flow: remove unused prune-flows option

if a sig's set as stream sig only, don't updated it as both stream and pkt sig if offset/depth's present

bug #495 - update rule analyzer to not warn on offset_depth-tcp_pkt update if sig is stream only

bug #497 - rule_warnings fixed

Set thread name Suricata-Main for main thread and LiveRuleSwap for live swap thread

bug 499 - update host os info enum map to use - instead of _ + add new unittests

bug #496 - don't warn about offset/depth for packet sigs

Windows build and other misc fixes.

Update changelog for 1.3 release.

Rename 'worker' running mode to 'workers'

This patch renamed the 'worker' running mode into 'workers'. Thus,
there is only one name in Suricata for the same thing. Backward
compatibility is ensured by replacing "worker" by "workers" when
the old name is used. A warning is printed in the log when the old
name is used.

check if all packets are processed before disabling detect threads + kill all threads <= detect after FFR + other minor fixes

conf api: remove dead code

rule analyzer: fix detecting stream match

rule analyzer updated for sigs with offset/depth set + alproto set

Update SigValidate() to allow http keywords to be specified in the right flow direction

autotools: pthread deps is needed on ubuntu.

It is weird but adding pthread in needed on ubuntu 1204.

Make live reloads optional and disabled by default.

stream: don't NULL dereference p->flow->protoctx in StreamTcpReassembleDepthReached

file inspection: improve logging when stream.depth limit is reached. #493.

Improve warning if prelude output is selected but support not compiled in. #320.

Improve pktvar keyword parsing and error handling.

Minor fixes for coverity issues.

Fix detect tag error handling.

file detect: improve cleanup

filemd5: free hash during cleanup

ac-bs and ac-gfbs mem cleanup

more mpm engine mem cleanup

mpm engine and ac mem free fixes

Fix SCSetThreadName() macros in threads.h Add FreeBSD thread naming implementation.

bug #455 - Warn users on signature event vars having precedence over threshold.conf ones

Free all sig match structs when freeing a signature.

Fix memleak in tag parsing.

Properly clean signature's ip only data.

Fix a reload memleak in thread local detection engine ctx.

Fix a reload memleak in the duplicate sig detection hash.

Clean up packet pool at shut down.

Update Changelog for 1.3rc1 release

sc_atomic_cas replaced with sc_atomic_set

http: add unittest to test \r in header line.

htp: keep track of header line terminators so http_raw_header can reconstruct exact headers.

http_raw_header: add some debug code.

icmpv6: for ICMPv6 info messages set payload ptr and length to right after 4 byte hdr.

afpacket: fix compilation in debug mode.

Update coccinelle script to match syntax evolution.

cleaning: fix warning when building with clang.

clang was issuing some warnings related to unused return in function.
This patch adds some needed error treatment and ignore the rest of the
warnings by adding a cast to void.

af-packet: use counter for drop and accept

This patch adds counters for kernel drops and accepts to af-packet
capture module. This information are periodically displayed in
stats.log:
capture.kernel_packets    | RxAFP1                    | 1792
capture.kernel_drops      | RxAFP1                    | 0
The statistic is fetch via a setsockopt call every 255 packets.

af-packet: add support for BPF filter.

This patch adds support for BPF in AF_PACKET running
mode. The command line syntax is the same as the one
used of PF_RING.
The method is the same too: The pcap_compile__nopcap()
function is used to build the BPF filter. It is then
injected into the kernel with a setsockopt() call. If
the adding of the BPF fail, suricata exit.

af-packet: get datalink for each socket creation.

This patch will allow us to use the datalink when computing the filter.
It also fixes a potential issue where an interface data type change
after the interface if going down/up.

http body inspection: force body inspection on stream eof.

default config: add engine-analysis.rules directive.

inline: fix unified2 alert direction selection

filemd5: fix compilation if libnss isn't available

filemd5: add support code for md5 handling for signatures.

Don't display a warning when log-pcap tries to remove an already removed file.

http header won't inspect set-cookie headers. Set-cookie part of cookie keyword now. Also update the http header inspection engine

Free pcre study structs for classification, threshold and reference parsing.

code cleanup for live swap

Fix compiler warning.

update clean up of old detection engine contexts for live rule swap

DetectEngineCtxFree() cleanup, also in main

Replace the old atomic sets using cas with the new sc_atomic_set macro

free flowvar entries in flow after live rule swap. Sync flowbits entries into packet struct to be used by alert debuglog when alert debuglog is enabled

disable live rule swap when -s or -S option's used at startup

Introduce util-signal.[ch]. Move our signal setup functions here

Simplify flow resetting on de_ctx update. Detect ctx id starts at 1. So in a flow 0 means uninitialized (thus set) and if we detect flow is not equal to detect id, we reset the sgh storage and de_state.

If new ruleset requires any htp callbacks that aren't already set, don't load new ruleset; request user to restart suricata + disable setting fileinsepection flags unconditionally in main

add unittest for atomic operation with void *

live rule support added

To reload ruleset during engine runtime, send the USR2 signal to the engine, and the ruleset would be reloaded from the same yaml file supplied at engine startup

cleanup threshold config de-init

slot_data updated as an atomic var no

byte_extract_id var now a non-global de_ctx specific var

make mpm ctx container de_ctx specific. Also introduce global variable in mpm_ctx. this is a workaround for cleaning non global mpm_ctx's since we now don't supply the de_ctx around the detection engine API

clean reference config API

clean classification config API

util action api returns error code if it encounters wrong values parsing wrong action conf

variable names global vars, global no more. Moved to detection engine ctx, a place it belongs

fix replace unittets. Re-set modified global_var to orignial value when the test completes

Kill engine during init stage if it fails to load valid value for sgh-mpm-context

clear root node during conf de-init. also create root_backup when the root is restored back using it

http: decode double decoded path and query string characters. Bug #464.

build: Use expanded sysconfdir to pass as CONFIG_DIR to the code.

http: make client and server body inspection more robust in cases where realloc fails

detect: Only run mpm on HTTP buffers in the proper direction. Fixes a file_data FN.

dcerpc/smb/smb2: more robust error checking, cosmetic code updates.

some more mpm engine cleanup

mpm engine cleanup. Remove unnecessary flags

cookie header now inspects Set-Cookie headers as well

unittests that fail, displaying the issue that we don't inspect set-cookie headers against cookie keywords

The next patch in the series will fix the issue and let the unittests pass as well.

pcap: make sure thread count is 1 if config is missing for a device.

#482 - use decode_flag for all decode TMs. Use the flag as a way to retrieve decode TMs from ThreadVars

we now support offset, depth inspection against all packet payloads and stream messages

tests to highlight that

- suricata treates sigs with offset/depth without any packet keywords as stream sigs
- as a consequence suricata will FN on such sigs

The tests introduced here will fail, displaying the issues.  The
next patch in the series would fix the said issues.

stream raw reassembly fix

fast pattern cleanup - Remove FastPatternSupportEnabledForSigMatchList() and all it's associated structures

http user agent keyword + mpm + inspection + fast pattern support added

Add pcap workers mode.

Some cards like Napatech or Myricom support libpcap wrappers that allow for
multiple streams, queues, ringbuffers. The workers mode can be of use in
those cases.

bug #471 - file_data fast pattern unittests added

bug #471 - http server body fast pattern unittests added

rule analyzer: minor cleanups. Fix warning-only setting, allow true/yes/enabled for yaml option.

Fix commandline supplied yaml path being ignored.

feature 349 rule analyzer v1

OpenBSD: fix tar command.