chimera: silence gcc-8 exception catch warning

Jenkins-1424: fixed error which misses report of logical combination under
vacuous input.

Jenkins-1080: fixed error reporting logical combination match in "A&!B" type by
moving flush_comb behind report_eod_matches in hs_close_stream/hs_reset_stream.

Use std::distance explicitly to avoid ambiguity with boost

Bump version number for release

changelog: updates for 5.0.0 release

chimera: update dev-reference

chimera: add pkgconfig install files

Windows porting: update docs.

Windows porting: port hyperscan and chimera tools to windows.

chimera: hybrid of Hyperscan and PCRE

Logical Combination of patterns.

build: enable hscollider for installed PCRE package

Fixes github issue #86

hscollider: fix input length for UTF8 check

ue2_graph: more direct property_graph defn

nfagraph: remove ng_undirected.h

ng_repeat: use undirected_graph

graph_undirected: adapt bidi graph to undirected

Introduces an adaptor (like the BGL's reverse_graph) that presents an
undirected view of a bidirectional graph.

Initially used in ng_calc_components.

mcsheng: debug format string fixes

sheng: fix reportCurrent eod flag

eod here should be 0, not 1. The reportCurrent NFA API function for
Sheng is unused at the moment, so this wasn't causing any problems
earlier.

mcclellancompile: MAX_SHERMAN_LIST_LEN can be 9

misc: docs, typo fixes, small cleanups

rose_build_add: remove unused max_adj param

In prepAcceptForAddAnchoredNFA(), we used to support different values
for max_adj. Since it's now always zero, remove it.

ng_violet: make calcSplitRatio operation faster

Implements count_reachable in a less malloc-happy way, improving
compile performance. Adds a count() function to small_color_map.

ng_width: turn min width check into assert

Migrated from 01.org/hyperscan to hyperscan.io

Bump version number for release

changelog: updates for 4.7.0 release

doc: describe tools hscheck, hscollider, hsdump

doc: in dev guide, avoid Goudy Old Style font

doc: update copyright dates for 2018

pcre: do not explode if pcre is missing

hscollider: example test cases

cmake: support MinSizeRel config

Move cpuid checks inline.

During fat runtime function resolution there was a chance that the PLT
might not be initialised in time for us to call the cpuid check
functions. Moving them inline means there is no PLT to worry about.

Fixes #78

hscollider: allow conversion of FileCorpora unique_ptr to Corpora

hscheck: tool to test regex compilation

hscheck accepts a file of regular expressions in the form:

    ID:/regex/flags

and tests whether they can be compiled with Hyperscan, reporting the
error if compilation fails.

hscollider: tool for testing Hyperscan match behaviour against PCRE

Introduce hsdump development tool for producing information during compilation.

This tool is intended to assist Hyperscan developers with development and
debugging by providing insights into the generated bytecode.

ext param - more consistent depth check

doc: remove stray '+'

find_matches: don't create ridiculous accept paths

doc: make Wikipedia hyperlinks anonymous

doc: make doxygen filter out HS_CDECL

doc: use doxygen @p to refer to parameters

doc: clarify description of streaming API

doc: document that hs_close_stream frees memory

Add explicit documentation that hs_close_stream() will free the stream
state after returning any matches.

Hamming: GraphTruth and corpus gen support

Add support for Hamming distance approx matching

icc: disable warning about constant expression

hsbench: sqlite output support

sqlite: disable -Werror so warnings don't kill the build

Merge branch master into develop

Migrated from github.com/01org to github.com/intel

cmake: add a dummy c++ file to force linkage

The hs dylib when built with Xcode wasn't being linked to C++ runtime
libs. Fixes #69

Merge branch develop into master

Bump version number for release

changelog: updates for 4.6.0 release

De-const the empty maps.

Clang 3.8 complains about attempting to default init const objects
without a user-provided constructor.

Check for unused typedef warning and disable

This affects older versions of Boost (1.58), and we were only disabling the
warning for g++.

Fixes #62.

find_better_daddy: position change

Don't let haigs into Tamarama

rose_build_add_mask: improve findMaskLiteral perf

Handle any exceptions while constructing compiler elements

Specifically, NG has a Rose which has a LeftEng which has a depth, which can
throw an error on construction. If we put these in the try-catch we don't
have to worry so much in future.

teddy: alignment decl should match defn

Spotted by coverity. #174512

hwlm_build: default for HWLMProto::make_small

Silences Coverity warning.

rose_build_matchers: init LitFragment fields

Silences Coverity warning about squash, delay_squash.

dedupeLeftfixesVariableLag: refactor, more blockmode deduping

maintain castle report information

ng_squash: switch to using unordered_map

Also some cleaning up, small performance improvements.

tidy mergeCastleSuffixes

refactor mergeCastleLeftfixes

reimplement hasSameEngineType()

partitioned_set: use lower_bound(), not scan

msvc: disable more warnings

Use an unsigned byte, not char

ue2_literal: define npos in ue2string.cpp

fdr_compile: simplify lambda use

This was failing to compile on MSVC.

mcclellancompile: simplify calc_min_dist_from_bob

mcclellancompile: don't copy dstate unnecessarily

accel_dfa_build_strat: make extend() faster

unit: add PrintTo for ue2_literal

hash: use std::hash for string hashing

ue2_literal: better hash function

ue2_literal: make nocase member a dynamic_bitset

We were previously using vector<bool>, but dynamic_bitset provides a
faster any() impl

fdr_compile: don't do string copies in isSuffix

gatherReports: fewer map lookups

accel_dfa_build_strat: use flat_set

smallwrite_build: make failure_map unordered

rdfa: make getImplAlphaSize() inline

castlecompile: remove unused container

Update PCRE version to 8.41

move mergeDupeLeaves() and uncalcLeaves() to rose_build_role_aliasing

Unlike the rest of rose_build_mergem, these functions relate to merging
roles/vertices rather than merging engines.

rose merges: why not dedupe transient engines?

We avoid merging different transient engines as it may force us to run heavier
engines and no stream state is consumed either way. However, there should be
no harm in just removing duplicate instances of a transient engine.

remove !LBR constraints from merge passes

we have either converted candidates to castles already or we have converted them
back in the hope of merging them with other holders

cmake: set isystem flag for older cmake

icc: disable more warnings

cmake: use abi-version on older gcc

rework mergeLeftfixesVariableLag()

fdr_compile: faster scoring code