stream/tcp: fix typos, update copyright year

Bug #5765

exceptions: ignore policy if stream.midstream=true

Set the engine to ignore the stream.midstream-policy if stream.midstream
is enabled.

If we had both stream.midstream AND stream.midstream_policy enabled,
this could lead to midstream flows being dropped (or bypassed, or...)
instead of being accepted by the engine, as it was probably meant when
the user enabled midstream flows.

Bug #5765

exceptions: add master switch config option

This allows all traffic Exception Policies to be set from one
configuration point. All exception policy options are available in IPS
mode. Bypass, pass and auto (disabled) are also available in iDS mode

Exception Policies set up individually will overwrite this setup for the
given traffic exception.

Task #5219

dns: never return error on UDP DNS

UDP parsers should never return error as it should indicate to Suricata
that an unrecoverable error has occurred.  UDP being record based for
the most part is almost always recoverable, at least for protocols like
DNS.

dns: split header and body parsing

As part of extra header validation, split out DNS body parsing to
avoid the overhead of parsing the header twice.

dns: validate header on every incoming message

As UDP streams getting probed, a stream that does not appear to be DNS
at first, may have a single packet that does look close enough to DNS
to be picked up as DNS causing every subsequent packet to result in a
parser error.

To mitigate this, probe every incoming DNS message header for validity
before continuing onto the body.  If the header doesn't validate as
DNS, just ignore the packet so no parse error is registered.

dns: parse and alert on invalid opcodes

Accept DNS messages with an invalid opcode that are otherwise
valid. Such DNS message will create a parser event.

This is a change of behavior, previously an invalid opcode would cause
the DNS message to not be detected or parsed as DNS.

Issue: #5444

github-ci: fedora non-root: suricata-verify -q

Run Suricata-Verify in quiet mode for the non-root build to more
easily find the error when fails.

dns: rustfmt

dns: mark test buffers with rustfmt::skip

log-pcap: remove early output initializing if offline

Remove early opening of output files if running in an offline mode, as
we don't yet know the timestamp to use.

Prevents the first pcap files being opened with a timestamp of 0,
bringing us back to the same behvaviour of pcap logging in 6.0.

Issue: 5374

log-pcap: fix typo in multi-mode error message

log-pcap: display mininum limit on error

On fatal error due to limit being less than the allowed minimum,
display the minimum value in bytes.

util-debug: clang-format required change

runmodes: Determine engine's copy-mode as early as possible

Configuration and behavior of HTP app layer depends on the copy
mode of Suricata engine. Copy mode was set after the app layer setup.
Decision of engine's copy mode operation is now made earlier.

Ticket: #5706

runmodes: remove misleading commment

dpdk: add support for enabling IPS support in DPDK mode

util-device: remove unused functions

runmodes: change function prototype of runmode init functions

Commit contains prototype changes of RunModeSetLiveCaptureAutoFp and
RunModeSetLiveCaptureWorkers functions to move the IPS enable logic
out of suricata.c file.

dpdk: port deprecated DPDK macros to the newer forms

dpdk: add Github action to build Suricata with all available (LTS) DPDK versions

dpdk: print debug xstats counters of all DPDK ports on shutdown

dpdk: add a check for HW checksum validation offload

Ticket: #5553

time: -Wstrict-prototypes fix

time: Rework SCTime_t into a struct

Issue: 5718

This commit changes SCTime_t to a struct with members setup as
bitfields.

time: Replace struct timeval with scalar value

Issue: 5718

This commit switches the majority of time handling to a new type --
SCTime_t -- which is a 64 bit container for time:
- 44 bits -- seconds
- 20 bits -- useconds

format/clang: Apply clang-format

Issue: 5718

frames: enable only used frames

Enable only frames that are actually used.

Ticket: #4979.

files: move FileContainer into FileTransferTracker

Update SMB, NFS, HTTP2.

detect/frame: improve frame detection

Add a per frame progress tracker.

output/frame: log frame type stream

output/frame: improve 'complete' logging

frame: add debug validation check

app-layer/frames: use absolute frame offset

Frame offset was already a 64 bit integer, so simplify things by
making it an absolute offset from the start of the stream.

frames: implement generic <alproto>.stream frames

Add a hard coded <alproto>.stream option for all stream data for
a protocol.

Starts at stream offset 0 or at the point of a protocol upgrade
in case of STARTTLS or CONNECT.

detect/frames: minor cleanup in buffer handling

Don't lookup a buffer twice, even if the lookup should be fast.

htp: simplify streaming buffer config

Use a single static config instead of the per profile config.

streaming: remove config pointer from struct

streaming: internal switch to sbcfg by argument

streaming: add sbcfg to StreamingBufferClear

streaming: add sbcfg to StreamingBufferFree

streaming: add sbcfg to StreamingBufferAppendRaw

streaming: add sbcfg to StreamingBufferAppend

streaming: add sbcfg to StreamingBufferSlideToOffset

streaming: add sbcfg to StreamingBufferInsertAt

streaming: add sbcfg to StreamingBufferAppendNoTrack

output/filedata: trunc file in output again

files: update API and callers to take stream config

This is to allow not storing the stream buffer config in each file.

output/filedata: don't call file close

Will be reenabled after file API is updated.

app-layer: get sbconfg with files

files: remove filecontainer drop trait

In preparation of it becoming impossible to use due to the free
function getting an cfg argument.

http2: explicity free files

In preparation of adding an argument to the free functions which
means the drop trait can't be used anymore.

smb: explicity free files

In preparation of adding an argument to the free functions which
means the drop trait can't be used anymore.

nfs: explicity free files

In preparation of adding an argument to the free functions which
means the drop trait can't be used anymore.

nfs: file handling cleanups

smb: file handling cleanups

files: remove unused Rust binding for file pruning

streaming: set size and max regions defaults

htp: remove duplicate prototypes

htp/body: minor optimization

flow: inline commonly used getters

streaming: remove inefficient buffer grow logic

streaming: remove unused slide logic

streaming: remove unused config member

streaming: make minimum region gap size configurable

stream/reassembly: make max-regions configurable; set default

streaming: add max regions config option

stream/list: hack around GAP handling in tests

stream: improve gap tests

eve: log max regions

stream: flow timeout improvement

Check continuous data for app-layer and post gap data as well for
stream inspection.

streaming: implement memory regions

In TCP, large gaps in the data could lead to an extremely poor utilization
of the streaming buffer memory. This was caused by the implementation using
a single continues memory allocation from the "stream offset" to the
current data. If a 100 byte segment was inserted for ISN + 20MiB, we would
allocate 20MiB, even if only 100 bytes were actually used.

This patch addresses the issue by implementing a list of memory regions.
The StreamingBuffer structure holds a static "main" region, which can be
extended in the form of a simple list of regions.

    [ main region ] [ gap ] [ aux region ]
    [ sbb ]                 [ sbb ]

On insert, find the correct region and see if the new data fits. If it
doesn't, see if we can expand the current region, or than we need to add
a new region. If expanding the current region means we overlap or get
too close to the next region, we merge them.

On sliding, we free any regions that slide out of window and consolidate
auxilary regions into main where needed.

Bug: #4580.

stream: reduce streaming buffer internals use

smb: fix post-trunc chunk behavior

After a gap in a file transaction, the file tracker is truncated. However
this did not clear any stored out of order chunks from memory or stop more
chunks to be stored, leading to accumulation of a large number of chunks.

This patches fixes this be clearing the stored chunks on trunc. It also
makes sure no more chunks are stored in the tracker after the trunc.

Bug: #5781.

fuzz: check libpcap timestamp consistency

That is microseconds should be positive

fuzz: fix use of uninitialized value

packet timestamp is not set when function returns error.
also use C positive modulo for microseconds

ftp: completely resets port_line

In the case port_line is first allocated and port_line_len is set,
Then a second request reaches memcap and frees port_line,
port_line_len should also be reset, because both will get used
by the response parsing.

Ticket: #5701

userguide: update http.cookie description

Signed-off-by: jason taylor <jtfas90@gmail.com>

flow-worker: prune frames and stream for pseudo packets as well

debug: add pkt_src to detect/stream entry log

stream: add debug statements

stream: consider any uninspected data

stream: minor constification

streaming/sbb: fix debug message

stream: remove bug on from packet path

output: improve debug format by adding function name

src: fix deprecated-non-prototype compile warnings

Tested on Fedora 37 with clang 15.

util-strlcatu.c:45:8: error: a function definition without a prototype is deprecated in all versions of C and is not supported in C2x [-Werror,-Wdeprecated-non-prototype]
size_t strlcat(dst, src, siz)
           ^
1 error generated.

src: fix unused-but-set-variable compile warnings

Tested on Fedora 37 with clang 15.

datasets.c:852:9: error: variable 'n' set but not used [-Werror,-Wunused-but-set-variable]
    int n = 0;
        ^
1 error generated.

src: fix strict-prototype warnings

Tested on Fedora 37 with clang 15.

app-layer.c:1055:27: error: a function declaration without a prototype is deprecated in all versions of C [-Werror,-Wstrict-prototypes]
void AppLayerSetupCounters()
                          ^
                           void
app-layer.c:1176:29: error: a function declaration without a prototype is deprecated in all versions of C [-Werror,-Wstrict-prototypes]
void AppLayerDeSetupCounters()
                            ^
                             void
2 errors generated.

smb: configurable max number of transactions per flow

Ticket: #5753

smb: convert transaction list to vecdeque

Allows for more efficient removal from front of the list.

Ticket: #5753

detect/frames: fix crash when parsing bad rule

Indexing of Signature::init_data::smlists would fail for a rule that
used a frame and fast_pattern w/o content, as the array would only be
expanded when adding a content.
Adding a check to see if there list id is in bounds
is an implicit check for the "no content" case.

Ticket: #5530

github-actions: bump ossf/scorecard-action from 2.1.1 to 2.1.2

Bumps [ossf/scorecard-action](https://github.com/ossf/scorecard-action) from 2.1.1 to 2.1.2.
- [Release notes](https://github.com/ossf/scorecard-action/releases)
- [Changelog](https://github.com/ossf/scorecard-action/blob/main/RELEASE.md)
- [Commits](https://github.com/ossf/scorecard-action/compare/15c10fcf1cf912bd22260bfec67569a359ab87da...e38b1902ae4f44df626f11ba0734b14fb91f8f86)

---
updated-dependencies:
- dependency-name: ossf/scorecard-action
  dependency-type: direct:production
  update-type: version-update:semver-patch
...

Signed-off-by: dependabot[bot] <support@github.com>

doc/userguide: update logging section for time formats

- Update fragment of configuration file to match suricata.yaml with
  new default-log-format.
- Document new %z format specifier.

logging: use ISO-like timestamp in file log

Also update suricata.yaml to show this default, as updating the
"default-log-format" does not affect the file output.

suricata.yaml: update default-log-format current state

The default-log-format has changed, reflect this in the suricata.yaml.

logging: add new date format: YYYY-MM-DD HH:MM:SS

Adds a new logging format character, %z that uses a more standard time
format of "YYYY-MM-DD HH:MM:SS".

Ticket #5764

src: remove unneeded double colon

git grep ';;' src/ | grep -v for | cut -d: -f1 | uniq
| while read f; do sed -i -e 's/;;/;/' $f; done

smb: fix typo in comment

test: remove one duplicate line