alignr methods for avx2 and avx512 added

limex_shuffle added and it's unit tests

remove duplicate functions from previous merge

add missing compile flags

add accidentally removed lines

* add -fno-new-ttp-matching to fix build-failures on newer gcc compilers with C++17
* add explicit -mssse3, -mavx2 in compiler flags in respective build profiles

Move SVE functions into their own files.

Change-Id: I995ba4b7d2b558ee403693ee45d747d414d3b177

Implement new DoubleVermicelli16 acceleration functions using SVE2

Change-Id: Id4a8ffca840caab930a6e78cc0dfd0fe7d320b4e

Use SVE shufti for counting miracles.

Change-Id: Idd4aaf5bbc05fc90e9138c6fed385bc6ffa7b0b8

Use SVE for double shufti.

Change-Id: I09e0d57bb8a2f05b613f6225dea79ae823136268

Use SVE for single shufti.

Change-Id: Ic76940c5bb9b81a1c45d39e9ca396a158c50a7dc

Use SVE2 for counting miracles.

Change-Id: I048dc182e5f4e726b847b3285ffafef4f538e550

Replace USE_ARM_SVE with HAVE_SVE.

Change-Id: I469efaac197cba93201f2ca6eca78ca61be3054d

Add Licence to state_compress and bitutils.

Change-Id: I958daf82e5aef5bd306424dcfa7812382b266d65

Implement new Vermicelli16 acceleration functions using SVE2.

The scheme utilises the MATCH and NMATCH instructions to
scan for 16 characters at the same rate as vermicelli
scans for one.

Change-Id: Ie2cef904c56651e6108593c668e9b65bc001a886

Add SVE2 support for dvermicelli

Change-Id: I056ef15e162ab6fb1f78964321ce893f4096367e

add arm rshift128/rshift128

fix failing corner case, add pshufb_maskz()

use STL make_unique, remove wrapper header, breaks C++17 compilation

change C/C++ standard used to C17/C++17

remove low4bits from the arguments, fix cases that mostly affect loading large (64) vectors and falling out of bounds

fix loadu_maskz, add {l,r}shift128_var(), tab fixes

convert to for loops

minor fixes, add 2 constructors from half size vectors

fix lastMatch<64>

provide an {l,r}shift128_var() to fix immediate value build failure in loadu_maskz

fix arm loadu_maskz()

add arm rshift128/rshift128

use rshift128() instead of vector-wide right shift

add {l,r}shift128()+tests, rename printv_u64() to print64()

Use SVE2 Bitperm's bdep instruction in bitutils and state_compress

Specifically for pdep64, expand32, and expand64 in bitutils,
as well as all of the loadcompressed functions used in
state_compress.

Change-Id: I92851bd12481dbee6a7e344df0890c4901b56d01

Fix CROSS_COMPILE_AARCH64 for SVE issues.

Change-Id: I7b9ba3ccb754d96eee22ca01714c783dae1e4956

Add SVE2 support for vermicelli

Change-Id: Ia025de53521fbaefe5fb1e4425aaf75c7d80a14e

Remove possibly undefined behaviour from Noodle.

Change-Id: I9a7997cea6a48927cb02b00c5dba5009bbf83850

Remove first check from scanDouble Noodle.

Change-Id: I00eabb3cb06ef6a2060df52c26fa8591907a2711

Equal mask test fixed with random numbers

Supervector test fixes

SuperVector AVX512 implementations

SuperVector unit tests for AVX2 and AVX512  added

really fix lshift for avx2

disable OPTIMISE by default

fix truffle SIMD for S>16 as well

add AVX2 specializations

lots of fixes to AVX2 implementation

convert print helper functions to class methods

tiny change in vector initialization

fix last failing Shufti/Truffle tests

fix arm SuperVector implementation

fix rtruffle, was failing Lbr and a few ReverseTruffle tests

fix x86 debug alignr

move firstMatch, lastMatch to own header in util

minor fixes

compilation fixes for debug mode

fix arm implementation of alignr()

harmonise syntax of x86 SuperVector impl.cpp like arm, fix alignr, define printv_* functions when on debug mode only

style fixes

removed obsolete file

rename supervector class header, use dup_*() functions names instead of set1_*(), minor fixes

handle GNUCC_ARCH on non-x86 properly

Truffle simd vectorized

Fix error in initial noodle double final call.

Change-Id: Ie044988f183b47e0b2f1eed3b4bd23de75c3117d

syntax fixes

nits

fix typo

fix unit tests, and resp. ARM SuperVector methods based on those unit tests, add print functions for SuperVector

Supervector Unit Tests

Add SVE2 support for noodle

Change-Id: Iacb7d1f164bdd0ba50e2e13d26fe548cf9b45a6a

add missing ARM SuperVector methods, some tests still fail, WIP

disable SuperVector unit tests for now, until ARM support is included

rename arm impl.hpp to impl.cpp, add operator|() to SuperVector class

refactor shufti algorithm to use SuperVector class, WIP

Add SVE, SVE2, and SVE2_BITPERM as targets

Change-Id: I5231e2eb0a31708a16c853dc83ea48db32e0b0a5

Enable cross compilation to aarch64

Change-Id: Iafc8ac60926f5286990ce63a4ff4f8b6a7c46bef

SuperVector unit tests

unit tests for supervector

add more functions, move defines here, enable inlining of template specializations only when running optimized code

fix compilation on C++

simplify function

move definitions elsewhere

move SuperVector versions of noodleEngine scan functions to _simd.hpp file

add arm support for the new SuperVector class

simplify scanSingleMain() and scanDoubleMain()

delete separate implementations

add C++ template SIMD library (WIP)

add generic SIMD implementation

rename project, change to noodle_engine.cpp

convert to C++

revert to push_back()

add global definitions for CHUNKSIZE/VECTORSIZE, define HAVE_AVX512* only when BUILD_AVX512 is also enabled

fix typo

replace push_back by emplace_back where possible

use -O3 for C++ code as well, makes a difference

merge with master

minor optimizations

prefetch works best when addresses are 64-byte aligned

Revert "replace long macro and switch statement with function pointer array and branchless execution"

This reverts commit cc9dfed2494d709aac79051c29adb0a563903ba9.

replace long macro and switch statement with function pointer array and branchless execution

optimise case handling

simplify and make scanSingle*()/scanDouble*() more uniform

optimize caseMask handling