Fix some HA-SC memory leaks.

Remove ha.h as an include in flow.h as it caused a build error for 'extra'

Update CMake scripts and dev_notes.

HA-SC effort.

Interim ha commit

Initial UDP HA.

Merge pull request #442 in SNORT/snort3 from ~JOCORNET/snort3:remove_lua_dependency_from_module_h to master

* commit '40511acf8424f2d6c11b5b9e32ac2320a2cc0ee0':
  remove lua dependency from module.h

remove lua dependency from module.h

Merge pull request #434 in SNORT/snort3 from ~JOCORNET/snort3:pkgconfig_fix to master

* commit '1ca64c5e7aebc8a79c87f54692ded4cff107c922':
  removed comment
  more corrections for pkg-config/removed defines altogether
  normalized pkgconfig output

Merge pull request #439 in SNORT/snort3 from perf_units to master

* commit '21b0127fa8e9c482befdffed7b8daffb72e223fc':
  fixed perfmon unit test

Merge pull request #411 in SNORT/snort3 from gitignore-update-for-build-scripts to master

* commit '1fa4620767cf3a830fd8c612b2554690f7d4f9f8':
  Additional gitignores for the build scripts
  Ignore files generated by the build-scripts

Merge pull request #440 in SNORT/snort3 from ~MIALTIZE/snort3:for-russ-trivial to master

* commit 'a2c9c06742b2d1d8b02ae6186926f907cad3b7ef':
  tcp_tracker: Add explicit override specifier to init_toolbox

Merge pull request #441 in SNORT/snort3 from ~MIALTIZE/snort3:Catch-1.4.0 to master

* commit '839005f3ac034bf3bee18246477aee7885066094':
  catch: Update to Catch v1.4.0

packet capture works internally. no external interface. bpf under dev

tcp_tracker: Add explicit override specifier to init_toolbox

catch: Update to Catch v1.4.0

Additional gitignores for the build scripts

fixed perfmon unit test

removed comment

more corrections for pkg-config/removed defines altogether

Merge pull request #438 in SNORT/snort3 from ~JOCORNET/snort3:fix_utils_cpputest to master

* commit 'c9be47d83eba353a7e121b78ea339041102ff96e':
  added utils cpputest to cmake

Merge pull request #424 in SNORT/snort3 from crc/s5c to master

* commit 'cf2177004aadfd81f503b009543abfef7809ce21':
  on session cleanup always release all allocated resources (e.g. splitter, reassembler...)
  reset paf when we cleanup a session and reset the splitters
  don't delete splitters in session cleanup unless we are doing a full session reset
  fix stream tcp config leak

added utils cpputest to cmake

Fix some bugs found during testing and uncrustify.

Removed perf_flow.h which had been removed from master.

ProtocolId and IpProtocol updates.

Add IpProtocol and ProtocolId enums.

normalized pkgconfig output

on session cleanup always release all allocated resources (e.g. splitter, reassembler...)

Merge pull request #433 in SNORT/snort3 from ~MIALTIZE/snort3:for-russ-trivial to master

* commit '6bb3c2d11d456582d98f228ea0ea2a8340a57d12':
  sfdaq: Fix symbol visibility

Merge pull request #432 in SNORT/snort3 from ~JOCORNET/snort3:cmake_updates to master

* commit 'c43fc8e9ce38d5c27868666bdc125683aca1e8bc':
  linked catch tests lib against framework
  foo
  linked catch tests lib against framework
  foo

sfdaq: Fix symbol visibility

wrapped linkage with conditional

linked catch tests lib against framework

foo

linked catch tests lib against framework

foo

Merge pull request #430 in SNORT/snort3 from ~JOCORNET/snort3:cmake_updates to master

* commit '084b517734e4d8e1e6a1ea294a9469071295381e':
  fixed typo
  folded linking of libs into macro invocation
  patched for cmake 2.x

fixed typo

folded linking of libs into macro invocation

patched for cmake 2.x

Merge pull request #426 in SNORT/snort3 from ~JOCORNET/snort3:cmake_updates to master

* commit '15807007e14cb788e468a7d5cf3a60e9236c6a67':
  added catch tests and conditional add_cpputest
  added a fix for a thing
  initial

reset paf when we cleanup a session and reset the splitters

Merge pull request #428 in SNORT/snort3 from capture to master

* commit '050ee1a38b24ffe9745ca1bbc243814fa2114ea6':
  Add file capture stats

don't delete splitters in session cleanup unless we are doing a full session reset

Merge pull request #427 in SNORT/snort3 from ~MIALTIZE/snort3:for-russ-trivial to master

* commit '884183d0393d7baf7f60f87e25633fcbdc5af161':
  Remove extraneous semicolons.

Merge pull request #429 in SNORT/snort3 from perf_unitfault to master

* commit '0d3b6824ae902979135552e5082cd1e3bca72671':
  fixed sigabrt in BaseTracker unit test
  fixed sigabrt in BaseTracker unit test
  fixed sigabrt in BaseTracker unit test

fixed sigabrt in BaseTracker unit test

fixed sigabrt in BaseTracker unit test

fixed sigabrt in BaseTracker unit test

Add file capture stats

Remove extraneous semicolons.

added catch tests and conditional add_cpputest

added a fix for a thing

initial

Merge pull request #425 in SNORT/snort3 from capture to master

* commit '26fa7261586551c86c355dc7ad40b12567616784':
  Remove debug functions used

Remove debug functions used

fix stream tcp config leak

Merge pull request #423 in SNORT/snort3 from crc/s5 to master

* commit '2f3b4798d61999c2531a3c65d7ef3b1207129c84':
  revert delete temporarily

revert delete temporarily

Merge pull request #421 in SNORT/snort3 from perf_build2 to master

* commit 'dc806bf0dfc872363334ed990aef28d37f80f15b':
  fixed include order
  fixed build without unit tests

fixed include order

Merge pull request #422 in SNORT/snort3 from ~MIALTIZE/snort3:for-russ-trivial to master

* commit '15f6fb12bff50d08b9b412bf1ced37da54e4d562':
  expected: Fix static analysis useless initialization warning

expected: Fix static analysis useless initialization warning

fixed build without unit tests

Merge pull request #417 in SNORT/snort3 from ~MIALTIZE/snort3:sfdaq to master

* commit '4c0d2abc95992d478e19f9aa3b39841e85894123':
  sfdaq: Let the Style Wookiee win.
  snort2lua: Handle DAQ/SFDAQ config changes
  util: Remove unused StringVector code
  sfdaq: Replace Snort DAQ module with the SFDAQ module
  thread_config: Only log when actually changing thread affinity
  dce_rpc: Make DCE2_HandleSegmentation static
  m4: Update macros with upstream from autoconf-archive

sfdaq: Let the Style Wookiee win.

Merge pull request #415 in SNORT/snort3 from perf_format to master

* commit '9b8bb00969bea18b2f5f8ec77173c1fb9c35ba88':
  fixed method access
  hid file and time implementation details from PerfTrackers
  fixed file rotation
  fixed dev_notes comments. fixed line wrapping
  fixed extra keyword
  added comments for perfmon APIs
  added unit tests to FlowTracker following major refactor. Fixed uninitialized and improperly sized variables in FlowTracker.
  removed EventTracker in place of search_engine peg counts. Added unit tests to BaseTracker.
  added mock formatter to ease tracker unit testing
  Refactored perf_formatter to replace the bulk of explicit copy operations with pointers (FlowStateValue remains / 128 byte memcpy per flow ip entry)
  removed double type from formatter
  Update dev notes
  refactored FlowTracker into c++. added PegCount vector type to PerfFormatter. removed unused test directory. removed remainder of legacy code (perf_flow.*)
  integrated base, cpu, event with formatters. added string value for formatters.
  created TextFormatter
  completed CSVFormatter
  added unit for CSVFormatter
  update makefiles
  created PerfFormatter

snort2lua: Handle DAQ/SFDAQ config changes

util: Remove unused StringVector code

sfdaq: Replace Snort DAQ module with the SFDAQ module

thread_config: Only log when actually changing thread affinity

dce_rpc: Make DCE2_HandleSegmentation static

m4: Update macros with upstream from autoconf-archive

Merge pull request #419 in SNORT/snort3 from nhttp42 to master

* commit 'e701252271b415b4237a522e0d7b6f5411e898cf':
  comment fix
  Unicode map file

comment fix

fixed method access

hid file and time implementation details from PerfTrackers

fixed file rotation

Merge pull request #418 in SNORT/snort3 from ~JOCORNET/snort3:latency_leak_fix to master

* commit '4f8c6e7578143ea4fb2e0efbe12334f18d3f58b4':
  further cleanup and fixed review comments
  added thread-local cleanup for latency

fixed dev_notes comments. fixed line wrapping

fixed extra keyword

added comments for perfmon APIs

added unit tests to FlowTracker following major refactor. Fixed uninitialized and improperly sized variables in FlowTracker.

further cleanup and fixed review comments

added thread-local cleanup for latency

Merge pull request #404 in SNORT/snort3 from ~JOCORNET/snort3:fix_coverage_clang to master

* commit '984e3de28555cfb2fc08d504ece8978389cc177f':
  test for GNU compiler before attempting to link against libgcov

removed EventTracker in place of search_engine peg counts. Added unit tests to BaseTracker.

Unicode map file

added mock formatter to ease tracker unit testing

Refactored perf_formatter to replace the bulk of explicit copy operations with pointers (FlowStateValue remains / 128 byte memcpy per flow ip entry)

Merge pull request #413 in SNORT/snort3 from ~MIALTIZE/snort3:for-russ to master

* commit '73e6c98b8906ff3ce04b70840e7277b9861fdc8b':
  expected: Fix some memory leaks and move some comments

expected: Fix some memory leaks and move some comments

Merge pull request #416 in SNORT/snort3 from perf_hinky to master

* commit '68c6f7518e820ffed47eef195f2b0a28fa2fb0e6':
  fixed hinkiness

removed double type from formatter

Update dev notes

fixed hinkiness

Merge pull request #414 in SNORT/snort3 from crc/leaks to master

* commit '23d1d3796e20ece2d3d90e5044d2054d71f6aca1':
  plug misc leaks

plug misc leaks

build 194