]> git.ipfire.org Git - thirdparty/zstd.git/commitdiff
Save v3
authorStella Lau <laus@fb.com>
Tue, 11 Jul 2017 16:23:44 +0000 (09:23 -0700)
committerStella Lau <laus@fb.com>
Tue, 11 Jul 2017 16:23:44 +0000 (09:23 -0700)
contrib/long_distance_matching/ldm.c
contrib/long_distance_matching/versions/v3/Makefile [new file with mode: 0644]
contrib/long_distance_matching/versions/v3/ldm.c [new file with mode: 0644]
contrib/long_distance_matching/versions/v3/ldm.h [new file with mode: 0644]
contrib/long_distance_matching/versions/v3/main-ldm.c [new file with mode: 0644]
contrib/long_distance_matching/versions/v3/util.c [new file with mode: 0644]
contrib/long_distance_matching/versions/v3/util.h [new file with mode: 0644]

index 42a4affd702032df1e2da2ac06c43cf225876d44..1dedf5c37988fcfdbb45236fddba125c8bf489f9 100644 (file)
@@ -7,9 +7,9 @@
 #include "ldm.h"
 #include "util.h"
 
-#define HASH_EVERY 7
+#define HASH_EVERY 1
 
-#define LDM_MEMORY_USAGE 20
+#define LDM_MEMORY_USAGE 16
 #define LDM_HASHLOG (LDM_MEMORY_USAGE-2)
 #define LDM_HASHTABLESIZE (1 << (LDM_MEMORY_USAGE))
 #define LDM_HASHTABLESIZE_U32 ((LDM_HASHTABLESIZE) >> 2)
@@ -17,7 +17,7 @@
 
 #define LDM_OFFSET_SIZE 4
 
-#define WINDOW_SIZE (1 << 24)
+#define WINDOW_SIZE (1 << 20)
 #define MAX_WINDOW_SIZE 31
 #define HASH_SIZE 4
 #define LDM_HASH_LENGTH 4
@@ -28,7 +28,7 @@
 #define RUN_BITS (8-ML_BITS)
 #define RUN_MASK ((1U<<RUN_BITS)-1)
 
-#define LDM_ROLLING_HASH
+//#define LDM_ROLLING_HASH
 //#define LDM_DEBUG
 
 typedef  uint8_t BYTE;
diff --git a/contrib/long_distance_matching/versions/v3/Makefile b/contrib/long_distance_matching/versions/v3/Makefile
new file mode 100644 (file)
index 0000000..5ffd4ea
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,40 @@
+# ################################################################
+# Copyright (c) 2016-present, Yann Collet, Facebook, Inc.
+# All rights reserved.
+#
+# This source code is licensed under the BSD-style license found in the
+# LICENSE file in the root directory of this source tree. An additional grant
+# of patent rights can be found in the PATENTS file in the same directory.
+# ################################################################
+
+# This Makefile presumes libzstd is installed, using `sudo make install`
+
+CFLAGS  ?= -O3
+DEBUGFLAGS = -Wall -Wextra -Wcast-qual -Wcast-align -Wshadow \
+            -Wstrict-aliasing=1 -Wswitch-enum -Wdeclaration-after-statement \
+            -Wstrict-prototypes -Wundef -Wpointer-arith -Wformat-security \
+            -Wvla -Wformat=2 -Winit-self -Wfloat-equal -Wwrite-strings \
+            -Wredundant-decls
+CFLAGS  += $(DEBUGFLAGS) $(MOREFLAGS)
+FLAGS    = $(CPPFLAGS) $(CFLAGS)
+
+LDFLAGS += -lzstd
+
+.PHONY: default all clean
+
+default: all
+
+all: main-ldm
+
+
+#main : ldm.c main.c
+#      $(CC) $(CPPFLAGS) $(CFLAGS) $^ $(LDFLAGS) -o $@
+
+main-ldm : util.c ldm.c main-ldm.c
+       $(CC) $(CPPFLAGS) $(CFLAGS) $^ $(LDFLAGS) -o $@
+
+clean:
+       @rm -f core *.o tmp* result* *.ldm *.ldm.dec \
+       main main-ldm
+       @echo Cleaning completed
+
diff --git a/contrib/long_distance_matching/versions/v3/ldm.c b/contrib/long_distance_matching/versions/v3/ldm.c
new file mode 100644 (file)
index 0000000..1dedf5c
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,464 @@
+#include <stdlib.h>
+#include <string.h>
+#include <stdint.h>
+#include <stdio.h>
+
+
+#include "ldm.h"
+#include "util.h"
+
+#define HASH_EVERY 1
+
+#define LDM_MEMORY_USAGE 16
+#define LDM_HASHLOG (LDM_MEMORY_USAGE-2)
+#define LDM_HASHTABLESIZE (1 << (LDM_MEMORY_USAGE))
+#define LDM_HASHTABLESIZE_U32 ((LDM_HASHTABLESIZE) >> 2)
+#define LDM_HASH_SIZE_U32 (1 << (LDM_HASHLOG))
+
+#define LDM_OFFSET_SIZE 4
+
+#define WINDOW_SIZE (1 << 20)
+#define MAX_WINDOW_SIZE 31
+#define HASH_SIZE 4
+#define LDM_HASH_LENGTH 4
+#define MINMATCH 4
+
+#define ML_BITS 4
+#define ML_MASK ((1U<<ML_BITS)-1)
+#define RUN_BITS (8-ML_BITS)
+#define RUN_MASK ((1U<<RUN_BITS)-1)
+
+//#define LDM_ROLLING_HASH
+//#define LDM_DEBUG
+
+typedef  uint8_t BYTE;
+typedef uint16_t U16;
+typedef uint32_t U32;
+typedef  int32_t S32;
+typedef uint64_t U64;
+
+typedef uint32_t offset_t;
+typedef uint32_t hash_t;
+typedef signed char schar;
+
+typedef struct LDM_hashEntry {
+  offset_t offset;
+} LDM_hashEntry;
+
+typedef struct LDM_compressStats {
+  U32 numMatches;
+  U32 totalMatchLength;
+  U32 totalLiteralLength;
+  U64 totalOffset;
+} LDM_compressStats;
+
+static void LDM_printCompressStats(const LDM_compressStats *stats) {
+  printf("=====================\n");
+  printf("Compression statistics\n");
+  printf("Total number of matches: %u\n", stats->numMatches);
+  printf("Average match length: %.1f\n", ((double)stats->totalMatchLength) /
+                                         (double)stats->numMatches);
+  printf("Average literal length: %.1f\n",
+         ((double)stats->totalLiteralLength) / (double)stats->numMatches);
+  printf("Average offset length: %.1f\n",
+         ((double)stats->totalOffset) / (double)stats->numMatches);
+  printf("=====================\n");
+}
+
+typedef struct LDM_CCtx {
+  size_t isize;             /* Input size */
+  size_t maxOSize;          /* Maximum output size */
+
+  const BYTE *ibase;        /* Base of input */
+  const BYTE *ip;           /* Current input position */
+  const BYTE *iend;         /* End of input */
+
+  // Maximum input position such that hashing at the position does not exceed
+  // end of input.
+  const BYTE *ihashLimit;
+
+  // Maximum input position such that finding a match of at least the minimum
+  // match length does not exceed end of input.
+  const BYTE *imatchLimit;
+
+  const BYTE *obase;        /* Base of output */
+  BYTE *op;                 /* Output */
+
+  const BYTE *anchor;       /* Anchor to start of current (match) block */
+
+  LDM_compressStats stats;            /* Compression statistics */
+
+  LDM_hashEntry hashTable[LDM_HASHTABLESIZE_U32];
+
+  const BYTE *lastPosHashed;          /* Last position hashed */
+  hash_t lastHash;                    /* Hash corresponding to lastPosHashed */
+  const BYTE *nextIp;
+  hash_t nextHash;                    /* Hash corresponding to nextIp */
+
+  unsigned step;
+} LDM_CCtx;
+
+#ifdef LDM_ROLLING_HASH
+/**
+ * Convert a sum computed from LDM_getRollingHash to a hash value in the range
+ * of the hash table.
+ */
+static hash_t LDM_sumToHash(U32 sum) {
+  return sum % (LDM_HASHTABLESIZE >> 2);
+//  return sum & (LDM_HASHTABLESIZE - 1);
+}
+
+static U32 LDM_getRollingHash(const char *data, U32 len) {
+  U32 i;
+  U32 s1, s2;
+  const schar *buf = (const schar *)data;
+
+  s1 = s2 = 0;
+  for (i = 0; i < (len - 4); i += 4) {
+    s2 += (4 * (s1 + buf[i])) + (3 * buf[i + 1]) +
+          (2 * buf[i + 2]) + (buf[i + 3]);
+    s1 += buf[i] + buf[i + 1] + buf[i + 2] + buf[i + 3];
+  }
+  for(; i < len; i++) {
+    s1 += buf[i];
+    s2 += s1;
+  }
+  return (s1 & 0xffff) + (s2 << 16);
+}
+
+static hash_t LDM_hashPosition(const void * const p) {
+  return LDM_sumToHash(LDM_getRollingHash((const char *)p, LDM_HASH_LENGTH));
+}
+
+typedef struct LDM_sumStruct {
+  U16 s1, s2;
+} LDM_sumStruct;
+
+static void LDM_getRollingHashParts(U32 sum, LDM_sumStruct *sumStruct) {
+  sumStruct->s1 = sum & 0xffff;
+  sumStruct->s2 = sum >> 16;
+}
+
+#else
+static hash_t LDM_hash(U32 sequence) {
+  return ((sequence * 2654435761U) >> ((32)-LDM_HASHLOG));
+}
+
+static hash_t LDM_hashPosition(const void * const p) {
+  return LDM_hash(LDM_read32(p));
+}
+#endif
+
+/*
+static hash_t LDM_hash5(U64 sequence) {
+  static const U64 prime5bytes = 889523592379ULL;
+  static const U64 prime8bytes = 11400714785074694791ULL;
+  const U32 hashLog = LDM_HASHLOG;
+  if (LDM_isLittleEndian())
+    return (((sequence << 24) * prime5bytes) >> (64 - hashLog));
+  else
+    return (((sequence >> 24) * prime8bytes) >> (64 - hashLog));
+}
+*/
+
+static void LDM_putHashOfCurrentPositionFromHash(
+    LDM_CCtx *cctx, hash_t hash) {
+  if (((cctx->ip - cctx->ibase) & HASH_EVERY) != HASH_EVERY) {
+    return;
+  }
+  (cctx->hashTable)[hash] = (LDM_hashEntry){ (hash_t)(cctx->ip - cctx->ibase) };
+  cctx->lastPosHashed = cctx->ip;
+  cctx->lastHash = hash;
+}
+
+static void LDM_putHashOfCurrentPosition(LDM_CCtx *cctx) {
+  hash_t hash = LDM_hashPosition(cctx->ip);
+  LDM_putHashOfCurrentPositionFromHash(cctx, hash);
+}
+
+static const BYTE *LDM_get_position_on_hash(
+    hash_t h, void *tableBase, const BYTE *srcBase) {
+  const LDM_hashEntry * const hashTable = (LDM_hashEntry *)tableBase;
+  return hashTable[h].offset + srcBase;
+}
+
+static BYTE LDM_read_byte(const void *memPtr) {
+  BYTE val;
+  memcpy(&val, memPtr, 1);
+  return val;
+}
+
+static unsigned LDM_count(const BYTE *pIn, const BYTE *pMatch,
+                          const BYTE *pInLimit) {
+  const BYTE * const pStart = pIn;
+  while (pIn < pInLimit - 1) {
+    BYTE const diff = LDM_read_byte(pMatch) ^ LDM_read_byte(pIn);
+    if (!diff) {
+      pIn++;
+      pMatch++;
+      continue;
+    }
+    return (unsigned)(pIn - pStart);
+  }
+  return (unsigned)(pIn - pStart);
+}
+
+void LDM_readHeader(const void *src, size_t *compressSize,
+                    size_t *decompressSize) {
+  const U32 *ip = (const U32 *)src;
+  *compressSize = *ip++;
+  *decompressSize = *ip;
+}
+
+static void LDM_initializeCCtx(LDM_CCtx *cctx,
+                               const void *src, size_t srcSize,
+                               void *dst, size_t maxDstSize) {
+  cctx->isize = srcSize;
+  cctx->maxOSize = maxDstSize;
+
+  cctx->ibase = (const BYTE *)src;
+  cctx->ip = cctx->ibase;
+  cctx->iend = cctx->ibase + srcSize;
+
+  cctx->ihashLimit = cctx->iend - HASH_SIZE;
+  cctx->imatchLimit = cctx->iend - MINMATCH;
+
+  cctx->obase = (BYTE *)dst;
+  cctx->op = (BYTE *)dst;
+
+  cctx->anchor = cctx->ibase;
+
+  memset(&(cctx->stats), 0, sizeof(cctx->stats));
+  memset(cctx->hashTable, 0, sizeof(cctx->hashTable));
+
+  cctx->lastPosHashed = NULL;
+  cctx->nextIp = NULL;
+
+  cctx->step = 1;
+}
+
+static int LDM_findBestMatch(LDM_CCtx *cctx, const BYTE **match) {
+  cctx->nextIp = cctx->ip;
+
+  do {
+    hash_t const h = cctx->nextHash;
+    cctx->ip = cctx->nextIp;
+    cctx->nextIp += cctx->step;
+
+    if (cctx->nextIp > cctx->imatchLimit) {
+      return 1;
+    }
+
+    *match = LDM_get_position_on_hash(h, cctx->hashTable, cctx->ibase);
+
+    cctx->nextHash = LDM_hashPosition(cctx->nextIp);
+    LDM_putHashOfCurrentPositionFromHash(cctx, h);
+  } while (cctx->ip - *match > WINDOW_SIZE ||
+           LDM_read64(*match) != LDM_read64(cctx->ip));
+  return 0;
+}
+
+// TODO: srcSize and maxDstSize is unused
+size_t LDM_compress(const void *src, size_t srcSize,
+                    void *dst, size_t maxDstSize) {
+  LDM_CCtx cctx;
+  LDM_initializeCCtx(&cctx, src, srcSize, dst, maxDstSize);
+
+  /* Hash the first position and put it into the hash table. */
+  LDM_putHashOfCurrentPosition(&cctx);
+  cctx.ip++;
+  cctx.nextHash = LDM_hashPosition(cctx.ip);
+
+  // TODO: loop condition is not accurate.
+  while (1) {
+    const BYTE *match;
+
+    /**
+     * Find a match.
+     * If no more matches can be found (i.e. the length of the remaining input
+     * is less than the minimum match length), then stop searching for matches
+     * and encode the final literals.
+     */
+    if (LDM_findBestMatch(&cctx, &match) != 0) {
+      goto _last_literals;
+    }
+
+    cctx.stats.numMatches++;
+
+    /**
+     * Catch up: look back to extend the match backwards from the found match.
+     */
+    while (cctx.ip > cctx.anchor && match > cctx.ibase &&
+           cctx.ip[-1] == match[-1]) {
+      cctx.ip--;
+      match--;
+    }
+
+    /**
+     * Write current block (literals, literal length, match offset, match
+     * length) and update pointers and hashes.
+     */
+    {
+      unsigned const literalLength = (unsigned)(cctx.ip - cctx.anchor);
+      unsigned const offset = cctx.ip - match;
+      unsigned const matchLength = LDM_count(
+          cctx.ip + MINMATCH, match + MINMATCH, cctx.ihashLimit);
+      BYTE *token = cctx.op++;
+
+      cctx.stats.totalLiteralLength += literalLength;
+      cctx.stats.totalOffset += offset;
+      cctx.stats.totalMatchLength += matchLength + MINMATCH;
+
+      /* Encode the literal length. */
+      if (literalLength >= RUN_MASK) {
+        int len = (int)literalLength - RUN_MASK;
+        *token = (RUN_MASK << ML_BITS);
+        for (; len >= 255; len -= 255) {
+          *(cctx.op)++ = 255;
+        }
+        *(cctx.op)++ = (BYTE)len;
+      } else {
+        *token = (BYTE)(literalLength << ML_BITS);
+      }
+
+      /* Encode the literals. */
+      memcpy(cctx.op, cctx.anchor, literalLength);
+      cctx.op += literalLength;
+
+      /* Encode the offset. */
+      LDM_write32(cctx.op, offset);
+      cctx.op += LDM_OFFSET_SIZE;
+
+      /* Encode match length */
+      if (matchLength >= ML_MASK) {
+        unsigned matchLengthRemaining = matchLength;
+        *token += ML_MASK;
+        matchLengthRemaining -= ML_MASK;
+        LDM_write32(cctx.op, 0xFFFFFFFF);
+        while (matchLengthRemaining >= 4*0xFF) {
+          cctx.op += 4;
+          LDM_write32(cctx.op, 0xffffffff);
+          matchLengthRemaining -= 4*0xFF;
+        }
+        cctx.op += matchLengthRemaining / 255;
+        *(cctx.op)++ = (BYTE)(matchLengthRemaining % 255);
+      } else {
+        *token += (BYTE)(matchLength);
+      }
+
+      /* Update input pointer, inserting hashes into hash table along the
+       * way.
+       */
+      while (cctx.ip < cctx.anchor + MINMATCH + matchLength + literalLength) {
+        LDM_putHashOfCurrentPosition(&cctx);
+        cctx.ip++;
+      }
+    }
+
+    // Set start of next block to current input pointer.
+    cctx.anchor = cctx.ip;
+    LDM_putHashOfCurrentPosition(&cctx);
+    cctx.nextHash = LDM_hashPosition(++cctx.ip);
+  }
+_last_literals:
+  /* Encode the last literals (no more matches). */
+  {
+    size_t const lastRun = (size_t)(cctx.iend - cctx.anchor);
+    if (lastRun >= RUN_MASK) {
+      size_t accumulator = lastRun - RUN_MASK;
+      *(cctx.op)++ = RUN_MASK << ML_BITS;
+      for(; accumulator >= 255; accumulator -= 255) {
+        *(cctx.op)++ = 255;
+      }
+      *(cctx.op)++ = (BYTE)accumulator;
+    } else {
+      *(cctx.op)++ = (BYTE)(lastRun << ML_BITS);
+    }
+    memcpy(cctx.op, cctx.anchor, lastRun);
+    cctx.op += lastRun;
+  }
+  LDM_printCompressStats(&cctx.stats);
+  return (cctx.op - (const BYTE *)cctx.obase);
+}
+
+typedef struct LDM_DCtx {
+  size_t compressSize;
+  size_t maxDecompressSize;
+
+  const BYTE *ibase;   /* Base of input */
+  const BYTE *ip;      /* Current input position */
+  const BYTE *iend;    /* End of source */
+
+  const BYTE *obase;   /* Base of output */
+  BYTE *op;            /* Current output position */
+  const BYTE *oend;    /* End of output */
+} LDM_DCtx;
+
+static void LDM_initializeDCtx(LDM_DCtx *dctx,
+                               const void *src, size_t compressSize,
+                               void *dst, size_t maxDecompressSize) {
+  dctx->compressSize = compressSize;
+  dctx->maxDecompressSize = maxDecompressSize;
+
+  dctx->ibase = src;
+  dctx->ip = (const BYTE *)src;
+  dctx->iend = dctx->ip + dctx->compressSize;
+  dctx->op = dst;
+  dctx->oend = dctx->op + dctx->maxDecompressSize;
+
+}
+
+size_t LDM_decompress(const void *src, size_t compressSize,
+                      void *dst, size_t maxDecompressSize) {
+  LDM_DCtx dctx;
+  LDM_initializeDCtx(&dctx, src, compressSize, dst, maxDecompressSize);
+
+  while (dctx.ip < dctx.iend) {
+    BYTE *cpy;
+    const BYTE *match;
+    size_t length, offset;
+
+    /* Get the literal length. */
+    unsigned const token = *(dctx.ip)++;
+    if ((length = (token >> ML_BITS)) == RUN_MASK) {
+      unsigned s;
+      do {
+        s = *(dctx.ip)++;
+        length += s;
+      } while (s == 255);
+    }
+
+    /* Copy literals. */
+    cpy = dctx.op + length;
+    memcpy(dctx.op, dctx.ip, length);
+    dctx.ip += length;
+    dctx.op = cpy;
+
+    //TODO : dynamic offset size
+    offset = LDM_read32(dctx.ip);
+    dctx.ip += LDM_OFFSET_SIZE;
+    match = dctx.op - offset;
+
+    /* Get the match length. */
+    length = token & ML_MASK;
+    if (length == ML_MASK) {
+      unsigned s;
+      do {
+        s = *(dctx.ip)++;
+        length += s;
+      } while (s == 255);
+    }
+    length += MINMATCH;
+
+    /* Copy match. */
+    cpy = dctx.op + length;
+
+    // Inefficient for now
+    while (match < cpy - offset && dctx.op < dctx.oend) {
+      *(dctx.op)++ = *match++;
+    }
+  }
+  return dctx.op - (BYTE *)dst;
+}
+
+
diff --git a/contrib/long_distance_matching/versions/v3/ldm.h b/contrib/long_distance_matching/versions/v3/ldm.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..287d444
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,19 @@
+#ifndef LDM_H
+#define LDM_H
+
+#include <stddef.h>   /* size_t */
+
+#define LDM_COMPRESS_SIZE 4
+#define LDM_DECOMPRESS_SIZE 4
+#define LDM_HEADER_SIZE ((LDM_COMPRESS_SIZE)+(LDM_DECOMPRESS_SIZE))
+
+size_t LDM_compress(const void *src, size_t srcSize,
+                    void *dst, size_t maxDstSize);
+
+size_t LDM_decompress(const void *src, size_t srcSize,
+                      void *dst, size_t maxDstSize);
+
+void LDM_readHeader(const void *src, size_t *compressSize,
+                    size_t *decompressSize);
+
+#endif /* LDM_H */
diff --git a/contrib/long_distance_matching/versions/v3/main-ldm.c b/contrib/long_distance_matching/versions/v3/main-ldm.c
new file mode 100644 (file)
index 0000000..724d735
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,479 @@
+// TODO: file size must fit into a U32
+
+#include <stdio.h>
+#include <stdlib.h>
+#include <string.h>
+#include <sys/time.h>
+#include <sys/types.h>
+#include <sys/mman.h>
+#include <sys/stat.h>
+#include <unistd.h>
+#include <zstd.h>
+
+#include <fcntl.h>
+#include "ldm.h"
+
+// #define BUF_SIZE 16*1024  // Block size
+#define DEBUG
+
+//#define ZSTD
+
+/* Compress file given by fname and output to oname.
+ * Returns 0 if successful, error code otherwise.
+ */
+static int compress(const char *fname, const char *oname) {
+  int fdin, fdout;
+  struct stat statbuf;
+  char *src, *dst;
+  size_t maxCompressSize, compressSize;
+
+  /* Open the input file. */
+  if ((fdin = open(fname, O_RDONLY)) < 0) {
+    perror("Error in file opening");
+    return 1;
+  }
+
+  /* Open the output file. */
+  if ((fdout = open(oname, O_RDWR | O_CREAT | O_TRUNC, (mode_t)0600)) < 0) {
+    perror("Can't create output file");
+    return 1;
+  }
+
+  /* Find the size of the input file. */
+  if (fstat (fdin, &statbuf) < 0) {
+    perror("Fstat error");
+    return 1;
+  }
+
+  maxCompressSize = statbuf.st_size + LDM_HEADER_SIZE;
+
+ /* Go to the location corresponding to the last byte. */
+ /* TODO: fallocate? */
+  if (lseek(fdout, maxCompressSize - 1, SEEK_SET) == -1) {
+    perror("lseek error");
+    return 1;
+  }
+
+ /* Write a dummy byte at the last location. */
+  if (write(fdout, "", 1) != 1) {
+    perror("write error");
+    return 1;
+  }
+
+  /* mmap the input file. */
+  if ((src = mmap(0, statbuf.st_size, PROT_READ,  MAP_SHARED, fdin, 0))
+          == (caddr_t) - 1) {
+      perror("mmap error for input");
+      return 1;
+  }
+
+  /* mmap the output file */
+  if ((dst = mmap(0, maxCompressSize, PROT_READ | PROT_WRITE,
+                  MAP_SHARED, fdout, 0)) == (caddr_t) - 1) {
+      perror("mmap error for output");
+      return 1;
+  }
+
+#ifdef ZSTD
+  compressSize = ZSTD_compress(dst, statbuf.st_size,
+                                  src, statbuf.st_size, 1);
+#else
+  compressSize = LDM_HEADER_SIZE +
+      LDM_compress(src, statbuf.st_size,
+                   dst + LDM_HEADER_SIZE, statbuf.st_size);
+
+    // Write compress and decompress size to header
+    // TODO: should depend on LDM_DECOMPRESS_SIZE write32
+  memcpy(dst, &compressSize, 4);
+  memcpy(dst + 4, &(statbuf.st_size), 4);
+
+#ifdef DEBUG
+  printf("Compressed size: %zu\n", compressSize);
+  printf("Decompressed size: %zu\n", (size_t)statbuf.st_size);
+#endif
+#endif
+
+  // Truncate file to compressSize.
+  ftruncate(fdout, compressSize);
+
+  printf("%25s : %6u -> %7u - %s (%.1f%%)\n", fname,
+         (unsigned)statbuf.st_size, (unsigned)compressSize, oname,
+         (double)compressSize / (statbuf.st_size) * 100);
+
+  // Close files.
+  close(fdin);
+  close(fdout);
+  return 0;
+}
+
+/* Decompress file compressed using LDM_compress.
+ * The input file should have the LDM_HEADER followed by payload.
+ * Returns 0 if succesful, and an error code otherwise.
+ */
+static int decompress(const char *fname, const char *oname) {
+  int fdin, fdout;
+  struct stat statbuf;
+  char *src, *dst;
+  size_t compressSize, decompressSize, outSize;
+
+  /* Open the input file. */
+  if ((fdin = open(fname, O_RDONLY)) < 0) {
+    perror("Error in file opening");
+    return 1;
+  }
+
+  /* Open the output file. */
+  if ((fdout = open(oname, O_RDWR | O_CREAT | O_TRUNC, (mode_t)0600)) < 0) {
+    perror("Can't create output file");
+    return 1;
+  }
+
+  /* Find the size of the input file. */
+  if (fstat (fdin, &statbuf) < 0) {
+    perror("Fstat error");
+    return 1;
+  }
+
+  /* mmap the input file. */
+  if ((src = mmap(0, statbuf.st_size, PROT_READ,  MAP_SHARED, fdin, 0))
+          == (caddr_t) - 1) {
+      perror("mmap error for input");
+      return 1;
+  }
+
+  /* Read the header. */
+  LDM_readHeader(src, &compressSize, &decompressSize);
+
+#ifdef DEBUG
+  printf("Size, compressSize, decompressSize: %zu %zu %zu\n",
+         (size_t)statbuf.st_size, compressSize, decompressSize);
+#endif
+
+  /* Go to the location corresponding to the last byte. */
+  if (lseek(fdout, decompressSize - 1, SEEK_SET) == -1) {
+    perror("lseek error");
+    return 1;
+  }
+
+  /* write a dummy byte at the last location */
+  if (write(fdout, "", 1) != 1) {
+    perror("write error");
+    return 1;
+  }
+
+  /* mmap the output file */
+  if ((dst = mmap(0, decompressSize, PROT_READ | PROT_WRITE,
+                  MAP_SHARED, fdout, 0)) == (caddr_t) - 1) {
+      perror("mmap error for output");
+      return 1;
+  }
+
+#ifdef ZSTD
+  outSize = ZSTD_decompress(dst, decomrpessed_size,
+                                  src + LDM_HEADER_SIZE,
+                                  statbuf.st_size - LDM_HEADER_SIZE);
+#else
+  outSize = LDM_decompress(
+      src + LDM_HEADER_SIZE, statbuf.st_size - LDM_HEADER_SIZE,
+      dst, decompressSize);
+
+  printf("Ret size out: %zu\n", outSize);
+  #endif
+  ftruncate(fdout, outSize);
+
+  close(fdin);
+  close(fdout);
+  return 0;
+}
+
+/* Compare two files.
+ * Returns 0 iff they are the same.
+ */
+static int compare(FILE *fp0, FILE *fp1) {
+  int result = 0;
+  while (result == 0) {
+    char b0[1024];
+    char b1[1024];
+    const size_t r0 = fread(b0, 1, sizeof(b0), fp0);
+    const size_t r1 = fread(b1, 1, sizeof(b1), fp1);
+
+    result = (int)r0 - (int)r1;
+
+    if (0 == r0 || 0 == r1) break;
+
+    if (0 == result) result = memcmp(b0, b1, r0);
+  }
+  return result;
+}
+
+/* Verify the input file is the same as the decompressed file. */
+static void verify(const char *inpFilename, const char *decFilename) {
+  FILE *inpFp = fopen(inpFilename, "rb");
+  FILE *decFp = fopen(decFilename, "rb");
+
+  printf("verify : %s <-> %s\n", inpFilename, decFilename);
+  {
+    const int cmp = compare(inpFp, decFp);
+    if(0 == cmp) {
+      printf("verify : OK\n");
+    } else {
+      printf("verify : NG\n");
+    }
+  }
+
+       fclose(decFp);
+       fclose(inpFp);
+}
+
+int main(int argc, const char *argv[]) {
+  const char * const exeName = argv[0];
+  char inpFilename[256] = { 0 };
+  char ldmFilename[256] = { 0 };
+  char decFilename[256] = { 0 };
+
+  if (argc < 2) {
+    printf("Wrong arguments\n");
+    printf("Usage:\n");
+    printf("%s FILE\n", exeName);
+    return 1;
+  }
+
+  snprintf(inpFilename, 256, "%s", argv[1]);
+  snprintf(ldmFilename, 256, "%s.ldm", argv[1]);
+  snprintf(decFilename, 256, "%s.ldm.dec", argv[1]);
+
+       printf("inp = [%s]\n", inpFilename);
+       printf("ldm = [%s]\n", ldmFilename);
+       printf("dec = [%s]\n", decFilename);
+
+
+  /* Compress */
+  {
+    struct timeval tv1, tv2;
+    gettimeofday(&tv1, NULL);
+    if (compress(inpFilename, ldmFilename)) {
+        printf("Compress error");
+        return 1;
+    }
+    gettimeofday(&tv2, NULL);
+    printf("Total time = %f seconds\n",
+           (double) (tv2.tv_usec - tv1.tv_usec) / 1000000 +
+           (double) (tv2.tv_sec - tv1.tv_sec));
+  }
+
+  /* Decompress */
+  {
+    struct timeval tv1, tv2;
+    gettimeofday(&tv1, NULL);
+    if (decompress(ldmFilename, decFilename)) {
+        printf("Decompress error");
+        return 1;
+    }
+    gettimeofday(&tv2, NULL);
+    printf("Total time = %f seconds\n",
+          (double) (tv2.tv_usec - tv1.tv_usec) / 1000000 +
+          (double) (tv2.tv_sec - tv1.tv_sec));
+  }
+  /* verify */
+  verify(inpFilename, decFilename);
+  return 0;
+}
+
+
+#if 0
+static size_t compress_file(FILE *in, FILE *out, size_t *size_in,
+                            size_t *size_out) {
+  char *src, *buf = NULL;
+  size_t r = 1;
+  size_t size, n, k, count_in = 0, count_out = 0, offset, frame_size = 0;
+
+  src = malloc(BUF_SIZE);
+  if (!src) {
+    printf("Not enough memory\n");
+    goto cleanup;
+  }
+
+  size = BUF_SIZE + LDM_HEADER_SIZE;
+  buf = malloc(size);
+  if (!buf) {
+    printf("Not enough memory\n");
+    goto cleanup;
+  }
+
+
+  for (;;) {
+    k = fread(src, 1, BUF_SIZE, in);
+    if (k == 0)
+      break;
+    count_in += k;
+
+    n = LDM_compress(src, buf, k, BUF_SIZE);
+
+    // n = k;
+    // offset += n;
+    offset = k;
+    count_out += k;
+
+//    k = fwrite(src, 1, offset, out);
+
+    k = fwrite(buf, 1, offset, out);
+    if (k < offset) {
+      if (ferror(out))
+        printf("Write failed\n");
+      else
+        printf("Short write\n");
+      goto cleanup;
+    }
+
+  }
+  *size_in = count_in;
+  *size_out = count_out;
+  r = 0;
+ cleanup:
+  free(src);
+  free(buf);
+  return r;
+}
+
+static size_t decompress_file(FILE *in, FILE *out) {
+  void *src = malloc(BUF_SIZE);
+  void *dst = NULL;
+  size_t dst_capacity = BUF_SIZE;
+  size_t ret = 1;
+  size_t bytes_written = 0;
+
+  if (!src) {
+    perror("decompress_file(src)");
+    goto cleanup;
+  }
+
+  while (ret != 0) {
+    /* Load more input */
+    size_t src_size = fread(src, 1, BUF_SIZE, in);
+    void *src_ptr = src;
+    void *src_end = src_ptr + src_size;
+    if (src_size == 0 || ferror(in)) {
+      printf("(TODO): Decompress: not enough input or error reading file\n");
+      //TODO
+      ret = 0;
+      goto cleanup;
+    }
+
+    /* Allocate destination buffer if it hasn't been allocated already */
+    if (!dst) {
+      dst = malloc(dst_capacity);
+      if (!dst) {
+        perror("decompress_file(dst)");
+        goto cleanup;
+      }
+    }
+
+    // TODO
+
+    /* Decompress:
+     * Continue while there is more input to read.
+     */
+    while (src_ptr != src_end && ret != 0) {
+      // size_t dst_size = src_size;
+      size_t dst_size = LDM_decompress(src, dst, src_size, dst_capacity);
+      size_t written = fwrite(dst, 1, dst_size, out);
+//      printf("Writing %zu bytes\n", dst_size);
+      bytes_written += dst_size;
+      if (written != dst_size) {
+        printf("Decompress: Failed to write to file\n");
+        goto cleanup;
+      }
+      src_ptr += src_size;
+      src_size = src_end - src_ptr;
+    }
+
+    /* Update input */
+
+  }
+
+  printf("Wrote %zu bytes\n", bytes_written);
+
+ cleanup:
+  free(src);
+  free(dst);
+
+  return ret;
+}
+
+int main2(int argc, char *argv[]) {
+  char inpFilename[256] = { 0 };
+  char ldmFilename[256] = { 0 };
+  char decFilename[256] = { 0 };
+
+  if (argc < 2) {
+    printf("Please specify input filename\n");
+    return 0;
+  }
+  snprintf(inpFilename, 256, "%s", argv[1]);
+  snprintf(ldmFilename, 256, "%s.ldm", argv[1]);
+  snprintf(decFilename, 256, "%s.ldm.dec", argv[1]);
+
+    printf("inp = [%s]\n", inpFilename);
+       printf("ldm = [%s]\n", ldmFilename);
+       printf("dec = [%s]\n", decFilename);
+
+  /* compress */
+  {
+    FILE *inpFp = fopen(inpFilename, "rb");
+    FILE *outFp = fopen(ldmFilename, "wb");
+    size_t sizeIn = 0;
+    size_t sizeOut = 0;
+    size_t ret;
+               printf("compress : %s -> %s\n", inpFilename, ldmFilename);
+               ret = compress_file(inpFp, outFp, &sizeIn, &sizeOut);
+               if (ret) {
+                       printf("compress : failed with code %zu\n", ret);
+                       return ret;
+               }
+               printf("%s: %zu → %zu bytes, %.1f%%\n",
+                       inpFilename, sizeIn, sizeOut,
+                       (double)sizeOut / sizeIn * 100);
+               printf("compress : done\n");
+
+               fclose(outFp);
+               fclose(inpFp);
+  }
+
+       /* decompress */
+       {
+    FILE *inpFp = fopen(ldmFilename, "rb");
+               FILE *outFp = fopen(decFilename, "wb");
+               size_t ret;
+
+               printf("decompress : %s -> %s\n", ldmFilename, decFilename);
+               ret = decompress_file(inpFp, outFp);
+               if (ret) {
+                       printf("decompress : failed with code %zu\n", ret);
+                       return ret;
+               }
+               printf("decompress : done\n");
+
+               fclose(outFp);
+               fclose(inpFp);
+       }
+
+       /* verify */
+       {
+    FILE *inpFp = fopen(inpFilename, "rb");
+               FILE *decFp = fopen(decFilename, "rb");
+
+               printf("verify : %s <-> %s\n", inpFilename, decFilename);
+               const int cmp = compare(inpFp, decFp);
+               if(0 == cmp) {
+                       printf("verify : OK\n");
+               } else {
+                       printf("verify : NG\n");
+               }
+
+               fclose(decFp);
+               fclose(inpFp);
+       }
+  return 0;
+}
+#endif
+
diff --git a/contrib/long_distance_matching/versions/v3/util.c b/contrib/long_distance_matching/versions/v3/util.c
new file mode 100644 (file)
index 0000000..9ea4ca1
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,64 @@
+#include <stdlib.h>
+#include <string.h>
+#include <stdint.h>
+#include <stdio.h>
+
+#include "util.h"
+
+typedef  uint8_t BYTE;
+typedef uint16_t U16;
+typedef uint32_t U32;
+typedef  int32_t S32;
+typedef uint64_t U64;
+
+unsigned LDM_isLittleEndian(void) {
+    const union { U32 u; BYTE c[4]; } one = { 1 };
+    return one.c[0];
+}
+
+U16 LDM_read16(const void *memPtr) {
+  U16 val;
+  memcpy(&val, memPtr, sizeof(val));
+  return val;
+}
+
+U16 LDM_readLE16(const void *memPtr) {
+  if (LDM_isLittleEndian()) {
+    return LDM_read16(memPtr);
+  } else {
+    const BYTE *p = (const BYTE *)memPtr;
+    return (U16)((U16)p[0] + (p[1] << 8));
+  }
+}
+
+void LDM_write16(void *memPtr, U16 value){
+  memcpy(memPtr, &value, sizeof(value));
+}
+
+void LDM_write32(void *memPtr, U32 value) {
+  memcpy(memPtr, &value, sizeof(value));
+}
+
+void LDM_writeLE16(void *memPtr, U16 value) {
+  if (LDM_isLittleEndian()) {
+    LDM_write16(memPtr, value);
+  } else {
+    BYTE* p = (BYTE *)memPtr;
+    p[0] = (BYTE) value;
+    p[1] = (BYTE)(value>>8);
+  }
+}
+
+U32 LDM_read32(const void *ptr) {
+  return *(const U32 *)ptr;
+}
+
+U64 LDM_read64(const void *ptr) {
+  return *(const U64 *)ptr;
+}
+
+void LDM_copy8(void *dst, const void *src) {
+  memcpy(dst, src, 8);
+}
+
+
diff --git a/contrib/long_distance_matching/versions/v3/util.h b/contrib/long_distance_matching/versions/v3/util.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..9072641
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,23 @@
+#ifndef LDM_UTIL_H
+#define LDM_UTIL_H
+
+unsigned LDM_isLittleEndian(void);
+
+uint16_t LDM_read16(const void *memPtr);
+
+uint16_t LDM_readLE16(const void *memPtr);
+
+void LDM_write16(void *memPtr, uint16_t value);
+
+void LDM_write32(void *memPtr, uint32_t value);
+
+void LDM_writeLE16(void *memPtr, uint16_t value);
+
+uint32_t LDM_read32(const void *ptr);
+
+uint64_t LDM_read64(const void *ptr);
+
+void LDM_copy8(void *dst, const void *src);
+
+
+#endif /* LDM_UTIL_H */