fuzz: disable DNP3 checksums while fuzzing

(cherry picked from commit 8a61f754c485b6c956c31c26176112d45d68b6e8)

Fix stack overflow in DetectFlowbitsAnalyze

Use dynamically allocated array instead of stack and free it after it is no longer needed.

(cherry picked from commit fd4ef5cd541ad945fddae5f469e32ef0562447ca)

signature: fix linked list for bidirectional signatures

Bidirectional signatures are really two signatures with one id
This needs to be handled with care when changing a linked list

(cherry picked from commit 5ac8e41a130f7b17678be00a1a5510a85f7baa2e)

enip: use status for probing parser

(cherry picked from commit 0da4dc0deab8ae40f2f4476f68faa62a692a0350)

dnp3: fix buffer over read in responses parsing

(cherry picked from commit d465bb86863acd4c0cd534f0748c5a2ef1283241)

dnp3: probing parser fixes direction based on dnp3 header

(cherry picked from commit 629a16e3733dd577822d0c82d2e81cbeb3b9a4d2)

detect/content: Validate content byte array

This commit checks whether the content byte array is compatible with the
transforms, if any, for the rule.

(cherry picked from commit 051465ee74422eb7578bdb8ef92f76037d7c47ec)

doc: Fix spelling error

(cherry picked from commit cbcb7c5b99f30ac0555bb47ba9ec093b3be2e55e)

general: Fix spelling error

(cherry picked from commit aed6356e5b4888e20cff3bdf847bb95b6a6a66b7)

detect: Add transform validation api

This commit extends the API with a function that validates arguments
against the transforms for the SM list (if any).

(cherry picked from commit 8f1a7111ed10f2b017d5190682a6961a1729942d)

detect/transform: Add validation function

This commit adds a function to pre-validate buffers. If a content
buffer contains whitespace, the validation fails.

(cherry picked from commit bc81474e3fb715b1ef110338676fc15de34744c0)

detect/transform: Add transform "validate" function

This commit adds an (optional) entry for a validation function. The
validation function, if present, will be used during rule processing.

Its role is to determine if the arguments are compatible with the
transform. E.g., a content string of "this string has whitespace" is not
compatible with the `strip_whitespace` transform.

(cherry picked from commit 596875fa68af18746abbbd9e307d14a93f23c3f7)

util-log-redis: add support for unix socket

If there is a '/' in the redis server string then we consider that
the connection should be done other a unix socket.

(cherry picked from commit e12437e31e9cab25576e9cb3d70cba620ba3023e)

util-log-redis: ensure a dump per second

In sync mode, Suricata was waiting to have batch size alerts before
logging them. This was introducing delay in some configuration with
low traffic.

(cherry picked from commit 3ae33bb7a10544babc2f2c56543c825a1f29599d)

util-log-redis: fix reconnect in batch mode

In case of redis outage, the redis session was reset but the replies
were still fetch even if there is none replies in the new session.

(cherry picked from commit 21431f166c337a7d3dd8ff8cc3aacbe686414ae3)

signature: adds file flag for file_data keyword

So that SigValidate can check if a protocol not supporting
files was set after this keyword

(cherry picked from commit 2d43d0de4b3828bda4178031c4cf1c6e0cc0bb6e)

file-hash-common: fix rule_file truncation

Loading file hash lists uses dirname(3) on the
de_ctx->rule_file which modifies the contents,
removing the last part of the path. So on subsequent
calls the rule_file no longer contains the rule_file,
but instead just the directory name.

Mostly noticed when using "-S" with rule files outside
of the default-rule-path which requires more hunting for
the rule file.

(cherry picked from commit 3b135c609565e9393819b651f9785d58b20d79d2)

output/tftp: Include common options

This commit will cause common metadata values and the community id to be
included in log output when configured.

(cherry picked from commit 0bb62e0abb0b4956e71b232c4e4094fa2545e1f9)

output/smb: Include common output options

This commit will cause common metadata values and the community id to be
included in log output when configured.

(cherry picked from commit c590d6f4591fc8127afc3e1468b879b5f4999875)

output/dhcp: Include common output options

This commit will cause common metadata values and the community id to be
included in log output when configured.

(cherry picked from commit 7a939ae9c237b17b31afd3bf91dfa1701be882ea)

output/rdp: Include common output options

This commit will cause common metadata values and the community id to be
included in log output when configured.

(cherry picked from commit 9b3cf5db489fbb0cd51ce1a80110529bd8b598e5)

windows: fix timestring timezone display

Bug: #3690
(cherry picked from commit bbdc11842d324005567bac5eafdea5fd0fc62688)

htp: enforce body limits more exact

(cherry picked from commit a4568a634d5df223a4caaed4552b54f9e4598c12)

detect/http_raw_header: Correct type mismatch

This changeset fixes a bug on the computation of the buffer
lenght for raw http headers. The bug is due to a mismatch
on the data type of the length (uint8_t vs uint32_t) and it
was causing signature misses.

(cherry picked from commit 0cdc009da1c97784b3c1742b33fa817e9597ea68)

version: starting work on 5.0.4

version: release 5.0.3, require libhtp 0.5.33

changelog: update for 5.0.3

htp: fix test after libhtp changes

detect/smtp: Refactor command check

This commit refactors the code that matches reply with command.

Bug: #3592

app-layer/smtp: Improve RSET handling

This commit improves how the parser handles the `RSET` command.
Termination of the transaction occurs when the `RSET` ack is seen (reply
code 250).

Bug: #3592

enip: more precise probing parser

Bug: #3674

detect/port: limit recursion in port parsing

Bug: #3600

detect/address: limit recursion during parsing

Allow a max depth of 64.

Bug: #3600

detect/address: dead code removal and style cleanups

(cherry picked from commit 42d112e7b6db6c85102c1864905cca0ea2c05f88)

detect/address: minor cleanups

decode: cleanup packet properly on bad packets

In case of bad IPv4, TCP or UDP, the per packet ip4vars/tcpvars/udpvar
structures would not be cleaned up because the cleanup depends on the
'header' pointer being set, but the error handling would unset that.

This could mean these structures were already filled with values before
the error was detected. As packets were recycled, the next packet decoding
would use this unclean structure.

To make things worse these structures are part of unions. IPv4/IPv6 and
TCP/ICMPv4/ICMPv6 share the same memory location.

LibFuzzer+UBSAN found this both locally and in Oss-Fuzz:

decode-ipv6.c:654:9: runtime error: load of value 6, which is not a valid value for type 'bool'
    #0 0x6146f0 in DecodeIPV6 /src/suricata/src/decode-ipv6.c:654:9
    #1 0x617e96 in DecodeNull /src/suricata/src/decode-null.c:70:13
    #2 0x9dd8a4 in DecodePcapFile /src/suricata/src/source-pcap-file.c:412:9
    #3 0x4c8ed2 in LLVMFuzzerTestOneInput /src/suricata/src/tests/fuzz/fuzz_sigpcap.c:158:25
    #4 0x457e51 in fuzzer::Fuzzer::ExecuteCallback(unsigned char const*, unsigned long) /src/llvm-project/compiler-rt/lib/fuzzer/FuzzerLoop.cpp:556:15
    #5 0x457575 in fuzzer::Fuzzer::RunOne(unsigned char const*, unsigned long, bool, fuzzer::InputInfo*, bool*) /src/llvm-project/compiler-rt/lib/fuzzer/FuzzerLoop.cpp:470:3
    #6 0x459917 in fuzzer::Fuzzer::MutateAndTestOne() /src/llvm-project/compiler-rt/lib/fuzzer/FuzzerLoop.cpp:698:19
    #7 0x45a6a5 in fuzzer::Fuzzer::Loop(std::__Fuzzer::vector<fuzzer::SizedFile, fuzzer::fuzzer_allocator<fuzzer::SizedFile> >&) /src/llvm-project/compiler-rt/lib/fuzzer/FuzzerLoop.cpp:830:5
    #8 0x448728 in fuzzer::FuzzerDriver(int*, char***, int (*)(unsigned char const*, unsigned long)) /src/llvm-project/compiler-rt/lib/fuzzer/FuzzerDriver.cpp:824:6
    #9 0x472552 in main /src/llvm-project/compiler-rt/lib/fuzzer/FuzzerMain.cpp:19:10
    #10 0x7ff0d097b82f in __libc_start_main (/lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6+0x2082f)
    #11 0x41bde8 in _start (/out/fuzz_sigpcap+0x41bde8)

Bug: #3610

ssl: don't say we consumed bytes if we didn't consume them

ssl: fix handshake cert buffer sizing

'trec' buffer was not grown properly when it was checked as too small.
After this it wasn't checked again so that copying into the buffer could
overflow it.

Bug: #3609

detect/keywords: dynamic version part of doc URL

(cherry picked from commit 26bcc97515e6fd38b36d7cb39373b5bf8a63a5fc)

logging: fix default log format for release mode

(cherry picked from commit 8f2df0f9389d3e8aa99d7cc173004c7c85665eb7)

detect: fix typo for ipv6.hdr description

(cherry picked from commit 02d94f5cf24d903913516739b4b6de0868a5db46)

detect: refactoring parsing of ip range

To optimize first netmask

(cherry picked from commit ae102ca0961fddd54c1f7d07b8772d43d06f3f41)

signature: minimizes ip CIDR for ip range

Example leading to over allocation is 41.232.107.2-43.252.37.6

(cherry picked from commit 8ca9c0e8f04598ebcbe72bafce1512b8fe2f554a)

napatech: Correct timestamp rounding issue

This commit fixes the conversion of timestamps. Without the extra
parens, the resulting timestamp value for usecs will be 1 or 0 due to
the operator precedence order (+ takes precedence over ?:)

(cherry picked from commit 2b938987717b2128c2dcb984563bf876add6f0f7)

napatech: Check for out-of-band control operations

This commit causes the packet source to check for out of band control
operations when there are no packets immediately available.

(cherry picked from commit f12adcc58cf5b79aec13609c672918f5279d4a7d)

dag: Check for out-of-band control operations

This commit causes the packet source to check for out of band control
operations when there are no packets immediately available.

(cherry picked from commit 5b13468bfcbbd5d5a2a9743b317d2e5a9c3a5afe)

app-layer: fix protocol detection bail conditions for TCP fastopen

datasets: reputation value validation

fastlog: fix unlikely memleak

Fix memleak is case of alloc error during startup.

(cherry picked from commit 28837b203e45a8cc24b4b7b97f7bf9c5e118eb7b)

doc: typo: http.server_body should be http.response_body

Thanks to Jason Williams for pointing this out.

(cherry picked from commit 0dd1b2a616decfaa5ad5526540c72b9bf3ae1092)

conf: add value checks for datasets hash/prealloc

Signed-off-by: jason taylor <jtfas90@gmail.com>

github-ci: check all commits on pr

On a pull request, attempt to compile all commits from
the base branch to the head of the PR branch.

The job is in a separate workflow file to limit it to
pull-requests only, as the base branch is not available
on push (something to look into).

(cherry picked from commit d955acc01cc0ce7bd5bf04b0e36a96fb55ee56f5)

flow: cleanup expectations first

Make sure to cleanup expectations for a flow as the first step, before
parts of the flow itself are getting cleaned/freed.

Also indicate use unlikely as flows with expectations should be relatively
rare.

(cherry picked from commit 09a21545ce00de8ef161f097603f98770351e9be)

app-layer-expectation: update copyright date

(cherry picked from commit bcff8ec5b5690ed5507b8d78656f682d07abd4b7)

app-layer-expectation: clean expectation and add limits

When a flow timeout, we can have still existing expectations that
are linked to this flow. Given that there is a delay between the
real ending of the flow and its destruction by Suricata, the
expectation should be already honored so we can assume the risk
to clean the expectations that have been triggered by the
to-be-deleted flow.

This patch introduces a limitation in term of number of
expectations attached to one IPPair. This is done using
a circle list so we have a FIFO approach on expectation
handling.

Circleq list code is copied from BSD code like was pre existing code
in queue.h.

(cherry picked from commit a4cea196c0ea9aa5f2b34a43140056d689003c13)
(cherry picked from commit 230dbafa22dc015552ec73a3b0eb70e209ed2190)

Commits squashed to avoid circular dependeny by Victor Julien.

app-layer-expectation: remove unused parameter

(cherry picked from commit 403eb3bf6121f8d6d198a4aab80d694c771f7e27)

detect/ftp: FTP memory accounting fixes

This commit continues the work started by @vanlink and corrects the
accounting of FTP memory usage against the memcap limit.

(cherry picked from commit aa3f784d32308b642052c076787ace547b260781)

datasets: remove useless variables

(cherry picked from commit 1d8d03184dd91a33251e6a45f5286b387bfda38e)

datasets: add 'dataset-remove' unix command

(cherry picked from commit 7a6269798ba309deedc7110c5cc8bb763bd89926)

datasets: add 'remove' support

(cherry picked from commit af06883f65ff50d2b118ffd772d1bd93bb3b00f0)

datasets: silence noisy 'dataset-add' log

(cherry picked from commit 03dc5d1d74dbee2ef63c402a599d0cddbec93f05)

datasets: fix return values for 'add's

(cherry picked from commit ff55a444d423f1b3b55be51712bee065f0d4fbda)

datasets: fix ref cnt handling

Each 'add' and 'lookup' would increment the use_cnt, without anything
bringing it back down.

Since there is no removal yet, nothing is actually affected by it yet.

(cherry picked from commit 381bc2dd64b2ba6a61b99563194df3a2739ed364)

thash: add 'remove' support

(cherry picked from commit 51726e0a0f9c56c452cf9c4a566ba302a26cb1d4)

datasets: improve 'dataset-add' error checking

(cherry picked from commit b80ab56d10d9907e3dcab8cdcd2285c711201de8)

conf/datadir: fix possible out of bounds array access

(cherry picked from commit 0ce489bcc9629b7b4cc5a29288df318d2d5472a6)

detect: fix insertion in linked list for fast pattern

Make sure we do not add the same list_id twice
by checking at least all the lists with the current priority

(cherry picked from commit a0823bc6ecc0c9787fc148229331957fd55f9e97)

detect/lua: Unregister Lua object on free

This commit ensures that the LUA object is unregistered when the Lua
object is freed.

detect: Provide function to clear per-thread ctx

This commit provides an interface to free previously allocated
per-thread contextual information on the keyword lists.

(cherry picked from commit d1151f3f8e5d21f08c47dd9d3e3650768f7d3004)

ftp: indent FTPParseResponse again

(cherry picked from commit 699d6682daad908fb30f2b871129dfa826f4a476)

ftp: use switch for ftp commands for style

(cherry picked from commit fef124b92dbabe64c6f1580113a251fae639857f)

ftp: FTPGetAlstateProgress for done port commands

For a done transaction with command PORT,
we expect FTP_STATE_FINISHED
and we got FTP_STATE_PORT_DONE instead
which prevented logging of these transactions

We change the order of the evaluations to get the right result

(cherry picked from commit 6f36403219687b1bbcb667078a57c1c9d4aed185)

ftp: FTPParseResponse bufferizes lines

Protects against evasion by TCP packet splitting

The problem arised if the FTP response is split on multiple packets

The fix is to bufferize the content, until we get a complete line

(cherry picked from commit a6294d6ec25d0f2f0b5d25f7a824c7325e8f87ce)

conf: returns instead of exiting in ConfYamlParse

So that we can keep on fuzzing even on too much recursion

(cherry picked from commit fe1d36ec7eff8fecbe39f4d7447c0ab24a9d37ee)

kerberos: fix against packet split in record size

(cherry picked from commit 23f796a021cd4a0f2614418a5d2d40acefd56df3)

detect/parse: properly free bidir sigs in error path

(cherry picked from commit fc6ada85411caa9c08df3eae1cc908436a4ea257)

detect/parse: fix minor memory leak in error path

Only reachable on SCMalloc so should be unlikely to be reached.

(cherry picked from commit 5abead93259e8d0bfb3f7556b9653debe320621a)

detect/iponly: fix parsing of '0' valued netmask

(cherry picked from commit 4d50eb1647709c9f2b8809f91b2af67be99ce4ab)

conf/yaml: limit recursion depth while paring YAML

A deeply nested YAML file can cause a stack-overflow while
reading in the configuration to do the recursive parser. Limit
the recursion level to something sane (128) to prevent this
from happening.

The default Suricata configuration has a recursion level of 128
so there is still lots of room to grow (not that we should).

Redmine ticket:
https://redmine.openinfosecfoundation.org/issues/3630

(cherry picked from commit 4dc80a6e6f9b396de5dc25d3468522316c4661d0)

nfs: fix buffering code using wrong dir

detect/tls: Use pcre_copy_substring to avoid leak

This commit eliminates a memory leak while parsing TLS version
information. The leak was identified through fuzzing.

(cherry picked from commit 2823bc5aed3ade2f916a9592c0ecf214bb62481b)

detect/ssl: Fix memory leak in version parsing

This commit fixes a memory leak in the SSL version handling that
manifests when the version identifier is incomplete or incorrect.

(cherry picked from commit 6bffe0bd353654b0f2e5e123cd3f68d2570c5553)

detect/pktvar: fix memory leaks

(cherry picked from commit aba4e195484a4ee2068ca13ed7852aab81f00d5a)

detect/threshold: Correct typos

(cherry picked from commit c20ab53eaeb57d873a5ea065f31adcec28786078)

detect/threshold: Don't allow duplicates

This commit detects duplicate threshold rule options. When duplicates
are found in a rule, an error message is displayed and the rule is
rejected.

(cherry picked from commit ff9a01ee1b63452d1b047f9bcc7522e3ab1eda10)

sip: address trailing space parsing

(cherry picked from commit 11912bd71517408000f70e68407571dff3be449a)

snmp-version: make comment more clear

(cherry picked from commit efaa1755c636a11ef509b5e951b20c56fd36bf5b)

snmp: do not set SIGMATCH_NOOPT

(cherry picked from commit f02a18e55747b40950a79095b930095407cc97b8)

pcap/file: improve time handling

This patch addresses two problems.

First, various parts of the engine, but most notably the flow manager (FM),
use a minimum of the time notion of the packet threads. This did not
however, take into account the scenario where one or more of these
threads would be inactive for prolonged times. This could lead to the
time used by the FM could get stale.

This is addressed by keeping track of the last time the per thread packet
timestamp was updated, and only considering it for the 'minimum' when it
is reasonably current.

Second, there was a minor race condition at start up, where the FM would
already inspect the hash table(s) while the packet threads weren't active
yet. Since FM gets the time from the packet threads, it would use a bogus
time of 0.

This is addressed by adding a wait loop to the start of the FM that waits
for 'time' to get ready.

(cherry picked from commit 1e9333288f06ddc2f469053205a5d6662bf32ed7)

threads/time: rename ts to pktts to make purpose clear

(cherry picked from commit b60520503247f31c9c58157f67d2f901cfb23d93)

pcap/file: fix race during pcap processing start

A race condition during the start of pcap file processing could cause
missed alerts and logged events. This race happens between the packet
threads and the flow manager. It was observed on slower hardware, but in
theory could happen on any machine. It required the 'autofp' runmode.

In commit 6f560144c1b9 ("time: improve offline time handling") the logic
was added to make the flow manager use a minimum of all the packet threads
perception of time.

The race condition was that the flow manager may become active _before_
all of the packet threads have started processing packets and thus setting
their timestamp. The threads that had not yet initialized their timestamp
would not be considered when calculating the minimum.

As a result of this, older packets timestamps would not yet be registered.
This would give the Flow Manager a timestamp too far in the future. While
the FM was running, the packet processing would start and a flow would
be created. This flow would then immediately be considered 'timed out' by
the FM, due to the timestamp too far in the future.

In the observed case, the thread processing packet 1 from the pcap had not
yet started processing while other threads had already started. The FM was
also already active. Due to the timestamps in the pcap this meant that the
time the FM used was about 500 seconds in the future compared to packet 1.

This patch fixes the issue by initializing all of the threads timestamps
with the timestamp value of the first packet. This way the minimum will
always consider this timestamp.

(cherry picked from commit 9f1922e1756017b66c7161d49202a4120dd7f231)

pcap/file: fix function ptr naming

(cherry picked from commit 7f211dfb671e49de6b47ea322fc3f04f91995696)

time: fix function name typo

(cherry picked from commit a765494dcb6ff696daa8aeffe9595177b1772173)

time: remove unused time structure

(cherry picked from commit c68af5a23e183d4a6aa2aabf833062ecbe8c2447)

time: minor code cleanup

(cherry picked from commit 0325d185a85d69e10bf9e41af17d205097360b47)

stream/tcp: fix fast open off by one

With data on SYN the sequence number used for the first data
was off by one, leading to the next segments to appear to come
after a one byte gap.

(cherry picked from commit b85539b2aba4cc95a2773b71da44821cd225b50a)

smb: fix rustc 1.42 warnings

(cherry picked from commit a729d266c398d0d3a9f43d7df3f351245d1773e3)

detect/parse: fix crash on 'internal' keyword use

When keyword __flowvar__postmatch__, an internal keyword, is used
in a rule the 'Setup' func ptr will be NULL. This caused a crash.

(cherry picked from commit 095981cb2a7b204e66770ab5ab4efcf5034caa27)

detect/pkt_data: code and test cleanup

(cherry picked from commit e1c474a1b08eb31e53c455cd7a14c64d8af96acc)

detect/pkt_data: error on unconsumed transforms

If a rule has transforms w/o consuming them (e.g. a content keyword),
don't consider 'pkt_data' valid.

(cherry picked from commit 13c9d0ca7e3a41a8023dc80def36e24686288742)