doc: list server/peer options that can be set in chronyc

doc: fix examples of add server and add peer commands

cmdparse: add function to convert error status to string

This is used to avoid duplication of error printing in chronyd and
chronyc.

sys: use system headers for adjtimex

sys: remove shift_hz

It's not used for anything since commit e147f2f1.

sys: remove TMX_ReadCurrentParams

sys: add sync status setting to generic and Linux driver

Set the adjtimex status, esterror and maxerror fields to the values
provided by the reference module.

sys: fix formatting in sys_linux.c

local: add new driver call to set synchronization status

This will be used to set the kernel adjtimex() variables to allow other
applications running on the system to know if the system clock is
synchronized and the estimated error and the maximum error.

client: add second form of makestep command

The second form configures the automatic stepping, similarly to the
makestep directive. It has two parameters, stepping threshold (in
seconds) and number of future clock updates for which will be the
threshold active. This can be used with the burst command to quickly
make a new measurement and correct the clock by stepping if needed,
without waiting for chronyd to complete the measurement and update the
clock.

cmdmon: initialize new source params when adding source

sources: allow setting minsamples and maxsamples for each source

The minsamples and maxsamples directives now set the default value,
which can be overriden for individual sources in the server/peer/pool
and refclock directives.

ntp: don't replace source instance when changing address

Add new functions to change source's reference ID/address and reset the
instance. Use that instead of destroying and creating a new instance
when the NTP address is changed.

ntp: limit number of pool sources

A new option can be now used in the pool directive: maxsources sets the
maximum number of sources that can be used from the pool, the default
value is 4.

On start, when the pool name is resolved, chronyd will add up to 16
sources, one for each resolved address. When the number of sources from
which at least one valid reply was received reaches maxsources, the
other sources will be removed.

ntp: update number of sources when removing all sources

Also, rehash the records after removal and split cleaning of the source
record to a separate function.

ntp: return status from NCR_ProcessKnown()

doc: update tempcomp description

tempcomp: allow configuration with list of points

In addition to the quadratic function, allow configuration of the
compensation with a file containing list of (temperature, compensation)
points used for linear interpolation and extrapolation.

test: fix 111-knownclient

The new NTPv4 loop synchronization check fails as clknetsim doesn't
support IP_PKTINFO yet. Use the noselect option to prevent the server to
synchronize to the client.

ntp: fix accepting requests from configured sources

When using server socket to send client requests (acquisitionport 123)
and currently not waiting for a reply, the socket check will fail for
client requests from the source.

The check needs to be moved to correctly handle the requests as from an
unknown source.

tempcomp: fix double free on sensor filename

This is related to commit f6ed7844e1ac8c25fe9ba84232c563f302beba30.

conf: change default stratumweight to 0.001

ntp: support pools

The pool directive can be used to configure chronyd for a pool of NTP
servers (e.g. pool.ntp.org). The name is expected to resolve to multiple
addresses which change over time.

On start, a source will be added for each resolved address. When a
source from the pool is unreachable or marked as falseticker, chronyd
will try to replace the source with a newly resolved address of the
pool.

The minimum interval between replacements is currently set to 244
seconds to avoid frequent DNS requests.

ntp: allow changing address of core instance

ntp: try adding other server addresses

When adding a server from configuration file, don't give up when the
first returned address was already added for another server directive,
but try adding other addresses until one succeeds.

nameserv: add support for returning multiple addresses

nameserv: check that address returned from gethostbyname() is IPv4

Also, always return failure with -6.

ntp: take auto_offline sources offline before sending new request

test: add 116-minsources

sources: add minsources option

This sets the minimum number of selectable sources needed to update the
local clock.

docs: fix formatting of examples in server options

ntp: add version option to server/peer directive

conf: use array for broadcast destinations

conf: use arrays for NTP and cmdmon restrictions

test: add 009-sourceselection

test: add option to create falsetickers

ntp: remove debug messages in slew handler

sourcestats: reduce debug messages in slew handler

sources: reset reachability for offline sources

With the recent change allowing unreachable sources to remain selected,
offline sources will now be selectable only for some time, similarly to
online unreachable sources.

sources: allow selection of unreachable sources

Reachability is no longer a requirement for selection. An unreachable
source can remain selected if its newest sample is not older than the
oldest sample from all reachable sources.

This is useful to prevent reselection when an accurate source uses a
very short polling interval (e.g. refclock) and is occasionally
unreachable for short periods of time.

sources: extend source status tracking

Add new source states and rename some states so there is one state for
each reason a source can be rejected in the source selection.

This fixes reported status when sources are selectable, but the actual
selection was postponed until next update. It will also allow more
detailed reports when the cmdmon protocol is updated.

sources: fix reported normal select option

sources: select only when reference can be updated

Before selecting the new synchronization source wait until the reference
can be updated, i.e. the source has new samples.

sources: drop selectable flag

This is no longer needed with new NTP packet processing as the sources
are always selectable after first sample is accumulated.

sources: reorder SRC_SelectSource()

Reorder the code to improve readability and also update coding style.
No functional changes.

sources: keep synchronized status with unreachable/unselectable sources

Following RFC 5905, don't call REF_SetUnsynchronised() when there are no
reachable or selectable sources. It's up to the client to consider the
source unsynchronized when the root distance exceeds a threshold.

The unsynchronized status is still set when no majority is reached.

sources: update reference only with new sample

This follows the section 11.2.3. from RFC 5905.

ntp: fix Clang warning

ntp: merge broadcast code with ntp_core

ntp: define NTP_MAX_STRATUM for other modules

doc: update for NTPv4 support

Update comments referencing RFC 1305

ntp: update packet processing to NTPv4 (RFC 5905)

ntp: clamp value set by minstratum option

sources: use correct specifier for refid in debug message

ntp: print number of bytes sent in debug message

ntp: enable PKTINFO on client sockets

This will be useful to detect synchronization loops.

util: fix sockaddr function naming

client: improve sources caption

util: use common functions to convert to/from sockaddr

client: print full date in manual list

ntp: fix NSR_TakeSourcesOffline()

This was broken when switching to dynamic allocation in commit 9e7193.

keys: store IDs in uint32_t

logging: remove warning on missing debug messages

The state of the DEBUG feature is now printed with chronyd version.

cmdmon: fix initialization of allocated reply slots

The next pointer in the last allocated reply slot was not set. This
could cause a crash when more slots were needed. (the slots are used to
save unacknowledged replies to authenticated commands)

cmdmon: allocate reply slots in smaller quantums

cmdmon: use char for permissions table

refclock: include refid in some debug messages

util: optimize UTI_RefidToString()

rtc: allocate samples dynamically

conf: allocate sources dynamically

This removes the limits on maximum number of sources specified by the
initstepslew, server and refclock directives in the config file.

ntp: allocate source records dynamically

This removes the limit on maximum number of added NTP sources.

refclocks: allocate refclock instances dynamically

keys: allocate keys dynamically

This removes the limit on maximum number of keys in the key file.

sched: allocate file handlers dynamically

sources: reallocate arrays in exponentially increasing sizes

ntp: improve hashing of sources

Use 32-bit hash and switch to quadratic probing. This will be useful to
allow resizing of the hash table and not limit the number of sources.

Add array utility functions

Free allocated memory on exit

This should reduce the number of possible memory leaks reported by
valgrind. The remaining reported leaks are sched tqe allocation, async
DNS instance allocation, cmdmon response/timestamp cell allocation, and
clientlog subnet allocation.

cmdparse: don't duplicate hostname in CPS_ParseNTPSourceAdd()

Let the caller duplicate the string if needed.

Check for memory allocation errors

test: make 114-presend more tolerant

nameserv: move fallback DNS_Name2IPAddressAsync() to stubs.c

configure: add --disable-sechash option

Print enabled/disabled features with version

configure: unify macro naming for optional features

configure: allow building without cmdmon, NTP, refclock support

configure: unify macro naming for available headers

configure: don't remove config files with --help

sourcestats: remove tracking of skew change

This is not used since commit 7a6ee1d.

doc: update NEWS

doc: mention that directives are not case-sensitive

doc: add section to FAQ on improving accuracy with NTP

doc: remove minpoll and maxpoll options from configuration example

sched: fix Clang warning

client: describe error when could not open config or keyfile

Ignore measurements around leap second

When current time is within 5 seconds of a leap second, don't accumulate
new samples or update the leap second status to increase the chances of
getting through safely.

ntp: print warning 10 years before supported time ends

configure: check if pkg-config is available

This is needed with some shells to prevent "pkg-config: not found"
errors from being displayed.

Fix compiler warnings on NetBSD