fdr: move fdrSize into namespace ue2 (build only)

mcclellan compile: more efficient discovery of accel

noodle_build: update interface to use hwlmLiteral

cmpForward: assume (and assert) p2 is upper-case

unit: fix up noodle unit tests

hwlm_literal: coerce nocase lits to upper-case

ue2string: bring caseless cmp inline

noodle: remove redundant bitmask

noodle: use SSE palignr

ng_mcclellan: move logic into base class

Move all of the Automaton logic into Automaton_Base, which is templated
on its StateSet/StateMap types.

ng_haig: move logic into base class

Move all of the Automaton logic into Automaton_Base, which is templated
on its StateSet/StateMap types.

rose: assert that program offset is sane

nfa_kind: documentation

mpv: native report remapping

castle, lbr: native report remap

castle: add nfa kind to CastleProto

mcclellan, gough: native report remapping

rose: remap reports to program offsets

report_manager: store report -> program mapping

Merge functions no longer need transfer function

Remove OutfixInfo::chained (which meant "is MPV")

Use a visitor for outfix engine construction

OutfixInfo: use boost::variant for engines

Wrap MPV puffettes in a struct

scratch: delete unused hs_scratch::qNfaState

ng_limex_accel: delete unused DAccelScheme ctor

report: remove dead function isInternalSomReport

report: remove dead function satisfiesMinLength

FINAL_REPORT: Add specialised instruction

Specialisation of the REPORT instruction that also terminates execution
of the program. Improves performance on programs that generate many
reports.

Rose: replace internal_report with program

Replace the use of the internal_report structure (for reports from
engines, MPV etc) with the Rose program interpreter.

SOM processing was reworked to use a new som_operation structure that is
embedded in the appropriate instructions.

Help ICC perform a not m128

shufti: small C++11 fix to silence clang warning

bitfield: unroll main operators

CharReach operators inline

unify some accel code/structures between limex and mcclellan

more efficent accel path discovery

smallwrite: don't recompile the dfa if prune fails

raise the limit of strings in double shufti

allow double shufti to share buckets

make dverm more precise

masked version of dverm

refactoring of double byte offset accel to use paths and add to mcclellan

look for normal accel schemes using compressed alpha

simple offset accel for mcclellan start state

dump contents of double shufti masks

move MultibyteAccelInfo to accelcompile.h

exhaust: Update interface

 - Only use functions in exhaust.h for valid ekeys
 - Use INVALID_EKEY everywhere (remove dupe END_EXHAUST sentinel)

Runtime: be more careful with status bits

Rose: use a multibit for the exhaustion vector

Previously, the exhaustion vector was a standard bitvector, which
required an expensive memset() call at init for databases with a large
number of exhaustion keys.

mmbit_all: True if all keys are switched on

mpv: fire only one report when simple-exhaustible

mpv: use size_t for count, not u32

Small cleanup in processReportsForRange.

Build convenience libraries as static libs

Remove unused storeu macros

Remove unused loadu2x128

mmbit_iterate_bounded: make block_width u64a

remove HAVE_PTHREAD_H

remove ENABLE_TOOLS_THREADS

mcclellan: Remove the use of state numbering

McClellan and Haig only need to know which states are not participants
(i.e. unused start, startDs)

ng_find_matches: Simplify and improve performance

Improve performance by using bitsets rather than sets of vertex
indices.

shufticompile: Remove unused mergeShuftiMask

scratch: Remove (now unused) tctxtToScratch

castle/repeat: fix a number of bugs

- Add fits_in_len_bytes assertions for packed stores.
  Corrects the assertion formerly on line 888.

- In exclusive mode, don't overwrite packedCtrlSize with the max of the
  group; each repeat should know how many bytes it is using, even if
  they share the same stream state.

- Ensure that exclusive mode stream state is sized correctly.

PrintTo functions for google test and valgrind

UE-2919: add termination checks around handleReportInternally

makeReport: remove unused param

Rose: be more precise with CATCHUP instruction

- Fix bugs introduced by recent addition of the boundary program. It's
  not safe to do catchup there.
- Only do catchup once per report set, when necessary.

AlignedAllocator: simplify and fix for MSVC, C++11

- Simplify thanks to minimal allocator requirements in C++11.
- Add required copy constructor.

Rose: use program for boundary reports

Use the program to handle report lists at boundaries, rather than the
previous list-of-reports approach.

Rose: make all NFA callbacks take scratch as ctx

Rose: make HWLM callbacks take scratch as ctx

Rose: remove dead function roseHandleMatch

Rose build: move HWLM build code to own file

To reduce the size of rose_build_bytecode.cpp a little, move the code
that deals with HWLM literal tables into its own new file.

Add hs_expression_ext_info() API function

This is a variant of hs_expression_info() that can also accept extended
parameters.

Rose: use program for all literal matches

Unifies all literal match paths so that the Rose program is used for all
of them. This removes the previous specialised "direct report" and
"multi direct report" paths. Some additional REPORT instruction work was
necessary for this.

Reworked literal construction path at compile time in prep for using
program offsets as literal IDs.

Completely removed the anchored log runtime, which is no longer worth
the extra complexity.

Fixed some DEBUG_OUTPUT format string.

ComponentCondReference: mark ctors explicit

Use using directives to silence hiding warning

Remove CMake tests for pthread barriers

Don't enable -Werror for release builds

Using -Werror is a very good thing during development, but it has the
potential to break the user's build, for example, if they are using a slightly
different compiler combination to one that has been tested previously.

Fix typo

Install pkgconfig file everywhere but Windows

Always init NFAContext::cached_br

Now that it's on stack, this should be initialised. Silences a warning
from valgrind.

Correct asserts

Castle: exclusive analysis for multiple subcastle chunks

Apply clique analysis to subcastle chunks if the number of
subcastles is large and check the status of each chunk
separately at runtime.

Rose: further generalise literal dedupe work

Rose: don't assume roles with >1 lit need dedupe

We only require dedupe for such roles when they have literals that can
arrive simultaneously (i.e. one literal overlaps with the suffix of
another).

Rose: make DR runtime path external report only

Rose: only use direct reports for external reports

Rose: allow DR literals to share vertices

Rose: allow direct reports to be aliased

Rose: assign DRs in allocateFinalLiteralId

Previously, direct reports were allocated earlier; now all final IDs are
assigned in the same place.

Improved test for AVX2 support

Test for xsave and XMM/YMM registers. Use ICC dynamic feature detection
where available.

Make comparison signed (fix warning)

Dump: give abs jump targets in output

Rose program: Improvements to debug/assertions

- Add current pc to debug printf.
- Assert that pc doesn't escape the RoseEngine structure.

Update Rose state layout description

Many of the things in this list no longer existed.

Split CHECK_LEFTFIX into CHECK_{INFIX,PREFIX}

reduceInfixQueue: factor out any_work check

Rename rosePrefixCheckMiracles to roseLeftfix...