
+
+  printf("%25s : %6u -> %7u - %s (%.1f%%)\n", fname,
+         (unsigned)statbuf.st_size, (unsigned)compressSize, oname,
+         (double)compressSize / (statbuf.st_size) * 100);
+
+  // Close files.
+  close(fdin);
+  close(fdout);
+  return 0;
+}
+
+/* Decompress file compressed using LDM_compress.
+ * The input file should have the LDM_HEADER followed by payload.
+ * Returns 0 if succesful, and an error code otherwise.
+ */
+static int decompress(const char *fname, const char *oname) {
+  int fdin, fdout;
+  struct stat statbuf;
+  char *src, *dst;
+  size_t compressSize, decompressSize, outSize;
+
+  /* Open the input file. */
+  if ((fdin = open(fname, O_RDONLY)) < 0) {
+    perror("Error in file opening");
+    return 1;
+  }
+
+  /* Open the output file. */
+  if ((fdout = open(oname, O_RDWR | O_CREAT | O_TRUNC, (mode_t)0600)) < 0) {
+    perror("Can't create output file");
+    return 1;
+  }
+
+  /* Find the size of the input file. */
+  if (fstat (fdin, &statbuf) < 0) {
+    perror("Fstat error");
+    return 1;
+  }
+
+  /* mmap the input file. */
+  if ((src = mmap(0, statbuf.st_size, PROT_READ,  MAP_SHARED, fdin, 0))
+          == (caddr_t) - 1) {
+      perror("mmap error for input");
+      return 1;
+  }
+
+  /* Read the header. */
+  LDM_readHeader(src, &compressSize, &decompressSize);
+
+#ifdef DEBUG
+  printf("Size, compressSize, decompressSize: %zu %zu %zu\n",
+         (size_t)statbuf.st_size, compressSize, decompressSize);
+#endif
+
+  /* Go to the location corresponding to the last byte. */
+  if (lseek(fdout, decompressSize - 1, SEEK_SET) == -1) {
+    perror("lseek error");
+    return 1;
+  }
+
+  /* write a dummy byte at the last location */
+  if (write(fdout, "", 1) != 1) {
+    perror("write error");
+    return 1;
+  }
+
+  /* mmap the output file */
+  if ((dst = mmap(0, decompressSize, PROT_READ | PROT_WRITE,
+                  MAP_SHARED, fdout, 0)) == (caddr_t) - 1) {
+      perror("mmap error for output");
+      return 1;
+  }
+
+#ifdef ZSTD
+  outSize = ZSTD_decompress(dst, decomrpessed_size,
+                                  src + LDM_HEADER_SIZE,
+                                  statbuf.st_size - LDM_HEADER_SIZE);
+#else
+  outSize = LDM_decompress(
+      src + LDM_HEADER_SIZE, statbuf.st_size - LDM_HEADER_SIZE,
+      dst, decompressSize);
+
+  printf("Ret size out: %zu\n", outSize);
+  #endif
+  ftruncate(fdout, outSize);
+
+  close(fdin);
+  close(fdout);
+  return 0;
+}
+
+/* Compare two files.
+ * Returns 0 iff they are the same.
+ */
+static int compare(FILE *fp0, FILE *fp1) {
+  int result = 0;
+  while (result == 0) {
+    char b0[1024];
+    char b1[1024];
+    const size_t r0 = fread(b0, 1, sizeof(b0), fp0);
+    const size_t r1 = fread(b1, 1, sizeof(b1), fp1);
+
+    result = (int)r0 - (int)r1;
+
+    if (0 == r0 || 0 == r1) break;
+
+    if (0 == result) result = memcmp(b0, b1, r0);
+  }
+  return result;
+}
+
+/* Verify the input file is the same as the decompressed file. */
+static void verify(const char *inpFilename, const char *decFilename) {
+  FILE *inpFp = fopen(inpFilename, "rb");
+  FILE *decFp = fopen(decFilename, "rb");
+
+  printf("verify : %s <-> %s\n", inpFilename, decFilename);
+  {
+    const int cmp = compare(inpFp, decFp);
+    if(0 == cmp) {
+      printf("verify : OK\n");
+    } else {
+      printf("verify : NG\n");
+    }
+  }
+
+       fclose(decFp);
+       fclose(inpFp);
+}
+
+int main(int argc, const char *argv[]) {
+  const char * const exeName = argv[0];
+  char inpFilename[256] = { 0 };
+  char ldmFilename[256] = { 0 };
+  char decFilename[256] = { 0 };
+
+  if (argc < 2) {
+    printf("Wrong arguments\n");
+    printf("Usage:\n");
+    printf("%s FILE\n", exeName);
+    return 1;
+  }
+
+  snprintf(inpFilename, 256, "%s", argv[1]);
+  snprintf(ldmFilename, 256, "%s.ldm", argv[1]);
+  snprintf(decFilename, 256, "%s.ldm.dec", argv[1]);
+
+       printf("inp = [%s]\n", inpFilename);
+       printf("ldm = [%s]\n", ldmFilename);
+       printf("dec = [%s]\n", decFilename);
+
+
+  /* Compress */
+  {
+    struct timeval tv1, tv2;
+    gettimeofday(&tv1, NULL);
+    if (compress(inpFilename, ldmFilename)) {
+        printf("Compress error");
+        return 1;
+    }
+    gettimeofday(&tv2, NULL);
+    printf("Total time = %f seconds\n",
+           (double) (tv2.tv_usec - tv1.tv_usec) / 1000000 +
+           (double) (tv2.tv_sec - tv1.tv_sec));
+  }
+
+  /* Decompress */
+  {
+    struct timeval tv1, tv2;
+    gettimeofday(&tv1, NULL);
+    if (decompress(ldmFilename, decFilename)) {
+        printf("Decompress error");
+        return 1;
+    }
+    gettimeofday(&tv2, NULL);
+    printf("Total time = %f seconds\n",
+          (double) (tv2.tv_usec - tv1.tv_usec) / 1000000 +
+          (double) (tv2.tv_sec - tv1.tv_sec));
+  }
+  /* verify */
+  verify(inpFilename, decFilename);
+  return 0;
+}
+
+
+#if 0
+static size_t compress_file(FILE *in, FILE *out, size_t *size_in,
+                            size_t *size_out) {
+  char *src, *buf = NULL;
+  size_t r = 1;
+  size_t size, n, k, count_in = 0, count_out = 0, offset, frame_size = 0;
+
+  src = malloc(BUF_SIZE);
+  if (!src) {
+    printf("Not enough memory\n");
+    goto cleanup;
+  }
+
+  size = BUF_SIZE + LDM_HEADER_SIZE;
+  buf = malloc(size);
+  if (!buf) {
+    printf("Not enough memory\n");
+    goto cleanup;
+  }
+
+
+  for (;;) {
+    k = fread(src, 1, BUF_SIZE, in);
+    if (k == 0)
+      break;
+    count_in += k;
+
+    n = LDM_compress(src, buf, k, BUF_SIZE);
+
+    // n = k;
+    // offset += n;
+    offset = k;
+    count_out += k;
+
+//    k = fwrite(src, 1, offset, out);
+
+    k = fwrite(buf, 1, offset, out);
+    if (k < offset) {
+      if (ferror(out))
+        printf("Write failed\n");
+      else
+        printf("Short write\n");
+      goto cleanup;
+    }
+
+  }
+  *size_in = count_in;
+  *size_out = count_out;
+  r = 0;
+ cleanup:
+  free(src);
+  free(buf);
+  return r;
+}
+
+static size_t decompress_file(FILE *in, FILE *out) {
+  void *src = malloc(BUF_SIZE);
+  void *dst = NULL;
+  size_t dst_capacity = BUF_SIZE;
+  size_t ret = 1;
+  size_t bytes_written = 0;
+
+  if (!src) {
+    perror("decompress_file(src)");
+    goto cleanup;
+  }
+
+  while (ret != 0) {
+    /* Load more input */
+    size_t src_size = fread(src, 1, BUF_SIZE, in);
+    void *src_ptr = src;
+    void *src_end = src_ptr + src_size;
+    if (src_size == 0 || ferror(in)) {
+      printf("(TODO): Decompress: not enough input or error reading file\n");
+      //TODO
+      ret = 0;
+      goto cleanup;
+    }
+
+    /* Allocate destination buffer if it hasn't been allocated already */
+    if (!dst) {
+      dst = malloc(dst_capacity);
+      if (!dst) {
+        perror("decompress_file(dst)");
+        goto cleanup;
+      }
+    }
+
+    // TODO
+
+    /* Decompress:
+     * Continue while there is more input to read.
+     */
+    while (src_ptr != src_end && ret != 0) {
+      // size_t dst_size = src_size;
+      size_t dst_size = LDM_decompress(src, dst, src_size, dst_capacity);
+      size_t written = fwrite(dst, 1, dst_size, out);
+//      printf("Writing %zu bytes\n", dst_size);
+      bytes_written += dst_size;
+      if (written != dst_size) {
+        printf("Decompress: Failed to write to file\n");
+        goto cleanup;
+      }
+      src_ptr += src_size;
+      src_size = src_end - src_ptr;
+    }
+
+    /* Update input */
+
+  }
+
+  printf("Wrote %zu bytes\n", bytes_written);
+
+ cleanup:
+  free(src);
+  free(dst);
+
+  return ret;
+}
+
+int main2(int argc, char *argv[]) {
+  char inpFilename[256] = { 0 };
+  char ldmFilename[256] = { 0 };
+  char decFilename[256] = { 0 };
+
+  if (argc < 2) {
+    printf("Please specify input filename\n");
+    return 0;
+  }
+  snprintf(inpFilename, 256, "%s", argv[1]);
+  snprintf(ldmFilename, 256, "%s.ldm", argv[1]);
+  snprintf(decFilename, 256, "%s.ldm.dec", argv[1]);
+
+    printf("inp = [%s]\n", inpFilename);
+       printf("ldm = [%s]\n", ldmFilename);
+       printf("dec = [%s]\n", decFilename);
+
+  /* compress */
+  {
+    FILE *inpFp = fopen(inpFilename, "rb");
+    FILE *outFp = fopen(ldmFilename, "wb");
+    size_t sizeIn = 0;
+    size_t sizeOut = 0;
+    size_t ret;
+               printf("compress : %s -> %s\n", inpFilename, ldmFilename);
+               ret = compress_file(inpFp, outFp, &sizeIn, &sizeOut);
+               if (ret) {
+                       printf("compress : failed with code %zu\n", ret);
+                       return ret;
+               }
+               printf("%s: %zu → %zu bytes, %.1f%%\n",
+                       inpFilename, sizeIn, sizeOut,
+                       (double)sizeOut / sizeIn * 100);
+               printf("compress : done\n");
+
+               fclose(outFp);
+               fclose(inpFp);
+  }
+
+       /* decompress */
+       {
+    FILE *inpFp = fopen(ldmFilename, "rb");
+               FILE *outFp = fopen(decFilename, "wb");
+               size_t ret;
+
+               printf("decompress : %s -> %s\n", ldmFilename, decFilename);
+               ret = decompress_file(inpFp, outFp);
+               if (ret) {
+                       printf("decompress : failed with code %zu\n", ret);
+                       return ret;
+               }
+               printf("decompress : done\n");
+
+               fclose(outFp);
+               fclose(inpFp);
+       }
+
+       /* verify */
+       {
+    FILE *inpFp = fopen(inpFilename, "rb");
+               FILE *decFp = fopen(decFilename, "rb");
+
+               printf("verify : %s <-> %s\n", inpFilename, decFilename);
+               const int cmp = compare(inpFp, decFp);
+               if(0 == cmp) {
+                       printf("verify : OK\n");
+               } else {
+                       printf("verify : NG\n");
+               }
+
+               fclose(decFp);
+               fclose(inpFp);
+       }
+  return 0;
+}
+#endif
+
diff --git a/contrib/long_distance_matching/versions/v0.3/util.c b/contrib/long_distance_matching/versions/v0.3/util.c
new file mode 100644 (file)
index 0000000..9ea4ca1
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,64 @@
+#include <stdlib.h>
+#include <string.h>
+#include <stdint.h>
+#include <stdio.h>
+
+#include "util.h"
+
+typedef  uint8_t BYTE;
+typedef uint16_t U16;
+typedef uint32_t U32;
+typedef  int32_t S32;
+typedef uint64_t U64;
+
+unsigned LDM_isLittleEndian(void) {
+    const union { U32 u; BYTE c[4]; } one = { 1 };
+    return one.c[0];
+}
+
+U16 LDM_read16(const void *memPtr) {
+  U16 val;
+  memcpy(&val, memPtr, sizeof(val));
+  return val;
+}
+
+U16 LDM_readLE16(const void *memPtr) {
+  if (LDM_isLittleEndian()) {
+    return LDM_read16(memPtr);
+  } else {
+    const BYTE *p = (const BYTE *)memPtr;
+    return (U16)((U16)p[0] + (p[1] << 8));
+  }
+}
+
+void LDM_write16(void *memPtr, U16 value){
+  memcpy(memPtr, &value, sizeof(value));
+}
+
+void LDM_write32(void *memPtr, U32 value) {
+  memcpy(memPtr, &value, sizeof(value));
+}
+
+void LDM_writeLE16(void *memPtr, U16 value) {
+  if (LDM_isLittleEndian()) {
+    LDM_write16(memPtr, value);
+  } else {
+    BYTE* p = (BYTE *)memPtr;
+    p[0] = (BYTE) value;
+    p[1] = (BYTE)(value>>8);
+  }
+}
+
+U32 LDM_read32(const void *ptr) {
+  return *(const U32 *)ptr;
+}
+
+U64 LDM_read64(const void *ptr) {
+  return *(const U64 *)ptr;
+}
+
+void LDM_copy8(void *dst, const void *src) {
+  memcpy(dst, src, 8);
+}
+
+
diff --git a/contrib/long_distance_matching/versions/v0.3/util.h b/contrib/long_distance_matching/versions/v0.3/util.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..9072641
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,23 @@
+#ifndef LDM_UTIL_H
+#define LDM_UTIL_H
+
+unsigned LDM_isLittleEndian(void);
+
+uint16_t LDM_read16(const void *memPtr);
+
+uint16_t LDM_readLE16(const void *memPtr);
+
+void LDM_write16(void *memPtr, uint16_t value);
+
+void LDM_write32(void *memPtr, uint32_t value);
+
+void LDM_writeLE16(void *memPtr, uint16_t value);
+
+uint32_t LDM_read32(const void *ptr);
+
+uint64_t LDM_read64(const void *ptr);
+
+void LDM_copy8(void *dst, const void *src);
+
+
+#endif /* LDM_UTIL_H */