Add support for NSS library

This adds support for the NSSLOWHASH API provided by the freebl3
library.

Add support for different authentication hashes

Allow different hash functions to be used in the NTP and cmdmon
protocols. This breaks the cmdmon protocol compatibility. Extended key
file format is used to specify the hash functions for chronyd and new
authhash command is added to chronyc. MD5 is the default and the only
function included in the chrony source code, other functions will be
available from libraries.

Fix writing rtc data when called soon after trimrtc

Use ADJ_OFFSET_SS_READ mode only with kernels 2.6.28 and later

Add macro for maximum fastslew timeout

Check for timepps.h also in sys directory

Merge NCR_Process functions

Add support for ADJ_SETOFFSET mode

This adjtimex mode allows precise stepping of the system clock.

Check sample ordering on accumulation

If the newly accumulated sample is not newer than than the last one,
discard the source history and start from scratch. This can happen after
loading an invalid dump or when the system clock was stepped.

Update gpsd SOCK example in documentation

Use initial delay also for burst samples

Make scheduling loop detector less sensitive

It could be triggered by delayed name resolving as it adds multiple new
timeouts which can be called in the same dispatching if the DNS responses
are slower than initial delay and sampling separation.

Compare number of dispatched events also with current number of
timeouts.

Wait in foreground process until daemon is fully initialized

Exit when all sockets are ready and initstepslew command and rtc step
are completed. Also, in case of a fatal error, print the error message
and exit with a non-zero status.

Always use delayed name resolving for server and peer directives

This significantly reduces initialization time.

Change working directory to /

Read config after opening syslog

Disable maxdelayratio test by default

Change default maxdelayratio from 16384.0 to 0.0. A value larger
than 1.0 is required to enable the test.

Match skew in ntp_core to sourcestats skew

Limit skew used in NTP test4

With iburst and very jittery sources the source skew can reach very high
values which makes the NTP test4 fail even with relatively small delays.
Limit the skew to 2000 ppm to avoid getting state where a source is unable
to accept more than first three iburst samples.

Fix creating logdir

Update NEWS

Retry on permanent DNS error by default

Update NEWS

Add configure option for sendmail path

Generate version and date in man pages

Convert make_release to shell script

Remove chrony.lsm

Step also cooked select timestamp in scheduler slew handler

Detect infinite loop in scheduler

If more timeouts were handled than there were in the timer queue on
start, assume some code is scheduling timeouts with negative delays and
abort. Make the actual limit higher in case the machine is temporarily
overloaded and dispatching the handlers takes more time than was delay
of a scheduled timeout.

Add asserts for timeout delays

Add waitsync command

Fix current_total_tick calculation

Don't call driver read_freq in LCL_ReadAbsoluteFrequency

Create logdir before making first tracking write

Don't update drift file on first reference update

Don't reset kernel frequency on start without drift file

Don't use uninitialized values

Validate leap status in refclock samples

Set leap status by enum

Store reference IDs in uint32_t

Don't limit refclock driver name to 4 chars

Don't try to recover from our own time steps

Try to handle unexpected backward time jumps

Set version string in config.h

Add .deps to .gitignore

Make .deps order-only prerequisite

Remove kernel version check from rtc code

It should work with all currently supported kernels (>= 2.2.0).

Determine hz and shift from sysconf(_SC_CLK_TCK) when available

Log final version specific details

Drop support for old readonly adjtime

Drop support for pre 2.2 Linux kernels

Support Linux 3.0 and later

Accept packets with compatible NTP versions

All incoming NTP packets are now required to have version 2, 3 or 4.

Set source IPv6 address on NTP reply

This is needed on systems with multiple IPv6 addresses to reply with
the same source address as the destination address of the NTP request.

Merge CCWARNFLAGS with CFLAGS

Use config.h

Use object dependencies in Makefile

Update NEWS

Update versions in man pages

Modify weight calculation again

Dividing the weights by variance or unweighted variance seems to have a
significant negative impact on response with normally distributed
network delays.

Divide by the difference between the mean and minimum distance instead.
It should be stable as there is no loop and the response seems to be a
good compromise between the original minimum distance weighting which
works well with normally distributed delays and the variance weighting
which works well with exponentially distributed delays.

Revert using unweighted variance in weight calculation

This reverts commit 165e6805ab2e46b6fe6b627fcc5fd72d95802c39.

Increase smoothing factor in refclock variance

Update NEWS

Add another chrony.conf example

Ignore extra samples in reported nruns

In weight calculation use unweighted variance from last regression

This fixes a positive feedback where weights could reach inf.
Also change the SD_TO_DIST_RATIO constant to get close to the original
response.

Allow changing tick up to max_tick_bias

Change default maxclockerror to 1 ppm

Set reference time to last sample instead of time on update

This is done mainly to fix reported root dispersion to include max clock
error after selecting another source without new sample.

Update refclock documentation

Add new commands to protocol comment in candm.h

Update client copyright message

Assert there are no unhandled commands in cmdmon

Add reselectdist command

Don't add \n to chronyc command line arguments

This fixes parsing of some commands.

Revert marking offline sources as unreachable

Don't crash when sources report is requested soon after start

Add include directive

Add configure option to force retry on DNS failure

This is apparently needed on system which keep nameservers specified
in /etc/resolv.conf even when there is no network connection. Should be
used with care as invalid names will be retried forever.

Don't update empty sourcestats on clock update

Fix warnings produced by latest gcc

Reduce Linux driver verbosity

Don't log error on opening driftfile

Log frequency and skew values read from the driftfile instead.

Make starting log even in debug mode

Don't log in signal handler

Don't use uninitialized memory when setting RTC time

Use system headers for Linux RTC support

Fix compiler warnings in PPS configure test

Update NEWS

Update credits

Remove CVS headers

Update copyright

Ignore reselectdist for refclocks

Make importance of stratum in source selection configurable

Instead of always selecting the source with minimum stratum, add weighted
stratum to the distance when comparing selectable sources. The weight
can be configured with new stratumweight directive and can be set to
zero to ignore stratum completely, by default 1.0.

Disable variance source test for now

It seems it triggers even with one source alone if it's close and
accurate or polling interval is long enough. It would need to include
max_clock_error.

Add outlyer source status to cmdmon protocol

This is not used yet.

Print sources with bad stats in client as unreachable

Select source with minimum distance using a scoring system

Each source has a score against currently selected source which is
updated (multiplied by ratio of their distances) when one of the two
sources has a new sample. When the score reaches a limit, the source
will be selected. This should allow to slowly select the source with
minimum distance without frequent reselecting.

To avoid switching between sources with very variable distances (e.g. on
LAN or when upstream server uses a longer polling interval), sources
that are currently not selected are penalized by a fixed distance. This
can be configured with new reselectdist directive (100 microseconds by
default).

Set status on doffset and dfreq commands

Reply with status invalid instead of bad length on invalid command